tag:blogger.com,1999:blog-27669166422611817602024-02-06T20:37:53.243-08:00Coretan Akademik HIMKASuatu blog yang menuliskan beberapa hal yang berkaitan dengan informasi seputar dunia perkuliahanakademik_HIMKAhttp://www.blogger.com/profile/00366070787523409197noreply@blogger.comBlogger39125tag:blogger.com,1999:blog-2766916642261181760.post-27909103724030355742012-11-03T08:15:00.003-07:002012-11-03T08:15:49.122-07:00Merubah si Macan Kertas menjadi Mac Gyver<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif; font-size: 15px; line-height: 20px; text-align: justify;"><span style="font-size: medium;"><b>Apa yang harus dilakukan di kelas mengajar atau melatih ? Bagaimana cara merubah macan kertas menjadi <a href="http://en.wikipedia.org/wiki/MacGyver" wrc_done="true">Mac Gyver ?</a> </b></span></span><br style="font-family: Arial, Tahoma, Helvetica, FreeSans, sans-serif; font-size: 15px; line-height: 20px; text-align: justify;" /><span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif; font-size: 15px; line-height: 20px; text-align: justify;"><span style="font-size: medium;"><br /></span><span style="font-size: medium;">Alkisah ada seorang murid yang ingin belajar ilmu beladiri, kemudian masuklah dia ke suatu kelas ilmu beladiri modern, kelas ilmu beladiri modern ini diajarkan oleh seorang profesor ahli ilmu beladiri modern, profesor ini sudah banyak melakukan penelitian ke hampir semua ilmu beladiri yang ada didunia. Di dalam kelas murid ini diajarkan beberapa teori tentang ilmu beladiri, jenis-jenis ilmu beladiri ditinjau dari segi kelebihan dan kekurangan, tidak lupa dijelaskan juga assal usul atau sejarah ilmu beladiri. Hampir semua ilmu beladiri di jelasskan didalam kelas. Di akhir semester ujian dilaksanakan, seperti biasa profesor memberikan soal kepada murid untuk dijelaskan, dimulai dari sejarah ilmu beladiri, jenis ilmu beladiri hinggi kelebihan dan kekurangan ilmu beladiri. Sebagian besar murid yang rajin belajar lulus ujian ini dan mendapatkan nilai A. Yang menjadi pertanyaan, apakah dengan belajar seperti ini seorang murid menjadi ahli beladiri, jawabannya sudah jelas diatas kertas "ya" tapi dilapangan ..."tidak".</span></span></span><br />
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif; font-size: 15px; line-height: 20px; text-align: justify;"><span style="font-size: medium;"><br /></span></span></span>
<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEiQ02KwgAJiMSW8bC5VqoNrKGOkgWDHg5bhGDaSB982Lza2_Q_M-IcBsmL2EOQKX4hFUHbOzjTrSdHTSis96zFTFPFJGl_6tTNdN9UYbF3F2VLDYBoxPnu05wY26DDdPwQwyIjLCuAvusoV/s1600/beladiri.jpg" imageanchor="1" style="margin-left: 1em; margin-right: 1em;"><img border="0" src="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEiQ02KwgAJiMSW8bC5VqoNrKGOkgWDHg5bhGDaSB982Lza2_Q_M-IcBsmL2EOQKX4hFUHbOzjTrSdHTSis96zFTFPFJGl_6tTNdN9UYbF3F2VLDYBoxPnu05wY26DDdPwQwyIjLCuAvusoV/s1600/beladiri.jpg" /></a></div>
<span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif; font-size: 15px; line-height: 20px; text-align: justify;"><span style="background-color: white; font-size: medium;"><br /></span></span>
<br />
<div style="font-family: Arial, Tahoma, Helvetica, FreeSans, sans-serif; font-size: 15px; line-height: 20px; text-align: justify;">
<span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: medium;">Mengutip pernyataannya Prof. Rhenald Kasali dalam suatu tulisan " <a href="http://fghprima.blogspot.com/2012/08/keluar-dari-kecakapan-ujian-setiap-kali.html">Keluar dari kecakapan ujian</a>"</span></span> </div>
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif; font-size: 15px; line-height: 20px;"><span style="font-size: medium;"><br /></span></span><span style="font-family: Arial, Tahoma, Helvetica, FreeSans, sans-serif; font-size: 15px; line-height: 20px;"></span></span><div style="font-family: Arial, Tahoma, Helvetica, FreeSans, sans-serif; font-size: 15px; line-height: 20px; text-align: justify;">
<span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="background-color: white; font-size: medium;"><i>" Untuk memberikan ilustrasi, saya ceritakan kembali pengalaman saya (Rhenald Kasali, Red) saat mengajar mata kuliah “International Marketing”. Mata kuliah ini diberikan kepada mahasiswa senior di Program S1 dan sebagai prasyaratnya mereka harus sudah lulus “Dasar-Dasar Marketing”. Suatu ketika saya iseng menanyakan berapa mahasiswa yang mendapat nilai A di kelas marketing yang diambil satu dua semester sebelumnya, dan saya minta mereka maju kedepan. Dan sungguh saya tak percaya bagaimana anak-anak yang kurang bergaul, kurang pandai mengekspresikan pikiran, bahkan dikenal sebagai anak yang berbicara sinis, dan berpenampilan tidak “marketable” dari kacamata rekan-rekannya, bisa diberi nilai A.<br /><br />Begitulah “</i> <i>the power of exam merit”. Mereka mendapatkan nilai “A” dalam transkrip nilai karena bertemu dengan pengajar-pengajar yang hanya berorientasi pada hasil ujian, bukan pendidik yang mengubah cara mereka berpikir. Di atas kertas pada saat ujian mereka benar-benar cerdas, hafalannya bagus, analisisnya ok, tetapi mengapa untuk hal sederhana saja tak mampu mengaplikasikan pengetahuannya?...."</i></span></span></div>
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif; font-size: 15px; line-height: 20px;"><span style="font-size: medium;"><br /></span></span><span style="font-family: Arial, Tahoma, Helvetica, FreeSans, sans-serif; font-size: 15px; line-height: 20px;"></span></span><div style="font-family: Arial, Tahoma, Helvetica, FreeSans, sans-serif; font-size: 15px; line-height: 20px; text-align: justify;">
<span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="background-color: white; font-size: medium;">Ilustrasi yang lain, misalnya pada pembelajaran "Pendidikan Moral Pancasila" di jelaskan<i> </i>mengenai prilaku yang bermoral dengan segala definisinya dan contohnya, atau pendidikan anti korupsi yang membahas nilai-nilai antikorupsi seperti keadilan, keberanian, dan kepedulian. Bila pola pendidikan diberikan dengan cara yang sama, sudah tentu semua siswa yang memiliki hafalan bagus akan mendapat nilai A, tidak perduli dia orangnya jujur, bermoral atau tidak.</span></span></div>
<div style="font-family: Arial, Tahoma, Helvetica, FreeSans, sans-serif; font-size: 15px; line-height: 20px; text-align: justify;">
<span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="background-color: white; font-size: medium;"><br /></span></span></div>
<div style="font-family: Arial, Tahoma, Helvetica, FreeSans, sans-serif; font-size: 15px; line-height: 20px; text-align: justify;">
<span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="background-color: white; font-size: medium;">Kalau demikian cara kita mendidik anak-anak ini, maka bisa di bayangkan mengapa pengusaha mengeluh lulusan-lulusan kita tidak siap pakai, dan mengapa banyak profesi lulusan yang tidak sesuai dengan jurusan ketika sekolah. Anak-anak mengeluh sekolahnya susah karena mereka tidak bisa mengekspresikan bakat yang mereka cintai. Guru guru mengeluh karena murid tidak mempersiapkan belajar di rumah dengan baik. dan tentu saja di masa depan, dari sistem pendidikan seperti ini hanya akan dilahirkan sarjana-sarjana kertas, atau ilmuwan-ilmuwan <i>paper</i>, yang hanya asyik membuat makalah, bukan <i>impact</i>!. Muridnya asik mengejar nilai, gurunya asik mengejar kum untuk kenaikan pangkat.</span></span></div>
<div style="font-family: Arial, Tahoma, Helvetica, FreeSans, sans-serif; font-size: 15px; line-height: 20px; text-align: justify;">
<span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="background-color: white; font-size: medium;"><br /></span></span></div>
<div style="font-family: Arial, Tahoma, Helvetica, FreeSans, sans-serif; font-size: 15px; line-height: 20px; text-align: justify;">
<span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="background-color: white; font-size: medium;"><b>Pembelajaran berpusat pada murid bukan pada guru.</b></span></span></div>
<div style="font-family: Arial, Tahoma, Helvetica, FreeSans, sans-serif; font-size: 15px; line-height: 20px; text-align: justify;">
<span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="background-color: white; font-size: medium;"><br /></span></span></div>
<div style="font-family: Arial, Tahoma, Helvetica, FreeSans, sans-serif; font-size: 15px; line-height: 20px; text-align: justify;">
<span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="background-color: white; font-size: medium;">Mengutip pernyataanya Prof. Rhenald kasali dalam tulisan "<a href="http://fghprima.blogspot.com/2012/08/belajar-non-formal.html">Belajar Non Formal</a>" </span></span></div>
<div style="font-family: Arial, Tahoma, Helvetica, FreeSans, sans-serif; font-size: 15px; line-height: 20px; text-align: justify;">
<span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="background-color: white; font-size: medium;"><br /></span></span></div>
<div style="font-family: Arial, Tahoma, Helvetica, FreeSans, sans-serif; font-size: 15px; line-height: 20px; text-align: justify;">
<span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="background-color: white; font-size: medium;"><i>"Tahukan Anda bahwa ilmu yang kita pelajari di kampus cepat tertinggal? Ilmu pengetahuan berkembang sangat pesat dan adu kejar antara dosen dan para penjelajah pengetahuan terus terjadi. Sebagian besar ilmu itu ada di dunia maya, dan sebagian lagi ada di tangan orang-orang hebat. Saya pikir inilah saatnya bagi para social entrepreneur untuk membangun komunitas-komunitas pembelajaran yang bergengsi tinggi dan memberi impak besar. Brandnya harus kuat agar para remaja tidak patah semangat, namun ilmunya harus lebih kuat lagi."</i></span></span></div>
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif; font-size: 15px; line-height: 20px;"><span style="font-size: medium;"><br /></span><span style="font-size: medium;"></span></span><span style="font-family: Arial, Tahoma, Helvetica, FreeSans, sans-serif; font-size: 15px; line-height: 20px;"></span></span><div style="font-family: Arial, Tahoma, Helvetica, FreeSans, sans-serif; font-size: 15px; line-height: 20px; text-align: justify;">
<span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="background-color: white; font-size: medium;">Pola pembelajaran yang ada saat ini, dimana seorang guru membuat slide kemudian di jelaskan didepan kelas, tugas murid adalah mendengarkan, memahami dan menghafalkan apa yang ada dalam slide yang dibuat oleh guru. Pengalaman pribadi saya dalam mengamati cara belajar mahasiswa adalah, hanya dengan menghafal apa yang ada dalam slide dan berlatih mengerjakan soal, seorang mahasiswa bisa mendapatkan nilai A, mengapa demikian, karena soal yang diberikan tidak akan jauh-jauh dari slide yang dibuat oleh guru. Akibatnya ilmu siswa hanya terbatas pada slide yang diberikan oleh guru, padahal ilmu yang ada dalam slide masih sama dengan ilmu 10 tahun yang lalu ketika gurunya masih sekolah.</span></span></div>
<div style="font-family: Arial, Tahoma, Helvetica, FreeSans, sans-serif; font-size: 15px; line-height: 20px; text-align: justify;">
<span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="background-color: white; font-size: medium;"><br /></span></span></div>
<div style="font-family: Arial, Tahoma, Helvetica, FreeSans, sans-serif; font-size: 15px; line-height: 20px; text-align: justify;">
<span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="background-color: white; font-size: medium;">Mengutip tulisan Prof A.A Karim dari university sains malaysia dalam tulisan "<a href="http://onestoplearning.blogspot.com/2011/01/integrating-technology-into-classroom.html">No place for chalk and board "</a> dan "<a href="http://onestoplearning.blogspot.com/2011/01/from-teaching-to-learning-paradigm.html">From Teaching to Learning Paradig</a>" didalam blognya terdapat kutipan seperti ini </span></span></div>
<div style="font-family: Arial, Tahoma, Helvetica, FreeSans, sans-serif; font-size: 15px; line-height: 20px; text-align: justify;">
<span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="background-color: white; font-size: medium;"><br /></span></span></div>
<div style="font-family: Arial, Tahoma, Helvetica, FreeSans, sans-serif; font-size: 15px; line-height: 20px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: medium;">"<i>If we teach today's students as we taught yesterday's, we rob them of tomorrow</i>"</span></span><br /><span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: medium;">-- John Dewey.</span></span></span></div>
<div style="font-family: Arial, Tahoma, Helvetica, FreeSans, sans-serif; font-size: 15px; line-height: 20px; text-align: justify;">
<span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="background-color: white; font-size: medium;"><br /></span></span></div>
<div style="font-family: Arial, Tahoma, Helvetica, FreeSans, sans-serif; font-size: 15px; line-height: 20px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: medium;"> "<i>I cannot teach anybody anything; I can only make them think</i>" – Socrates</span></span><br /><span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: medium;"><br /></span><span style="font-size: medium;">"<i>I never teach my pupils; I only attempt to provide the conditions in which they can learn</i>" – A. Einstein</span></span></span></div>
<div style="font-family: Arial, Tahoma, Helvetica, FreeSans, sans-serif; font-size: 15px; line-height: 20px; text-align: justify;">
<span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="background-color: white; font-size: medium;"><br /></span></span></div>
<div style="font-family: Arial, Tahoma, Helvetica, FreeSans, sans-serif; font-size: 15px; line-height: 20px; text-align: justify;">
<div class="separator" style="clear: both; text-align: left;">
<span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="background-color: white; font-size: medium;"><b>Kurikulum berbasis kearifan lokal (Sumber daya alam lokal)</b></span></span></div>
<div class="separator" style="clear: both; text-align: left;">
<span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="background-color: white; font-size: medium;"><br /></span></span></div>
<div class="separator" style="clear: both;">
<span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="background-color: white; font-size: medium;">Beberapa waktu yang lalu saya mengunjungi sebuah sekolah di daerah pegunungan di sumatra utara, karena bidang saya kimia, saya bertanya pada salah satu murid, materi apa yang dipelajari pada mata pelajaran kimia. Murid itu menjelaskan sambil menunjukan sebuah buku "Kimia disekitar kita", materi inilah yang dipelajari. Dari judul bukunya cukup menarik, kimia disekitar kita, namun sayang kita yang mana, kalau kata bahasa anak muda sekarang " elu kali gua kagak". Sayang sekali kalau di sekitar kitanya disamakan dari seluruh penjuru tanah air, padahal sudah tentu wilayah pedesaan, wilayah pantai, wilayah industri dan perkotaan punya masalah yang berbeda-beda. Kebetulah daerah yang saya kunjungi adalah wilayah perkebunan kopi, cengkeh, dan hutan, namun sayang didalam ilmu kimia yang di pelajari tidak diajarkan metode ekstrak yang berhubungan dengan kopi dan cengkeh dan tidak ada pula pelajaran yang menjelaskan kalau dihutan bisa saja ditemukan tanaman sumber minyak gaharu, yang harga minyak kualitas rendahnya saja bisa mencapai <a href="http://indonetwork.co.id/DSPessence/2132343/minyak-gaharu-buaya.htm">Rp</a> 2jt perliternya. Seandainya semua materi pelajaran disesuaikan dengan kondisi wilayah masing-masing, tentu siswa akan lebih semangat lagi untuk mempelajarinya karena ilmu yang diperoleh disekolah dapat langsung dimanfaatkan dalam kehidupan sehari-hari. Apabila demikian lulusan SMA pun sudah dapat berkarya diwilayahnya masing-masing, tidak perlu lagi terjadi orang-orang desa pergi kekota supaya ilmunya dapat diterapkan, karena didesa masing-masing ilmunya sudah dapat diterapkan. Lalu bagaimana dengan UAN, beberapa guru mengeluh karena mereka dikejar target agar siswanya bisa lulus UAN. Mengutip pernyataan Prof. Renald Kasali dalam tulisan "<a href="http://jurnalkependidikan.blogspot.com/2012/08/keluar-dari-kecakapan-ujian.html">Keluar dari kecakapan ujian</a> " yang isinya :</span></span></div>
<div class="separator" style="clear: both;">
<span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="background-color: white; font-size: medium;"><br /></span></span></div>
<div class="separator" style="clear: both;">
<span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="background-color: white; font-size: medium;">"<i>Mengapa ujian nasional menjadi segala-galanya dalam hidup ini? Apakah tidak ada cara lain untuk membuka pintu masa depan anak selain ujian? Saya (Rhenald Kasali, red) ingin mengajak bangsa ini keluar dari metode pendidikan cara pabrikan yang menghasilkan “produk-produk” yang standar, yang seakan-akan anak adalah “output” hasil produksi. Kita seperti sedang melewati sebuah area "ban berjalan" dengan seorang manajer Jepang, yang mengawasi ada-tidaknya produk yang cacat (defect), di luar standar. Mereka yang berada di luar standar itu dalam pendidikan kita sebut “berbakat khusus” (special talent), namun di pabrik kita sebut “produk gagal”. Jelajahilah mesin pencari Google dan ketiklah kata “special talent”, maka Anda akan menemukan anak-anak seperti inilah yang ditawari beasiswa. Namun apa yang kita lakukan dengan anak-anak itu di sini?"</i></span></span></div>
<div class="separator" style="clear: both;">
<span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="background-color: white; font-size: medium;"><br /></span></span></div>
<div class="separator" style="clear: both;">
<span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="background-color: white; font-size: medium;">Beberapa materi pelajaran yang dapat di UAN adalah materi yang isinya sama di seluruh indonesia, seperti Matematika, B. Indonesia, B. Inggris, dan Agama, sedangkan untuk materi yang lain diarahkan berbasis kearifan lokal. </span></span></div>
<div class="separator" style="clear: both;">
<span style="background-color: white;"><br /></span></div>
<div class="separator" style="clear: both;">
<span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="background-color: white; font-size: medium;"><i></i></span></span></div>
<div class="separator" style="clear: both;">
<b><span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="background-color: white; font-size: medium;">Berapa banyak pelajaran yang harus diwajibkan di sekolah ?</span></span></b></div>
<div class="separator" style="clear: both;">
<span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="background-color: white; font-size: medium;"><br /></span></span></div>
<div class="separator" style="clear: both;">
<span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="background-color: white; font-size: medium;">Kadang saya terheran heran melihat anak SD sekarang sekolah dari pagi hingga sore<i>, </i>kapan mereka bisa bermain. Benarkan pendidikan ini semakin berat semakin hebat ?. Mengutip pernyataannya Prof. Renald kasali yang berjudul "<a href="http://jurnalkependidikan.blogspot.com/2012/08/pendidikan-benarkah-semakin-berat.html">Pendidikan : Benarkah semakit berat semakin hebat."</a></span></span></div>
<div class="separator" style="clear: both;">
<span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="background-color: white; font-size: medium;"><br /></span></span></div>
<div class="separator" style="clear: both;">
<span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="background-color: white; font-size: medium;">"<i>Dulu kita hanya belajar sembilan mata pelajaran sehingga masih banyak waktu untuk bermain. Bagaimana anak-anak kita ?</i><i>. Bukannya dikurangi, tetapi semakin hari yang dipaksakan masuk ke dalam otak anak-anak kita semakin banyak. Sewaktu saya menulis "<a href="http://jurnalkependidikan.blogspot.com/2012/08/sekolah-untuk-apa.html">Sekolah Untuk Apa</a>?" minggu lalu, saya menyebut anak saya di kelas sepuluh diharuskan menuntaskan 16 mata pelajaran, seorang ibu menyurati saya karena anaknya yang belajar di MI diwajibkan tuntas 23 mata pelajaran. Sementara di New Zealand dan banyak negara maju anak-anak sekolah hanya mengambil 6 mata pelajaran. Ketika mereka menganut spirit "The Power of Simplicity", kita justru tenggelam dalam spirit benang kusut, "kalau terlalu mudah tidak akan melahirkan kehebatan".<span class="Apple-style-span" style="line-height: 16px;"> Bukan hanya itu, di banyak negara selain dirampingkan, mata ajar wajib juga dibatasi hanya dua, selebihnya dijadikan pilihan yang dikaitkan dengan karier masa depan. Bagaimana di sini ? "</span></i></span></span></div>
<div class="separator" style="clear: both;">
<span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="background-color: white; font-size: medium;"><br /></span></span></div>
<div class="separator" style="clear: both;">
<span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: medium;"><span class="Apple-style-span" style="background-color: white; line-height: 16px;">Amat disayangkan kalau waktu muda, anak-anak kita dihabiskan untuk mempelajari pendidikan disekolah yang materinya jauh panggang dari pada api. Anak-anak menjadi jenuh untuk belajar, ilmu yang diperolehnya pun hanya sebatas supaya lulus ujian dan menyelesaikan masalah diatas kertas. Bagaimana dengan nasib anak-anak di desa dimana waktu anak-anak itu begitu berharga untuk membantu orang tuanya di ladang, sementara ilmu yang diperoleh disekolah tidak satupun yang berhubungan dengan masalah dipedesaan. Akibatnya, tentu saja semua anak di desa setelah lulus, tujuannya adalah kekota, meninggalkan desa mereka yang kaya akan sumber daya alam. Anak-anak desa bingung kalau tetap tinggal di desa, karena itu artinya, ilmu mereka selama sekolah tidak dapat diterapkan. Amat disayangkan, padahal kekayaan indonesia terletak di desa, kalau kekayaan alam itu tidak dikelola, wajar saja kalau penduduk desa miskin, penduduk kota juga sama saja.</span></span></span></div>
<div class="separator" style="clear: both;">
<span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="background-color: white; font-size: medium;"><br /></span></span></div>
<div class="separator" style="clear: both;">
<span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: medium;"><span class="Apple-style-span" style="background-color: white; line-height: 16px;">Teringat pernyataan Dosen saya ketika kuliah dulu, kalau beliau menjadi menteri pendidikan, maka yang pertama kali dihapus adalah kurikulum, karena kurikulumlah yang membuat bangsa ini bodoh. Pernyataan ini terus menjadi bahan pemikiran saya hingga saat ini, benarkah seperti ini ?.... Kalau ini benar, amat disayangkan waktu anak-anak muda kita yang sekolah dari pagi hingga sore dari anak-anak hingga remaja, dari sekian banyaknya waktu yang dikeluarkan, dan dari sekian banyaknya biaya yang dikeluarkan, hanya menjadikan anak kita macan kertas, tanpa bisa berkarya menyelesaikan permasalahan bangsa, dan hanya bisa menjual kekayaan alam kita atau memberikan kebangsa lain untuk mengelolanya, sedangkan tuan rumahnya atau rakyat indonesia hanya bisa menjadi karyawan atau buruh.</span></span></span></div>
<div class="separator" style="clear: both;">
<span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: medium;"><span class="Apple-style-span" style="background-color: white; line-height: 16px;"><br /></span></span></span></div>
<div class="separator" style="clear: both;">
<span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: medium;"><span class="Apple-style-span" style="background-color: white; line-height: 16px;">Wajar kalau sebagian besar bangsa ini mengejar status, mengejar jabatan, mengejar kenaikan pangkat, mengejar SK, karena dengan secarik kertas jabatan, kita akan mendapatkan penghasilan yang luar biasa, usaha sebesarnya dilakukan untuk mendapatkan jabatan, jabatan bukan dianggap sebagai amanah, namun jabatan dianggap sebagai lahan basah. Berkarya ataupun tidak berkarya, asal sudah mendapatkan jabatan penghasilannya sama saja. Beginilah akibat dari pendidikan macan kertas, setelah bekerja pun targetnya masih kertas.</span></span></span></div>
<div class="separator" style="clear: both;">
<span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="background-color: white; font-size: medium;"><br /></span></span></div>
<div class="separator" style="clear: both;">
<span style="font-family: Times, 'Times New Roman', serif;"><span style="font-size: medium;"><span class="Apple-style-span" style="background-color: white; line-height: 16px;">Penulis berharap, kelak pendidikan di Indonesia bisa lebih fokus lagi terhadap pengelolaan sumber daya alam di masing-masing wilayah, sekolah-sekolah berbasis kurikulum yang menajamkan pengelolaan sumber daya alam disekitarnya , lulusan-lulusan sarjana dapat lebih fokus lagi mengembangkan sumber daya alamnya di wilayah masing-masing. Penulis berharap rakyat indonesia bisa lebih sejahtera lagi, menikmati kekayaan alam indonesia yang melimpah dari sabang sampai merouke.</span></span></span></div>
</div>
<br />
<br />
sumber : <a href="http://katalispendidikan.blogspot.com/">http://katalispendidikan.blogspot.com/</a>akademik_HIMKAhttp://www.blogger.com/profile/00366070787523409197noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-2766916642261181760.post-77410297095711002662012-11-03T08:07:00.003-07:002012-11-03T08:07:34.344-07:00Instrumentasi AAS<br />
<div style="background-color: white; border: 0px; color: #666666; font-family: 'Lucida Grande', Arial, 'Lucida Sans Unicode', sans-serif; font-size: 13px; line-height: 19px; margin-bottom: 1.5em; outline: 0px; padding: 0px; text-align: justify; vertical-align: baseline;">
Atomic Absorbtion Spectrofotometer (AAS) atau Spektrometri Serapan Atom (SSA) adalah metode pengukuran spektrum yang berkaitan dengan serapan dan emisi atom. Bila suatu molekul mempunyai bentuk spektra pita, maka suatu atom mempunyai spektra garis. Atom-atom yang terlibat dalam metode pengukuran spektrometri atomik haruslah atom-atom bebas yang garis spektranya dapat diamati. Pengamatan garis spektra yang spesifik ini dapat digunakan untuk analisis unsur baik secara kualitatif maupun kuantitatif.</div>
<div style="background-color: white; border: 0px; color: #666666; font-family: 'Lucida Grande', Arial, 'Lucida Sans Unicode', sans-serif; font-size: 13px; line-height: 19px; margin-bottom: 1.5em; outline: 0px; padding: 0px; text-align: justify; vertical-align: baseline;">
Absorbsi (serapan) atom adalah suatu proses penyerapan bagian sinar oleh atom-atom bebas pada panjang gelombang (l) tertentu dari atom itu sendiri sehingga konsentrasi suatu logam dapat ditentukan. Karena absorbansi sebanding dengan konsentrasi suatu analit, maka metode ini dapat digunakan untuk sistem pengukuran atau analisis kuantitatif.</div>
<div style="background-color: white; border: 0px; color: #666666; font-family: 'Lucida Grande', Arial, 'Lucida Sans Unicode', sans-serif; font-size: 13px; line-height: 19px; margin-bottom: 1.5em; outline: 0px; padding: 0px; text-align: justify; vertical-align: baseline;">
Spektrometri Serapan Atom (SSA) dalam kimia analitik dapat diartikan sebagai suatu teknik untuk menentukan konsentrasi unsue logam tertentu dalam suatu cuplikan. Teknik pengukuran ini dapat digunakan untuk menganalisis konsentrasi lebih dari 62 jenis unsur logam.</div>
<div style="background-color: white; border: 0px; color: #666666; font-family: 'Lucida Grande', Arial, 'Lucida Sans Unicode', sans-serif; font-size: 13px; line-height: 19px; margin-bottom: 1.5em; outline: 0px; padding: 0px; text-align: justify; vertical-align: baseline;">
Teknik Spektrometri Serapan Atom (SSA) dikembangkan oleh suatu tim peneliti kimia Australia pada tahun 1950-an, yang dipimpin oleh Alan Walsh, di CSIRO <em style="border: 0px; font-family: inherit; margin: 0px; outline: 0px; padding: 0px; vertical-align: baseline;">(Commonwealth Science and Industry Research Organization)</em> bagian kimia fisik di Melbourne, Australia.</div>
<div style="background-color: white; border: 0px; color: #666666; font-family: 'Lucida Grande', Arial, 'Lucida Sans Unicode', sans-serif; font-size: 13px; line-height: 19px; margin-bottom: 1.5em; outline: 0px; padding: 0px; text-align: justify; vertical-align: baseline;">
Unsur-unsur dalam cuplikan diidentifikasi dengan sensitivitas dan limit deteksi pada teknik pengukuran ini dapat mencapai < 1 mg/L (1 ppm) bila menggunakan lampu nyala biasa dan dapat dicapai sampai 0,1 ppm dengan menggunakan prosedur SSA yang lebih canggih.</div>
<div style="background-color: white; border: 0px; color: #666666; font-family: 'Lucida Grande', Arial, 'Lucida Sans Unicode', sans-serif; font-size: 13px; line-height: 19px; margin-bottom: 1.5em; outline: 0px; padding: 0px; text-align: justify; vertical-align: baseline;">
Dalam spektroskopi atomik, faktor-faktor yang dapat menyebabkan pelebaran garis spektra merupakan suatu problem dalam sistem analisis metode ini. Dua hal yang paling sering menimbulkan problem ini adalah pelebaran efek Doppler <em style="border: 0px; font-family: inherit; margin: 0px; outline: 0px; padding: 0px; vertical-align: baseline;">(Doppler Boardening)</em> dan pelebaran tekanan <em style="border: 0px; font-family: inherit; margin: 0px; outline: 0px; padding: 0px; vertical-align: baseline;">(Pressure Boardening).</em></div>
<div style="background-color: white; border: 0px; color: #666666; font-family: 'Lucida Grande', Arial, 'Lucida Sans Unicode', sans-serif; font-size: 13px; line-height: 19px; margin-bottom: 1.5em; outline: 0px; padding: 0px; text-align: justify; vertical-align: baseline;">
<em style="border: 0px; font-family: inherit; margin: 0px; outline: 0px; padding: 0px; vertical-align: baseline;"><br /></em></div>
<div style="background-color: white; border: 0px; color: #666666; font-family: 'Lucida Grande', Arial, 'Lucida Sans Unicode', sans-serif; font-size: 13px; line-height: 19px; margin-bottom: 1.5em; outline: 0px; padding: 0px; vertical-align: baseline;">
<em style="border: 0px; font-family: inherit; margin: 0px; outline: 0px; padding: 0px; vertical-align: baseline;"></em></div>
<div style="border: 0px; font-style: normal; margin-bottom: 1.5em; outline: 0px; padding: 0px; text-align: justify; vertical-align: baseline;">
<em style="border: 0px; font-family: inherit; margin: 0px; outline: 0px; padding: 0px; vertical-align: baseline;"><strong style="border: 0px; font-family: inherit; font-style: inherit; margin: 0px; outline: 0px; padding: 0px; vertical-align: baseline;">Instrumentasi</strong></em></div>
<div style="border: 0px; font-style: normal; margin-bottom: 1.5em; outline: 0px; padding: 0px; text-align: justify; vertical-align: baseline;">
<em style="border: 0px; font-family: inherit; margin: 0px; outline: 0px; padding: 0px; vertical-align: baseline;">Suatu alat absorpsi atom terjadi dari komponen-komponen dasar yang sama seperti spetrofotometer biasa, jadi mengandung : sumber radiasi, monokromator, tempat cuplikan (dalam hal ini nyala), detector dan indicator penguatan (amplifier). Spektrofotometer absorpsi atom ada yang <em style="border: 0px; font-family: inherit; margin: 0px; outline: 0px; padding: 0px; vertical-align: baseline;">single-beam</em> dan ada pula yang <em style="border: 0px; font-family: inherit; margin: 0px; outline: 0px; padding: 0px; vertical-align: baseline;">double-beam</em></em></div>
<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<em style="border: 0px; font-family: inherit; margin: 0px; outline: 0px; padding: 0px; vertical-align: baseline;"><a href="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEggBJ6hdauexeVtzf63TvnajtkDivO6NjpPKs36ADmVfWAV0uMC2CSTrKVjBdzcsQW0HSew8inUFScfTUXcDf9ypc1oY8Vl_XvneLXLIc1RJjovWTTU-uwEg4YjKZOTn5H8omZFhM-dtE_9/s1600/AAS.jpg" imageanchor="1" style="margin-left: 1em; margin-right: 1em;"><img border="0" height="231" src="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEggBJ6hdauexeVtzf63TvnajtkDivO6NjpPKs36ADmVfWAV0uMC2CSTrKVjBdzcsQW0HSew8inUFScfTUXcDf9ypc1oY8Vl_XvneLXLIc1RJjovWTTU-uwEg4YjKZOTn5H8omZFhM-dtE_9/s320/AAS.jpg" width="320" /></a></em></div>
<div style="border: 0px; font-style: normal; margin-bottom: 1.5em; outline: 0px; padding: 0px; vertical-align: baseline;">
<em style="border: 0px; font-family: inherit; margin: 0px; outline: 0px; padding: 0px; vertical-align: baseline;"><br /></em></div>
<br />
akademik_HIMKAhttp://www.blogger.com/profile/00366070787523409197noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-2766916642261181760.post-13509293666229361312012-01-03T16:44:00.000-08:002012-01-03T16:44:30.911-08:00konten nomer 4 chemoffice<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEjUN1yL5EG1Y4isgv_iHN8Hf9WJt-cdbv1fQ6sqNoIIY_IsgxO5OqsXbhuYcQEPkRYTtpSdcidXcy3sA6QnxjjjZvCkNIjluzvjHU_3er_JdmT_1X_ktJMQzJ5STaks8U5hi057eLwquyN_/s1600/box_chemoffice_200.gif" imageanchor="1" style="margin-left: 1em; margin-right: 1em;"><img border="0" src="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEjUN1yL5EG1Y4isgv_iHN8Hf9WJt-cdbv1fQ6sqNoIIY_IsgxO5OqsXbhuYcQEPkRYTtpSdcidXcy3sA6QnxjjjZvCkNIjluzvjHU_3er_JdmT_1X_ktJMQzJ5STaks8U5hi057eLwquyN_/s1600/box_chemoffice_200.gif" /></a></div>
Chem office adalah sebuah program yang bisa membuat gambar-gambar zat
kimia dapat berupa molekul sederhana maupun kompleks. tidak cuma itu
tapi bisa belajar cara pergerakan molekul dan perputaran ikatan dari aplikasi 3D
nya.<br />Apalagi bisa diatur dengan kecepatan perputarannya dan bisa
mengetahui stabil d kecepatan berapa. Jika kamu belajar Adsorpsi mungkin
itu bisa jadi pembelajaran yang bermanfaat bagi kita semua.<br />Dan bisa mengetahui rumus keseimbangannya.<br />
Perangkat lunak ini terdiri dari <span class="" id="result_box" lang="id"><span class="hps">ChemDraw</span><span class="">,</span> <span class="hps">Chem3D</span><span class="">,</span> <span class="hps">ChemFinder</span> <span class="hps">dan</span> <span class="hps">ChemACX</span> <span class="hps">untuk para ahli kimia</span><span>,</span> <span class="hps">BioOffice</span><span>,</span> <span class="hps">bioassay</span><span>,</span> <span class="hps">BioViz</span><span class="">, dan</span> <span class="hps">BioDraw</span> <span class="hps">bagi ahli biologi</span><span>,</span> <span class="hps">dan Inventarisasi</span><span>,</span> <span class="hps">E</span><span class="atn">-</span><span class="">Notebook dan</span> <span class="hps">Indeks</span> <span class="hps">Merck</span> <span class="hps">bagi para ilmuwan</span><span class="">.</span> <span class="hps">software ini tersedia untuk</span><span class="hps"> Microsoft Windows</span><span class="">.</span></span><br />
<br />
<span class="" id="result_box" lang="id"><span class="">Chemoffice ini keren banget loh, salah satu aplikasinya adalah di chemdraw..</span></span><br />
<span class="" id="result_box" lang="id"><span class="">pengen liat kaya gimana oke nya? langsung saja cek ke TKP. hehehe</span></span><br />
<span class="" id="result_box" lang="id"><span class=""><a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2012/01/chemdraw.html" target="_blank">disini</a></span></span><br />
<br />
<span class="" id="result_box" lang="id"><span class="">sumber : http://www.cambridgesoft.com/software/ChemOffice/</span></span><br />
<span class="" id="result_box" lang="id"><span class=""> </span></span>akademik_HIMKAhttp://www.blogger.com/profile/00366070787523409197noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-2766916642261181760.post-61262964532272963162012-01-03T16:42:00.000-08:002012-01-03T16:42:43.822-08:00chemdraw<span class="item-action"><a href="http://www.blogger.com/email-post.g?blogID=5886081417235343348&postID=1745663203843994768" title="Email Post">
</a>
</span>
<br />
<div class="post-body entry-content">
<a href="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEhVtlrY8B3OhRCK6SqQQSwrec7R2uRV36OCfksl9phb6dHAtGBpCScDnOcr_C6nXTtLXIKka3f8Jm8FXZ-WpnN2hYrOHy7ImlNfaFlqgi6Qdc98aegUPeP6lHgs1-23INWzLZuVFPskvz8/s1600/chemoffice+2+dimensi.jpg"><img alt="" border="0" id="BLOGGER_PHOTO_ID_5484065392890113330" src="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEhVtlrY8B3OhRCK6SqQQSwrec7R2uRV36OCfksl9phb6dHAtGBpCScDnOcr_C6nXTtLXIKka3f8Jm8FXZ-WpnN2hYrOHy7ImlNfaFlqgi6Qdc98aegUPeP6lHgs1-23INWzLZuVFPskvz8/s320/chemoffice+2+dimensi.jpg" style="cursor: pointer; display: block; height: 200px; margin: 0px auto 10px; text-align: center; width: 320px;" /></a><br /><a href="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEjZwUnLcc1hQNMh0_PnJ0uiyMHUdC3RKStuDGpuF6Ux3DL67E5d3d3FUB_EC8OHz8Coa4JAid2IPfAG8tbDdshRDfoYTwlQdPND2d-uLJj92fIGRhgoEJWRSRiB0BLz6iAjSRS4by_8VFw/s1600/chemoffice+3+dimensi.jpg"><img alt="" border="0" id="BLOGGER_PHOTO_ID_5484065006503705570" src="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEjZwUnLcc1hQNMh0_PnJ0uiyMHUdC3RKStuDGpuF6Ux3DL67E5d3d3FUB_EC8OHz8Coa4JAid2IPfAG8tbDdshRDfoYTwlQdPND2d-uLJj92fIGRhgoEJWRSRiB0BLz6iAjSRS4by_8VFw/s320/chemoffice+3+dimensi.jpg" style="cursor: pointer; display: block; height: 200px; margin: 0px auto 10px; text-align: center; width: 320px;" /></a><br />ChemDraw
pro versi 8.0 merupakan salah satu program aplikasi dari Chem Office,
untuk menggambar struktur 2D dalam bidang ilmu kimia, terutama kimia
organik, biokimia, dan polimer. Software ini dapat membantu anda dalam
menggambar struktur kimia dengan berbagai fasilitasnya, hanya dengan
mengkliknya, tool tersebut akan bekerja untuk anda.<br /><br />Tool-tool
dalam ChemDraw mewakili berbagai macam bentuk ikatan yang dapat anda
susun menjadi struktur kimia sehingga tidaklah sulit bagi anda untuk
menggambarkan struktur yang kompleks sekalipun, bahkan juga dalam
berbagai bentuk konformasi dan dalam bentuk proyeksi.<br /><br />Struktur-struktur
tertentu yang telah umum dapat digambar secara langsung dengan mengklik
tool, seperti struktur cincin benzena, siklopentana, sikloheksana dan
senyawa siklis yang lain. Tool dalam ChemDraw juga menyajikan gambar
struktur untuk asam amino, DNA, dan RNA yang terdapat dalam template,
anda tinggal klik, membawanya ke layar, drag, maka jadilah gambar
struktur anda.<br /><br />ChemDraw merupakan program aplikasi untuk
menggambar yang di lengkapi dengan tool-tool sehingga pengguna dapat
dengan mudah membuat gambar yang diinginkannya hanya dengan mengklik
tool-tool tersebut, dengan ChemDraw anda tidak akan mengalami kesulitan
di dalam membuat struktur kimia. Hal ini tentu sangat membantu anda
dalam menulis skripsi, thesis, karya ilmiah, ataupun jurnal, bahkan anda
juga dapat mengkomunikasikan struktur yang anda miliki ke dunia web
jika komputer anda di lengkapi dengan program aplikasi ChemOffice yang
lain. Gambar yang telah anda buat juga dapat dengan mudah dicetak atau
dibawah ke dalam program aplikasi lain seperti Ms. Word.<br /><br />ChemDraw
juga dapat menganalisis struktur kimia yang telah kita gambar dengan
menggunakan Analys Struktur pada menu Structure, di sini anda dapat
mengetahui sifat-sifat fisik struktur tersebut, misalnya, titik didih,
titik leleh, berat molekul, temperatur, tekanan, dll</div>
<div class="post-body entry-content">
</div>
<div class="post-body entry-content">
sumber : http://faijalchemistry.blogspot.com/2010/06/chemdraw-pro-versi-8.html </div>
<div class="post-body entry-content">
</div>akademik_HIMKAhttp://www.blogger.com/profile/00366070787523409197noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-2766916642261181760.post-32781215335955887582012-01-03T16:18:00.000-08:002012-01-03T16:18:21.326-08:00konten nomer 5link kimia komputasi :<br />
<ul>
<li> <a href="http://www.molmatinf.com/" target="_blank">be a smart chemist, with your smart phone</a> </li>
<li><a href="http://www.facebook.com/groups/sainskomputasi/" target="_blank">yuk, diskusi komputasi bareng..</a> </li>
<li><a href="http://linux4u.jinr.ru/chemistry/linux4chemistry.htm" target="_blank">Linux4chemistry</a></li>
<li> <a href="http://www.msg.ameslab.gov/graphics/other.html" target="_blank">Mark Gordons quantum theory group ames laboratory/lowa state universit</a>y<span style="font-size: x-small;"></span></li>
<li style="font-family: Arial,Helvetica,sans-serif;"><div id="header">
</div>
<a href="http://gurukimia.blogspot.com/2008/08/software-kimia-gratis.html" target="_blank">Guru kimia Software</a></li>
</ul>
<br />akademik_HIMKAhttp://www.blogger.com/profile/00366070787523409197noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-2766916642261181760.post-73560937943374408892012-01-03T16:05:00.000-08:002012-01-03T16:59:34.460-08:00UAS..<span style="background: none repeat scroll 0% 0% white;"> 1. Jelaskan bagaimana cara membuat linux live usb versi kimia, software apa saja</span><span style="background: none repeat scroll 0% 0% white;"> yang digunakan dan bagaimana cara memperolehnya?</span><br />
<br />
<span style="background: none repeat scroll 0% 0% white;"><a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2011/12/membuat-linux-live-usb-dengan.html" target="_blank">linux live usb dengan unebootin</a>, dan <a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2012/01/membuat-usb-linux-chempup.html" target="_blank">membuat USB linux (chempup)</a></span><span class="text_exposed_show"> </span><br />
<br />
<span class="text_exposed_show">2. Program kimia apa saja yang ada di Chempub (linux kimia) dan apa manfaatnya, beri contoh langkah-langkah cara menggunakannya ?</span><br />
<br />
<a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2011/12/manfaat-chempup.html" target="_blank">manfaat dan langkahnya disini</a><br />
<br />
<span class="text_exposed_show">3. Beri contoh analisa apa saja yang dapat dilakukan oleh software Hyperchem ?</span><br />
<div style="color: black; margin: 0in 0in 0.0001pt; text-indent: 0.5in;">
<a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2011/12/analisa-dengan-hyperchem-analisis.html" target="_blank"><b><span style="background: none repeat scroll 0% 0% white;">Analisa dengan Hyperchem (Analisis Konformasi Menthol)</span></b></a></div>
<div style="background: none repeat scroll 0% 0% white; color: black; margin: 0in; text-indent: 0.5in;">
<a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2011/12/analisa-dengan-hyperchem-interaksi-eter.html" target="_blank"><b><span style="background: none repeat scroll 0% 0% white;">Analisa Dengan Hyperchem (Interaksi Eter Mahkota dengan Suatu Ion)</span></b></a></div>
<div style="background: none repeat scroll 0% 0% white; color: black; margin: 0in; text-indent: 0.5in;">
<a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2011/12/analisa-dengan-hyperchem-gaya-antar.html" target="_blank"><b><span style="background: none repeat scroll 0% 0% white;">Analisa dengan Hyperchem (Gaya Antar Molekul pada Asam Karboksilat)</span></b></a></div>
<div style="background: none repeat scroll 0% 0% white; color: black; margin: 0in; text-indent: 0.5in;">
<a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2011/12/analisa-dengan-hyperchem-mengukur-sifat.html" target="_blank"><b><span style="background: none repeat scroll 0% 0% white;">Analisa dengan Hyperchem (Mengukur Sifat-sifat Struktural)</span></b></a></div>
<div style="background: none repeat scroll 0% 0% white; color: black; margin: 0in; text-indent: 0.5in;">
<a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2011/12/analisa-dengan-hyperchem-pemodelan.html" target="_blank"><b><span style="background: none repeat scroll 0% 0% white;">Analisa dengan Hyperchem (Pemodelan Molekul Organik)</span></b></a></div>
<div style="background: none repeat scroll 0% 0% white; color: black; margin: 0in; text-indent: 0.5in;">
<a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2011/12/hyperchem-permodelan-uv.html" target="_blank"><b><span style="background: none repeat scroll 0% 0% white;">Analisa dengan Hyperchem (Pemodelan Spektroskopi UV)</span></b></a></div>
<div style="background: none repeat scroll 0% 0% white; color: black; margin: 0in; text-indent: 0.5in;">
<a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2011/12/hyperchem-ab-intio.html" target="_blank"><b><span style="background: none repeat scroll 0% 0% white;">Analisa dengan Hyperchem (AB Initio)</span></b></a></div>
<div style="background: none repeat scroll 0% 0% white; color: black; margin: 0in; text-indent: 0.5in;">
<a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2011/12/hyperchem-praktek-semi-empiris.html" target="_blank"><b><span style="background: none repeat scroll 0% 0% white;">Analisa dengan Hyperchem (Praktek Semi Empiris)</span></b></a></div>
<div style="background: none repeat scroll 0% 0% white; color: black; margin: 0in; text-indent: 0.5in;">
<a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2011/12/stabilitas-karbokation-benzil.html" target="_blank"><b><span style="background: none repeat scroll 0% 0% white;">Analisa dengan Hyperchem (Stabilitas dan Struktur Karbokation Benzil dan Alil)</span></b></a></div>
<br />
<span class="text_exposed_show">4. Beri contoh analisa apa saja yang dapat dilakukan oleh software Chem Office ?</span><br />
<br />
<a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2012/01/konten-nomer-4-chemoffice.html" target="_blank">analisa chemoffice, salah satunya chemdraw</a><br />
<br />
<span class="text_exposed_show">5. Tuliskan beberapa link / web penyedia software yang berhubungan dengan kimia?</span><br />
<br />
<div class="post-header">
</div>
<div class="post-body entry-content" id="post-body-3278121533595588758">
<div style="text-align: left;">
link kimia komputasi :</div>
<ul>
<li> <a href="http://www.molmatinf.com/" target="_blank">be a smart chemist, with your smart phone</a> </li>
<li><a href="http://www.facebook.com/groups/sainskomputasi/" target="_blank">yuk, diskusi komputasi bareng..</a> </li>
<li><a href="http://linux4u.jinr.ru/chemistry/linux4chemistry.htm" target="_blank">Linux4chemistry</a></li>
<li> <a href="http://www.msg.ameslab.gov/graphics/other.html" target="_blank">Mark Gordons quantum theory group ames laboratory/lowa state universit</a>y<span style="font-size: xx-small;"></span></li>
<li style="font-family: Arial,Helvetica,sans-serif;"><div id="header">
</div>
<a href="http://gurukimia.blogspot.com/2008/08/software-kimia-gratis.html" target="_blank">Guru kimia Software</a> </li>
</ul>
</div>
<br />
<span class="text_exposed_show">6. Beri sedikit ulasan mengenai manfaat dari beberapa software kimia komputasi minimal 5 software ?</span><br />
<br />
<ul>
<li><span style="background-color: white;"><a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2011/12/kalzium-1.html" target="_blank">KALZIUM #1</a> </span></li>
<li><span style="background-color: white;"><a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2011/12/kalzium2.html" target="_blank">KALZIUM#2</a></span></li>
<li><span style="background-color: white;"><a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2011/12/kalzium3.html" target="_blank">KALZIUM#3</a></span></li>
<li><span style="background-color: white;"><a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2011/12/hyperchem1.html" target="_blank">Hyperchem#1</a></span></li>
<li><span style="background-color: white;"><a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2011/12/avogadro.html" target="_blank">Avogadro, untuk edit molekul</a></span></li>
<li><span style="background-color: white;"><a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2011/12/chempup-jmol.html" target="_blank">Chempup (Jmol)</a></span></li>
<li><span style="background-color: white;"><a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2011/12/gelement.html" target="_blank">Chempup (GElement)</a></span></li>
</ul>
<br />
<span class="text_exposed_show"> 7. Tuliskan minimal 20 istilah yang berhubungan dengan kimia komputasi dan maknanya ?</span><br />
<br />
<a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2011/12/konten-no-7-istilah-komputasi.html" target="_blank">Bingung sama istilahnya? cek disini</a><br />
<br />
<span class="text_exposed_show">8. Berikan sedikit ulasan mengenai manfaat kimia komputasi untuk pembelajaran ?</span><br />
<br />
<span class="text_exposed_show"><a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2011/12/manfaat-komputasi-dalam-pembelajaran.html" target="_blank">manfaat kimia komputasi..</a> </span><br />
<br />
<br />
<span class="text_exposed_show">9. Berikan sedikit ulasan mengenai manfaat kimia komputasi untuk penelitian pengembangan material baru atau pengembangan obat?</span><br />
<span class="text_exposed_show"><br /></span><br />
<ul>
<li><span style="background: none repeat scroll 0% 0% white;"><a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2011/12/manfaat-komputasi-dalam-obat.html" target="_blank">Manfaat komputasi dalam obat</a></span></li>
<li><span style="background: none repeat scroll 0% 0% white;"><a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2011/12/guru-besar-karena-manfaat-komputasi.html" target="_blank">Guru Besar dan penelitiannya menunjukkan bahwa kimia komputasi mempersingkat penemuan obat.</a></span></li>
<li><span style="background: none repeat scroll 0% 0% white;"><a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2012/01/manfaat-komputasi-dalam-efek-samping.html" target="_blank">bisa juga digunakan peramalan efek samping obatnya </a>!</span></li>
</ul>
<br />
<span class="text_exposed_show"></span><br />
<span class="text_exposed_show">10. Silahkan buat tulisan bebas tentang kimia komputasi menurut anda ?</span><br />
<br />
<span class="text_exposed_show"><a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2012/01/kimia-komputasi-menurut-ku-adalah-kimia.html" target="_blank">Kimia komputasi menurut seorang isa</a></span>akademik_HIMKAhttp://www.blogger.com/profile/00366070787523409197noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-2766916642261181760.post-48412798309832280772012-01-03T15:48:00.000-08:002012-01-03T15:48:42.830-08:00membuat USB linux (Chempup)<h3 class="post-title entry-title">
Membuat USB Linux (Chempup)
</h3>
<div class="post-header">
</div>
<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEj0O8O03qic2BQH_cxgJQC5bRNxe20FKcO_omuS1gB7EC18FuZsr_X1wVL6wI5eFjB21efTvJPDTe6Hu_ZrSPvVNaN0lyGL6F60YqcaH0fOPPfIb-yvgW3g56ASvFOFzcOQ_3dNM8qG4w4/s1600/Linux_Live_USB.png" style="margin-left: 1em; margin-right: 1em;"><img border="0" height="320" src="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEj0O8O03qic2BQH_cxgJQC5bRNxe20FKcO_omuS1gB7EC18FuZsr_X1wVL6wI5eFjB21efTvJPDTe6Hu_ZrSPvVNaN0lyGL6F60YqcaH0fOPPfIb-yvgW3g56ASvFOFzcOQ_3dNM8qG4w4/s320/Linux_Live_USB.png" width="317" /></a></div>
<br />
<br />
pertama download linux live usb di <a href="http://www.linuxliveusb.com/">http://www.linuxliveusb.com/</a><br />
<br />
<div class="separator" style="clear: both; text-align: left;">
lalu instal linux live.exe yang telah di download ke dalam komputer</div>
<div class="separator" style="clear: both; text-align: left;">
</div>
<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEhMFDQbXKXsibpBvUNF4krvrjvbM7p5wU4VUT527KYIgu9gSpzlmvg-RqdlK802oWeQTdfeGg7kpUkLplUtDQGt4AC_z60SgDkcF0z_L_n6LzYsv-vQxo3Ma1EJ50nIOY26Fk8RAvucLSk/s1600/copo.PNG" style="margin-left: 1em; margin-right: 1em;"><img border="0" src="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEhMFDQbXKXsibpBvUNF4krvrjvbM7p5wU4VUT527KYIgu9gSpzlmvg-RqdlK802oWeQTdfeGg7kpUkLplUtDQGt4AC_z60SgDkcF0z_L_n6LzYsv-vQxo3Ma1EJ50nIOY26Fk8RAvucLSk/s1600/copo.PNG" /></a></div>
<div class="separator" style="clear: both; text-align: left;">
</div>
<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
</div>
<div class="separator" style="clear: both; text-align: left;">
</div>
jalankan LiLi (linux live) yang sudah di instal<br />
<br />
<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEjuv6m_6qHVRon-JBDASCj9627QMlidcYrNgttLi4K2u0LRMUJk6L13X4Tt1cIlww3qrLb8hMSWMqogdrryA386QGLk48hnOMOZRT7oslJDHjkD_b-R-XgLv3y4lPry99OZy3myOAv6UIs/s1600/lili.PNG" style="margin-left: 1em; margin-right: 1em;"><img border="0" src="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEjuv6m_6qHVRon-JBDASCj9627QMlidcYrNgttLi4K2u0LRMUJk6L13X4Tt1cIlww3qrLb8hMSWMqogdrryA386QGLk48hnOMOZRT7oslJDHjkD_b-R-XgLv3y4lPry99OZy3myOAv6UIs/s1600/lili.PNG" /></a></div>
<br />
<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
</div>
<br />
1. Pilih Flashdisk yang akan digunakan<br />
2. Pilih file iso chempup<br />
3. Pilih "Hide created files on key" dan "Format the key in FAT32"<br />
4. Setelah semuanya sudah terpilih klik lightning icon (gambar petir)<br />
5. Biarkan Hingga instalasi selesai<br />
6. Restart ganti boot agar diprioritaskan pada usb<br />
7. Pilih Live cd<br />
8. Masuk ke chempup<br />
<br />
<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEjH3V4j-nEr68quuryZdvbG7eWE1OUHnNudtKNF_WJAWhu1Gx11_OoBJeVa1z4utiwTZAfrNClLM5iMx6KunB5AfeUJAX_WM0jdSoRRA-mf6kG0zCD8Z0hnU1jy3he2uNdzKSsDqHDvriA/s1600/finish.PNG" style="margin-left: 1em; margin-right: 1em;"><img border="0" src="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEjH3V4j-nEr68quuryZdvbG7eWE1OUHnNudtKNF_WJAWhu1Gx11_OoBJeVa1z4utiwTZAfrNClLM5iMx6KunB5AfeUJAX_WM0jdSoRRA-mf6kG0zCD8Z0hnU1jy3he2uNdzKSsDqHDvriA/s1600/finish.PNG" /></a></div>
<br />
<br />
Sumber : http://www.linuxliveusb.com/<br />
tunasalamuin.blogspot.comakademik_HIMKAhttp://www.blogger.com/profile/00366070787523409197noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-2766916642261181760.post-77225520004639278702012-01-03T15:36:00.000-08:002012-01-03T15:36:15.868-08:00konten nomer 10<span style="background-color: white;">
Silahkan buat tulisan bebas tentang kimia komputasi menurut anda ?</span><span style="background-color: white;"> </span><br />
<ul>
<li><span style="background-color: white;"><a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2012/01/kimia-komputasi-menurut-ku-adalah-kimia.html" target="_blank">apa sih kimia komputasi?</a></span></li>
</ul>akademik_HIMKAhttp://www.blogger.com/profile/00366070787523409197noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-2766916642261181760.post-73608345553541647062012-01-03T15:02:00.000-08:002012-01-03T15:02:50.645-08:00manfaat komputasi dalam efek samping obat<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEi_MhtJkgzOxHXTSXD7K_YPt7MemrjpuAN0I_RD1xGUqs9xLorloXlKYDKcT5tAYGNT1xJAzQN0E8QDlF9LWNwFyDsgam_QXNhlc3PJu2ntacRX4WOum7_3QtOllV6P9K0ivyNMVRdp4rp9/s1600/komputer-farmasi.jpg" imageanchor="1" style="margin-left: 1em; margin-right: 1em;"><img border="0" height="320" src="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEi_MhtJkgzOxHXTSXD7K_YPt7MemrjpuAN0I_RD1xGUqs9xLorloXlKYDKcT5tAYGNT1xJAzQN0E8QDlF9LWNwFyDsgam_QXNhlc3PJu2ntacRX4WOum7_3QtOllV6P9K0ivyNMVRdp4rp9/s320/komputer-farmasi.jpg" width="240" /></a></div>
<span style="font-style: normal;">Pada
13 Desember 2007, dilaporkan bahwa identifikasi awal dari efek samping
buruk obat sebelum diuji pada manusia adalah sangat penting dalam
mengembangkan terapi baru, karena efek samping yang tidak diharapkan
menyebabkan sepertiga dari kegagalan proses pengembangan obat. Sekarang,
peneliti pada Universitas California, San Diego (UCSD) telah
mengembangkan teknik baru dengan menggunakan modeling komputer untuk
mengidentifikasi efek samping potensial dari obat, dan telah menggunakan
teknik itu untuk mempelajari kelas obat tertentu, yang termasuk
didalamnya adalah tamoxifen, obat yang sering diresepkan pada perawatan
kanker payudara. Kajian mereka tersedia di jurnal Plos Komputasi
Biologi.</span><br />
Metode uji konvensional menapiskan senyawa pada
studi binatang, sebelum uji pada manusia, dengan harapan dapat menemukan
efek samping dari terapetik yang menjanjikan. Tim UCSD, yang dipimpin
oleh Philip Bourne, Profesor Farmakologi pada Sekolah Farmasi dan ilmu
farmasetika UCSD dan Lei Xie PhD dari Pusat Komputer Super San Diego
UCSD, mereka menggunakan tenaga dari model komputer untuk menapiskan
molekul obat tertentu menggunakan database yang tersedia untuk seluruh
dunia. Database tersebut adalah Protein Data Bank (PDB), yang didalamnya
terdapat entri dari ribuan struktur tiga dimensi protein.<br />
Molekul
obat didesain untuk mengikat pada protein target dalam rangka
mendapatkan efek terapetik, namun jika molekul obat kecil yang berfungsi
sebagai ‘kunci’ bertaut pada target protein lain yang memiliki situs
pengikatan serupa, atau ‘lubang kunci’, maka efek samping bisa terjadi.<br />
Dalam
rangka mengidentifikasi protein yang bisa menjadi target tak
diinginkan, peneliti USCD menggunakan molekul obat tunggal dan melihat
bagaimana kemungkinan ia dapat mengikat pada semua protein yang
disandikan oleh proteosom manusia. Dalam studi kasus yang sudah
dipublikasikan, mereka menggunakan Select Estrogen Receptor Modulators
(SERMs), kelas obat yang dimana tamoxifen termasuk didalamnya, untuk
mengilustrasikan pendekatan baru tersebut.<br />
‘Prosedur komputasi
yang kami kembangkan dimulai dengan model tiga dimensi obat, dalam
rangka menunjukkan struktur dari molekul obat yang terikat pada protein
target, dalam hal ini SERM yang terikat pada reseptor estrogen,’ kata
Bourne, yang adalah wakil direktur PDB. Kemudian, peneliti menggunakan
analisis komputer untuk mencari situs pengikatan lain yang cocok dengan
situs pengikatan obat. Seperti mencari lubang kunci lain, yang dapat
dibuka oleh kunci yang sama.<br />
Pada kajian ini, tim menemukan
protein target SERMs yang belum teridentifikasi sebelumnya .
Identifikasi pada situs pengikatan ini menjelaskan mengapa terjadi efek
samping yang buruk, dan membuka peluang untuk memodifikasi obat supaya
tetap mengikat pada target yang diinginkan, namun mengurangi afinitasnya
pada situs sekunder.<br />
“Jika obat memiliki efek sampingan buruk,
kemungkinan besar obat tersebut mengikat pada molekul sekunder yang
tidak diinginkan, dengan kata lain, kunci yang digunakan untuk bertaut
dengan sasaran ternyata cocok untuk banyak lubang kunci,’ kata Bourne.
Ia menjelaskan, bahwa dengan menggunakan teknik komputer ini untuk
menemukan ‘lubang kunci’ lain akan menghasilkan salah satu dari tiga hal
ini: Lubang kunci baru bisa jadi tidak menghasilkan efek apapun, lubang
kunci tersebut dapat menjelaskan efek samping buruk dari obat, atau
riset tersebut dapat saja menemukan efek terapetik baru, yang potensial
untuk pengembangan obat yang ada.<br />
Peneliti UCSD melanjutkan kajian
mereka, yang menurut Bourne dapat diaplikasikan pada semua obat yang
ada di pasaran, dimana struktur obat tersebut terikat pada reseptor PDB.
Bourne menggaris bawahi, bahwa hasil dari pendekatan ini tetap harus
diuji di laboratorium basah.<br />
Jiang Wang dari program
Bioinformatika UCSD juga berkontribusi pada studi ini melalui Plos.
Penelitian ini didukung oleh National Institute of Health. Diadaptasi
dari bahan yang diberikan oleh UCSD.<br />
<br />
Diterjemahkan dari:<br />
University of California – San Diego (2007, December 13). New Computational<br />
Technique Can Predict Drug Side Effects. ScienceDaily. Retrieved April 28, 2009<br />
www.chem-is-try.org <br />akademik_HIMKAhttp://www.blogger.com/profile/00366070787523409197noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-2766916642261181760.post-13401768382836610822011-12-31T20:37:00.000-08:002012-01-03T15:05:33.031-08:00Konten nomer 9<span style="background: none repeat scroll 0% 0% white;">Berikan sedikit ulasan
mengenai manfaat kimia komputasi untuk penelitian pengembangan material baru atau obat ?</span><br />
<br />
<ul>
<li><span style="background: none repeat scroll 0% 0% white;"><a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2011/12/manfaat-komputasi-dalam-obat.html" target="_blank">Manfaat komputasi dalam obat</a></span></li>
<li><span style="background: none repeat scroll 0% 0% white;"><a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2011/12/guru-besar-karena-manfaat-komputasi.html" target="_blank">Guru Besar dan penelitiannya menunjukkan bahwa kimia komputasi mempersingkat penemuan obat.</a></span></li>
<li><span style="background: none repeat scroll 0% 0% white;"><a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2012/01/manfaat-komputasi-dalam-efek-samping.html" target="_blank">bisa juga digunakan peramalan efek samping obatnya </a>!</span></li>
</ul>akademik_HIMKAhttp://www.blogger.com/profile/00366070787523409197noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-2766916642261181760.post-24395464943616287072011-12-31T20:36:00.000-08:002011-12-31T20:36:14.672-08:00guru besar karena manfaat komputasi dalam obat<h3 class="post-title entry-title">
Kimia Komputasi dalam Pengembangan Obat
</h3>
<div class="post-header">
</div>
<div dir="ltr" style="text-align: left;">
<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEgnTDthnn_rtiKIA0IvvhU51SCga62WWPKAnH0tzNsBikDk_60ma4FJz-LD06XkKWCFipncH5B77CPWqFq9M71ztqE8gcEGtk_qCpGL1YrJ4ArNNmSuLQvdiG9wIccSFdQVBOMBuGlQ8I4a/s1600/asam_sialat.jpg" style="clear: right; float: right; margin-bottom: 1em; margin-left: 1em;"><img border="0" height="144" src="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEgnTDthnn_rtiKIA0IvvhU51SCga62WWPKAnH0tzNsBikDk_60ma4FJz-LD06XkKWCFipncH5B77CPWqFq9M71ztqE8gcEGtk_qCpGL1YrJ4ArNNmSuLQvdiG9wIccSFdQVBOMBuGlQ8I4a/s200/asam_sialat.jpg" width="200" /></a></div>
Metode kimia komputasi untuk tujuan disain molekul baru, tetutama
senyawa obat, serta prediksi sifat fisiko-kimia telah menjadi metode
pilihan utama sebagian besar industri farmasi berkaitan dengan
pengembangan maupun penemuan obat. Aplikasi metode yang juga disebut <em>in silico</em>
ini, berawal dari postulat dasar dalam paradigma disain obat klasik
yang menyatakan bahwa efek obat dalam tubuh manusia merupakan suatu
konsekuensi “<em>molecular recognition</em>” antara ligan (dalam hal ini obatdan sutau makromolekul (target).
<div style="text-align: justify;">
Aktivitas farmakologi ligan terhadap dudukan kerjanya (<em>action site</em>)
sangat ditentukan oleh tatanan ruang dan kerapatan elektron atom-atom
ligan, dan juga bagaimana atom-atom tersebut berinteraksi dengan molekul
target atau “<em>biological conterpart</em>” (Bohm & Klebe, 1996).
Struktur, dinamika, dan interaksi demikian memungkinkan suatu
karakterisasi menggunakan kimia komputasi dilakukan. Misalnya,
pendekatan berbasis mekanika molekular (<em>molecular mechanics</em>)
secara efisien dapat membantu penemuan kandidat-kandidat obat baru, dan
metode komputasi yang tidak mahal ini sekarang secara rutin digunakan di
dalam disain obat (Jorgensen, 2004).</div>
<div>
</div>
<div style="text-align: justify;">
Meskipun demikian, jika deskripsi sifat elektron yang diperlukan
untuk tujuan disain tersebut, maka penggunaan mekanika kuantum sangat
beperan. Sesungguhnya pendekatan kimia komputasi berbasis mekanika
kuantum selain menjelaskan efek elektronik kuantum, juga mampu
menjelaskan pembentukan dan pemutusan ikatan kimia, efek polarisai,
perpindahan muatan, dst., biasanya mampu memperkirakan energi molekul
lebih akurat (Cavali <em>et al</em>., 2006). Aplikasi mekanika kuantum
berbasis ligan di dalam disain obat sejak dahulu telah diarahkan dalam
pengamatan energi, geometri, dan distribusi elektron (misalnya HOMO,
LUMO, momen dipol, dst.) molekul organik kecil. Perhitungan mekanika
kuantum secara rutin telah juga dilakukan dalam analisis QSAR (<em>Quantitative-Structure Activity Relationship</em>) klasik (Lepp & Chuman, 2005), QSAR 3D (Aguirre <em>et al</em>., 2005) dan juga mengembangkan deskriptor kuantum (Wan <em>et al</em>., 2004) untuk digunakan dalam penelitian korelasi struktur-aktivitas.</div>
<div style="text-align: justify;">
</div>
<div style="text-align: justify;">
Hal menarik dalam penggunaan kimiakomputasi berkaitan dengan molekul
target di dalam disain obat adalah telaah analisis reaksi enzimatik
dalam sistem biologis yang memiliki relevansi farmakologi (Gogonea <em>et al</em>.,
2001), simulasi ini memungkinkan menjelaskan mekanisme substrat
(inhibitor)-enzim dan lebih lanjut terhadap interaksi substrat enzim
pada keadaan transisi melalui analisis energi ikat (<em>binding energy</em>).</div>
<div style="text-align: justify;">
</div>
<div style="text-align: justify;">
</div>
<div style="text-align: justify;">
</div>
<div style="text-align: justify;">
<strong>Pustaka</strong></div>
<div style="text-align: justify;">
</div>
<div style="text-align: justify;">
Bohm, H.J. & G. Klebe. 2004. <em>Angew</em>.<em> Chem</em>.<em> Int</em>.<em> Ed</em>. 35, 2589.</div>
<div style="text-align: justify;">
</div>
<div style="text-align: justify;">
Jorgensen, W.L. 2004. <em>Science</em>. 303, 1813.</div>
<div style="text-align: justify;">
</div>
<div style="text-align: justify;">
Cavalli, A., P. Carloni, & M. Recanatini. 2006. <em>Chem</em>. <em>Rev</em>. 106,3467.</div>
<div style="text-align: justify;">
</div>
<div style="text-align: justify;">
Lepp, Z. & H. Chuman. 2005. <em>Bioorg</em>. <em>Med</em>. <em>Chem</em>. 13, 3093.</div>
</div>akademik_HIMKAhttp://www.blogger.com/profile/00366070787523409197noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-2766916642261181760.post-33898348615846578482011-12-31T20:31:00.002-08:002011-12-31T20:31:59.336-08:00manfaat komputasi dalam obat<h3 class="post-title entry-title">
Kimia Komputasi dalam Pengembangan Obat
</h3>
<div class="post-header">
</div>
<div dir="ltr" style="text-align: left;">
<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEgnTDthnn_rtiKIA0IvvhU51SCga62WWPKAnH0tzNsBikDk_60ma4FJz-LD06XkKWCFipncH5B77CPWqFq9M71ztqE8gcEGtk_qCpGL1YrJ4ArNNmSuLQvdiG9wIccSFdQVBOMBuGlQ8I4a/s1600/asam_sialat.jpg" style="clear: right; float: right; margin-bottom: 1em; margin-left: 1em;"><img border="0" height="144" src="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEgnTDthnn_rtiKIA0IvvhU51SCga62WWPKAnH0tzNsBikDk_60ma4FJz-LD06XkKWCFipncH5B77CPWqFq9M71ztqE8gcEGtk_qCpGL1YrJ4ArNNmSuLQvdiG9wIccSFdQVBOMBuGlQ8I4a/s200/asam_sialat.jpg" width="200" /></a></div>
Metode kimia komputasi untuk tujuan disain molekul baru, tetutama
senyawa obat, serta prediksi sifat fisiko-kimia telah menjadi metode
pilihan utama sebagian besar industri farmasi berkaitan dengan
pengembangan maupun penemuan obat. Aplikasi metode yang juga disebut <em>in silico</em>
ini, berawal dari postulat dasar dalam paradigma disain obat klasik
yang menyatakan bahwa efek obat dalam tubuh manusia merupakan suatu
konsekuensi “<em>molecular recognition</em>” antara ligan (dalam hal ini obatdan sutau makromolekul (target).
<div style="text-align: justify;">
Aktivitas farmakologi ligan terhadap dudukan kerjanya (<em>action site</em>)
sangat ditentukan oleh tatanan ruang dan kerapatan elektron atom-atom
ligan, dan juga bagaimana atom-atom tersebut berinteraksi dengan molekul
target atau “<em>biological conterpart</em>” (Bohm & Klebe, 1996).
Struktur, dinamika, dan interaksi demikian memungkinkan suatu
karakterisasi menggunakan kimia komputasi dilakukan. Misalnya,
pendekatan berbasis mekanika molekular (<em>molecular mechanics</em>)
secara efisien dapat membantu penemuan kandidat-kandidat obat baru, dan
metode komputasi yang tidak mahal ini sekarang secara rutin digunakan di
dalam disain obat (Jorgensen, 2004).</div>
<div>
</div>
<div style="text-align: justify;">
Meskipun demikian, jika deskripsi sifat elektron yang diperlukan
untuk tujuan disain tersebut, maka penggunaan mekanika kuantum sangat
beperan. Sesungguhnya pendekatan kimia komputasi berbasis mekanika
kuantum selain menjelaskan efek elektronik kuantum, juga mampu
menjelaskan pembentukan dan pemutusan ikatan kimia, efek polarisai,
perpindahan muatan, dst., biasanya mampu memperkirakan energi molekul
lebih akurat (Cavali <em>et al</em>., 2006). Aplikasi mekanika kuantum
berbasis ligan di dalam disain obat sejak dahulu telah diarahkan dalam
pengamatan energi, geometri, dan distribusi elektron (misalnya HOMO,
LUMO, momen dipol, dst.) molekul organik kecil. Perhitungan mekanika
kuantum secara rutin telah juga dilakukan dalam analisis QSAR (<em>Quantitative-Structure Activity Relationship</em>) klasik (Lepp & Chuman, 2005), QSAR 3D (Aguirre <em>et al</em>., 2005) dan juga mengembangkan deskriptor kuantum (Wan <em>et al</em>., 2004) untuk digunakan dalam penelitian korelasi struktur-aktivitas.</div>
<div style="text-align: justify;">
</div>
<div style="text-align: justify;">
Hal menarik dalam penggunaan kimiakomputasi berkaitan dengan molekul
target di dalam disain obat adalah telaah analisis reaksi enzimatik
dalam sistem biologis yang memiliki relevansi farmakologi (Gogonea <em>et al</em>.,
2001), simulasi ini memungkinkan menjelaskan mekanisme substrat
(inhibitor)-enzim dan lebih lanjut terhadap interaksi substrat enzim
pada keadaan transisi melalui analisis energi ikat (<em>binding energy</em>).</div>
<div style="text-align: justify;">
</div>
<div style="text-align: justify;">
</div>
<div style="text-align: justify;">
</div>
<div style="text-align: justify;">
<strong>Pustaka</strong></div>
<div style="text-align: justify;">
</div>
<div style="text-align: justify;">
Bohm, H.J. & G. Klebe. 2004. <em>Angew</em>.<em> Chem</em>.<em> Int</em>.<em> Ed</em>. 35, 2589.</div>
<div style="text-align: justify;">
</div>
<div style="text-align: justify;">
Jorgensen, W.L. 2004. <em>Science</em>. 303, 1813.</div>
<div style="text-align: justify;">
</div>
<div style="text-align: justify;">
Cavalli, A., P. Carloni, & M. Recanatini. 2006. <em>Chem</em>. <em>Rev</em>. 106,3467.</div>
<div style="text-align: justify;">
</div>
<div style="text-align: justify;">
Lepp, Z. & H. Chuman. 2005. <em>Bioorg</em>. <em>Med</em>. <em>Chem</em>. 13, 3093.</div>
</div>akademik_HIMKAhttp://www.blogger.com/profile/00366070787523409197noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-2766916642261181760.post-53441656070783802092011-12-31T20:26:00.000-08:002011-12-31T20:26:33.267-08:00Konten nomer 8 manfaat komputasi dalam pembelajaran<span style="background-attachment: initial; background-clip: initial; background-color: white; background-image: initial; background-origin: initial; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial;">Berikan sedikit ulasan mengenai manfaat kimia komputasi untuk pembelajaran ?</span><br />
<br />
<span style="background-color: white;"><a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2011/12/manfaat-komputasi-dalam-pembelajaran.html" target="_blank">Ini dia beberapa manfaat kimia komputasi </a></span>akademik_HIMKAhttp://www.blogger.com/profile/00366070787523409197noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-2766916642261181760.post-9732943133493039992011-12-31T20:23:00.000-08:002011-12-31T20:23:46.479-08:00manfaat komputasi dalam pembelajaran<h3 class="post-title entry-title">
Manfaat Kimia Komputasi dalam Pembelajaran
</h3>
<div class="post-header">
</div>
<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="http://4.bp.blogspot.com/-7wOaQslZ3Xg/Tvca8ORR9SI/AAAAAAAAAz0/bhQ1PzkrlC0/s1600/pharmacist.jpg" style="margin-left: 1em; margin-right: 1em;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><img border="0" height="320" src="http://4.bp.blogspot.com/-7wOaQslZ3Xg/Tvca8ORR9SI/AAAAAAAAAz0/bhQ1PzkrlC0/s320/pharmacist.jpg" width="297" /></span></a></div>
<div class="separator" style="clear: both; text-align: justify;">
</div>
<ul>
<li><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif; text-align: left; text-indent: -0.25in;">Menghitung sifat-sifat molekul dan perubahannya
maupun melakukan simulasi terhadap sistem-sistem besar (makromolekul seperti
protein atau sistem banyak molekul seperti gas, cairan, padatan, dan kristal
cair), dan menerapkan program tersebut pada sistem kimia nyata.</span></li>
<li><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif; line-height: 115%; text-align: left;">Simulasi terhadap makromolekul (seperti protein
dan asam nukleat) dan sistem besar bisa mencakup kajian konformasi molekul dan
perubahannya (mis. proses denaturasi protein), perubahan fasa, serta peramalan
sifat-sifat makroskopik (seperti kalor jenis) berdasarkan perilaku di tingkat
atom dan molekul.</span></li>
<li><span style="font-family: Arial,Helvetica,sans-serif; line-height: 115%; text-align: left;">Membantu dalam pengetahuan sudut ikatan suatu reaksi, panjang ikatan, kekuatan ikatan dalam suatu senyawa.</span></li>
<li><span style="font-family: Arial,Helvetica,sans-serif; line-height: 115%; text-align: left;">Tidak boros bahan, karena dapat meramalkan reaksi yang akan terbentuk antara senyawa yang diinginkan.</span></li>
</ul>akademik_HIMKAhttp://www.blogger.com/profile/00366070787523409197noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-2766916642261181760.post-12161584082001678512011-12-31T20:13:00.000-08:002011-12-31T20:17:55.738-08:00Konten no 7 istilah komputasi<span style="background-attachment: initial; background-clip: initial; background-color: white; background-image: initial; background-origin: initial; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial;"> Tuliskan minimal 20 istilah yang berhubungan dengan kimia komputasi dan
maknanya ?</span><br />
<br />
<h3 class="post-title entry-title">
Istilah-istilah pada kimia komputasi
</h3>
<div class="post-header">
</div>
<br />
<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEhqlN_d-pwkU-qpZu0wMEFnSzMtbmvpbUb4iVTlfbWLMl2c-mVhkOQZ95McssogNTflaNEkTHtr7qA9aLX-8UQDomazn9iOPwF85dqYJZRkL-OSc4YzZqJG0E4lceHp3auwueGCzGxvy1o/s1600/iStock_000004506538Small.jpg" style="margin-left: 1em; margin-right: 1em;"><img border="0" height="265" src="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEhqlN_d-pwkU-qpZu0wMEFnSzMtbmvpbUb4iVTlfbWLMl2c-mVhkOQZ95McssogNTflaNEkTHtr7qA9aLX-8UQDomazn9iOPwF85dqYJZRkL-OSc4YzZqJG0E4lceHp3auwueGCzGxvy1o/s400/iStock_000004506538Small.jpg" width="400" /></a></div>
<h3 class="post-title entry-title" style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 20px; position: relative;">
</h3>
<div class="post-header" style="line-height: 1.6; margin-bottom: 1em; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px;">
<div class="post-header-line-1">
</div>
</div>
<div class="post-body entry-content" id="post-body-1809067396681189194" style="position: relative; width: 540px;">
<ul style="line-height: 1.4; margin-bottom: 0.5em; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0in; padding-bottom: 0px; padding-left: 2.5em; padding-right: 2.5em; padding-top: 0px;" type="disc">
<li class="MsoNormal" style="line-height: 19px; margin-bottom: 0.25em; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: left;"><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><i>Molecular modeling </i>merupakan
suatu metode untuk merancang dan menganalisis struktur dan sifat-sifat
molekul tertentu dengan mengunakan teknik kimia komputasional dan teknik
visualisasi grafis yang bertujuan untuk menyediakan struktur geometri
tiga dimensi yang sesuai dengan parameter kondisi yang telah ditentukan.
(Leach, 2001).</span></li>
</ul>
<ul style="line-height: 1.4; margin-bottom: 0.5em; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0in; padding-bottom: 0px; padding-left: 2.5em; padding-right: 2.5em; padding-top: 0px;" type="disc">
<li class="MsoNormal" style="line-height: 19px; margin-bottom: 0.25em; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: left;"><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><i>Molecular docking </i>merupakan suatu teknik yang digunakan untuk mempelajari interaksi yang terjadi dari suatu kompleks molekul. <i>Molecular docking </i>dapat
memprediksikan orientasi dari suatu molekul ke molekul yang lain ketika
berikatan membentuk kompleks yang stabil. (Funkhouser, 2007)<i>.</i></span></li>
</ul>
<ul style="line-height: 1.4; margin-bottom: 0.5em; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0in; padding-bottom: 0px; padding-left: 2.5em; padding-right: 2.5em; padding-top: 0px;" type="disc">
<li class="MsoNormal" style="line-height: 19px; margin-bottom: 0.25em; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: left;"><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><i>Molecular Operating Environment </i>(MOE) dikembangkan <i>Chemical Computing Group </i>(www.chemcomp.com). MOE selain menawarkan fasilitas yang cukup lengkap juga <i>user-friendly </i>sehingga cocok digunakan dalam pembelajaran. Hanya saja aplikasi kimia komputasi yang <i>user-friendly </i>biasanya mahal sehingga alasan efisiensi biaya tidak lagi relevan.</span></li>
</ul>
<ul style="line-height: 1.4; margin-bottom: 0.5em; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0in; padding-bottom: 0px; padding-left: 2.5em; padding-right: 2.5em; padding-top: 0px;" type="disc">
<li class="MsoNormal" style="line-height: 19px; margin-bottom: 0.25em; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: left;"><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">OV
(Orbital Viewer) adalah perangkat lunak gratis untuk menggambarkan
orbital atom dan molekul, membuat animasi maupun untuk melihat penampang
lintang (struktur dalam) orbital. Dapat pula dibuat gambar 3D (yang
dapat dilihat dengan kacamata 3D sperti yang digunakan untuk melihat
sinetron 3D). (Modul Struktur dan Kereaktifan Kimia Anorganik, Dr.
Ismunandar)</span></li>
</ul>
<ul style="line-height: 1.4; margin-bottom: 0.5em; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0in; padding-bottom: 0px; padding-left: 2.5em; padding-right: 2.5em; padding-top: 0px;" type="disc">
<li class="MsoNormal" style="line-height: 19px; margin-bottom: 0.25em; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: left;"><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><i>ab initio</i> berasal
dari bahasa latin yang diberikan untuk menandai perhitungan yang
diturunkan secara langsung dari prinsip-prinsip teoritis, tanpa
memasukkan data eksperimen. Ab initio mengacu pada perhitungan mekanika
kuantum melalui beberapa pendekatan matematis, seperti penggunaan
persamaan yang disederhanakan (<i>Born Oppenheimer approximation</i>) atau pendekatan untuk penyelesaian persamaan differensial. (PENGANTAR KIMIA KOMPUTASI, Dr. Harno Dwi Pranowo, M.Si)</span></li>
</ul>
<div style="text-align: justify;">
<ul style="line-height: 18px; margin-bottom: 0.5em; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0.5em; padding-bottom: 0px; padding-left: 2.5em; padding-right: 2.5em; padding-top: 0px;">
<li style="margin-bottom: 0.25em; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: left;"><span class="Apple-style-span" style="background-color: white; font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><i>Kimia kuantum</i> adalah
sebuah aplikasi mekanika kuantum pada kimia. Kimia kuantum memungkinkan
kita untuk memahami dan memprediksi struktur, sifat dan mekanisme
reaksi dari berbagai bahan.</span></li>
</ul>
<ul style="line-height: 18px; margin-bottom: 0.5em; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0.5em; padding-bottom: 0px; padding-left: 2.5em; padding-right: 2.5em; padding-top: 0px;">
<li style="margin-bottom: 0.25em; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: left;"><span class="Apple-style-span" style="background-color: white; font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><i>BS (Balls & Sticks)</i> adalah
perangkat lunak gratis untuk menggambarkan struktur kimia, terutama
kristal, dalam 3D dan dapat menghasilkan gambar bitmap yang dapat
disalin ke clipboard dan ditempelkan (paste) di dokumen pengolah kata
(Word misalnya).</span></li>
</ul>
<div style="text-align: left;">
<span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><span class="Apple-style-span" style="line-height: 18px;">Sumber : </span></span><a href="http://chittaputri.blogspot.com/2011/12/istilah-dalam-kimia-komputasi.html" style="text-align: justify;">http://chittaputri.blogspot.com/2011/12/istilah-dalam-kimia-komputasi.html</a></div>
<div style="text-align: left;">
</div>
<div style="text-align: left;">
<h2 style="line-height: 2em; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial,Helvetica,sans-serif; font-size: x-small;">Ab initio</span></span></h2>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Istilah
“Ab initio” adalah bahasa latin untuk “dari awal”. Nama ini diberikan
kepada perhitungan yang berasal langsung dari prinsip-prinsip teoritis,
tanpa masuknya data eksperimen. Sebagian besar saat ini adalah mengacu
ke perhitungan perkiraan kuantum mekanik. Perkiraan yang dibuat biasanya
perkiraan matematika, seperti menggunakan bentuk fungsional sederhana
untuk fungsi atau mendapatkan solusi perkiraan untuk sebuah persamaan
diferensial.</span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Jenis
yang paling umum perhitungan ab initio ini disebut perhitungan Hartree
Fock (disingkat HF), di mana pendekatan utama disebut pendekatan
lapangan pusat. Ini berarti bahwa tolakan Coulomb elektron-elektron
tidak secara khusus diperhitungkan. Namun, itu efek bersih adalah
termasuk dalam perhitungan. Ini adalah variasi perhitungan, yang berarti
bahwa energi perkiraan dihitung semua sama atau lebih besar daripada
energi yang tepat. Energi dihitung biasanya dalam satuan yang disebut
Hartrees (1 H = 27,2114 eV). Karena pendekatan lapangan pusat, energi
dari perhitungan HF selalu lebih besar daripada energi yang tepat dan
cenderung ke nilai membatasi disebut batas Hartree Fock.</span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Pendekatan
kedua dalam perhitungan HF adalah bahwa fungsi gelombang harus
dijelaskan oleh beberapa bentuk fungsional, yang hanya diketahui secara
tepat untuk satu beberapa sistem elektron. Fungsi yang paling sering
digunakan adalah kombinasi linier dari orbital tipe Slater exp (-ax)
atau jenis orbital Gaussian exp (-ax ^ 2), disingkat STO dan GTO. Fungsi
gelombang terbentuk dari kombinasi linier dari orbital atom atau lebih
sering dari kombinasi linear dari fungsi dasar. Karena pendekatan ini,
perhitungan HF paling memberikan energi dihitung lebih besar dari batas
Fock Hartree. Himpunan tepat fungsi dasar yang digunakan sering
ditentukan oleh singkatan, seperti STO-3G atau 6-311 g + + **.</span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Sejumlah
jenis perhitungan dimulai dengan perhitungan HF kemudian benar untuk
tolakan elektron-elektron eksplisit, disebut sebagai korelasi. Beberapa
metode ini Mohlar-Plesset teori perturbasi (MPN, dimana n adalah urutan
koreksi), yang Generalized Valence Bond (GVB) metode, Multi-Konfigurasi
Self Konsisten Lapangan (MCSCF), Interaksi konfigurasi (CI) dan teori
Cluster Ditambah (CC). Sebagai kelompok, metode ini disebut sebagai
perhitungan berkorelasi.</span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Sebuah
metode, yang menghindari membuat kesalahan HF di tempat pertama disebut
Quantum Monte Carlo (QMC). Ada beberapa rasa QMC .. variasional, difusi
dan fungsi Green. Metode-metode ini bekerja dengan fungsi gelombang dan
mengevaluasi secara eksplisit berkorelasi integral numerik menggunakan
integrasi Monte Carlo. Perhitungan ini bisa sangat memakan waktu, tetapi
mereka mungkin metode yang paling akurat dikenal saat ini.</span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Metode
ab initio adalah alternatif teori kerapatan fungsional (DFT), di mana
total energi dinyatakan dalam total kepadatan elektron, bukan fungsi
gelombang. Dalam jenis ini perhitungan, ada Hamilton dan perkiraan
ekspresi perkiraan untuk kepadatan total elektron.</span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Sisi baik metode ab initio adalah bahwa mereka <strong style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;">akhirnya</strong> bertemu
dengan solusi yang tepat, setelah semua perkiraan yang dibuat cukup
kecil di besarnya. Namun, konvergensi ini tidak montonic. Kadang-kadang,
perhitungan terkecil memberikan hasil yang terbaik untuk properti
tertentu.</span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Sisi
buruk dari metode ab initio adalah bahwa mereka mahal. Metode ini
sering mengambil sejumlah besar waktu komputer cpu, memori dan ruang
disk. Metode skala HF sebagai N <sup style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;">4,</sup> dimana
N merupakan jumlah fungsi dasar, sehingga perhitungan dua kali lebih
besar membutuhkan 16 kali lebih lama untuk menyelesaikan. perhitungan
Korelasi sering skala jauh lebih buruk dari ini. Dalam prakteknya,
solusi sangat akurat hanya dapat diperoleh ketika molekul berisi
setengah lusin elektron atau kurang.</span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Secara
umum, perhitungan ab initio kualitatif memberikan hasil yang sangat
baik dan dapat memberikan hasil kuantitatif semakin akurat sebagai
molekul yang dimaksud menjadi lebih kecil.</span></span></div>
<h2 style="line-height: 2em; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial,Helvetica,sans-serif; font-size: x-small;">Semiempirical</span></span></h2>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Semiempirical
perhitungan ditetapkan dengan struktur umum yang sama sebagai
perhitungan HF. Dalam kerangka ini, potongan informasi tertentu, seperti
dua integral elektron, yang didekati atau sama sekali dihilangkan.
Dalam rangka untuk mengoreksi kesalahan diperkenalkan dengan
menghilangkan bagian dari perhitungan, metode ini parameter, dengan
melakukan suaian kurva dalam beberapa parameter atau nomor, untuk
memberikan kesepakatan yang terbaik dengan data eksperimen.</span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Sisi baik dari perhitungan semiempirical adalah bahwa mereka jauh lebih cepat daripada perhitungan ab initio.</span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Sisi
buruk dari perhitungan semiempirical adalah bahwa hasilnya bisa tidak
menentu. Jika molekul yang sedang dihitung mirip dengan molekul dalam
basis data yang digunakan untuk parameterisasi metode, maka hasilnya
mungkin akan sangat baik. Jika molekul yang dihitung secara signifikan
berbeda dari apa pun di set parameterisasi, jawaban mungkin sangat
miskin.</span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">perhitungan
Semiempirical telah sangat sukses dalam deskripsi kimia organik, di
mana hanya ada beberapa elemen digunakan secara luas dan molekul yang
ukuran sedang. Namun, metode semiempirical telah dirancang khusus untuk
deskripsi kimia anorganik juga.</span></span></div>
<h2 style="line-height: 2em; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial,Helvetica,sans-serif; font-size: x-small;">Pemodelan solid state</span></span></h2>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Struktur
elektronik dari kristal tak terbatas didefinisikan oleh struktur plot
band, yang memberikan energi orbital elektron untuk setiap titik di
k-ruang, yang disebut zona Brillouin. Sejak ab initio dan perhitungan
semiempirical hasil energi orbital, mereka dapat diterapkan untuk band
perhitungan struktur. Namun, jika memakan waktu untuk menghitung energi
untuk molekul, itu bahkan lebih memakan waktu untuk menghitung energi
untuk daftar poin di zona Brillouin.</span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">perhitungan
struktur Band telah dilakukan untuk sistem yang sangat rumit, namun
perangkat lunak belum cukup otomatis atau cukup cepat sehingga siapa pun
tidak struktur band santai. Jika Anda ingin melakukan perhitungan
struktur band, Anda sebaiknya berharap untuk menempatkan banyak waktu
dalam usaha Anda.</span></span></div>
<h2 style="line-height: 2em; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial,Helvetica,sans-serif; font-size: x-small;">Mekanika molekul</span></span></h2>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Jika
molekul terlalu besar untuk secara efektif menggunakan pengobatan
semiempirical, masih mungkin untuk model perilaku itu dengan menghindari
mekanika kuantum benar-benar. Metode disebut sebagai mekanika molekul
membentuk ekspresi aljabar sederhana untuk energi total senyawa, tanpa
keharusan untuk menghitung fungsi gelombang atau kepadatan total
elektron. Ekspresi energi terdiri dari persamaan klasik sederhana,
seperti persamaan osilator harmonik dalam rangka untuk menggambarkan
energi yang berkaitan dengan ikatan peregangan, membungkuk, rotasi dan
gaya antarmolekul, seperti interaksi van der Waals dan ikatan hidrogen.
Semua konstanta dalam persamaan ini harus diperoleh dari data percobaan
atau perhitungan ab initio.</span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Dalam
metode mekanika molekul, basis data senyawa yang digunakan untuk
parameterisasi metode (satu set parameter dan fungsi yang disebut medan
gaya) sangat penting untuk keberhasilan itu. Dimana sebagai metode
semiempirical mungkin parameter terhadap satu set molekul organik,
sebuah metode mekanika molekul mungkin parameter terhadap kelas khusus
molekul, seperti protein. Medan gaya seperti ini hanya akan diharapkan
memiliki relevansi untuk menjelaskan protein lain.</span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Sisi
baik dari mekanika molekuler adalah bahwa hal itu memungkinkan
pemodelan molekul besar, seperti protein dan segmen dari DNA, sehingga
alat utama ahli biokimia komputasi.</span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Sisi
buruk dari mekanika molekul adalah bahwa ada banyak sifat-sifat kimia
yang bahkan tidak didefinisikan dalam metode ini, seperti keadaan
tereksitasi elektronik. Dalam rangka untuk bekerja dengan sistem yang
sangat besar dan rumit, sering molekul mekanik paket perangkat lunak
yang paling kuat dan paling mudah untuk menggunakan antarmuka grafis.
Karena itu, mekanik kadang-kadang digunakan karena mudah, tetapi belum
tentu cara yang baik untuk menjelaskan sistem.</span></span></div>
<h2 style="line-height: 2em; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial,Helvetica,sans-serif; font-size: x-small;">Dinamika molekul</span></span></h2>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">dinamika
molekul terdiri dari memeriksa perilaku tergantung waktu dari molekul,
seperti gerak getaran atau gerak Brown. Hal ini paling sering dilakukan
dalam sebuah tulisan mekanik klasik mirip dengan perhitungan mekanika
molekul.</span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Penerapan
dinamika molekuler untuk pelarut / sistem terlarut memungkinkan
perhitungan properti seperti koefisien difusi atau fungsi distribusi
radial untuk digunakan dalam perawatan mekanik statistik. Biasanya skema
perhitungan pelarut / zat terlarut adalah bahwa jumlah molekul (mungkin
1000) diberikan beberapa posisi awal dan kecepatan. posisi baru
menghitung waktu kecil kemudian berdasarkan gerakan ini dan proses ini
itterated untuk ribuan langkah untuk membawa sistem untuk keseimbangan
dan memberikan gambaran statistik yang baik dari fungsi distribusi
radial.</span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Dalam
rangka untuk menganalisa getaran molekul tunggal, banyak dinamika
langkah-langkah yang dilakukan, maka data tersebut Fourier berubah
menjadi domain frekuensi. Sebuah puncak yang diberikan dapat dipilih dan
diubah kembali ke domain waktu, untuk melihat apa gerakan pada
frekuensi yang terlihat seperti.</span></span></div>
<h2 style="line-height: 2em; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial,Helvetica,sans-serif; font-size: x-small;">Statistik Mekanika</span></span></h2>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Mekanika
statistika adalah matematika berarti mengekstrapolasi sifat
termodinamika bahan curah dari deskripsi molekul material. Banyak
mekanika statistik masih pada tahap kertas dan pensil teori, karena
mekanika kuantum tidak dapat menyelesaikan persamaan Schrödinger tepat
lagi, mekanika statistik tidak benar-benar memiliki bahkan titik awal
yang baik untuk perlakuan yang benar-benar ketat. Mekanika statistika
perhitungan sering ditempelkan ke akhir perhitungan inito ab untuk
properti fasa gas. Untuk properti fasa terkondensasi, sering molekul
dinamika perhitungan diperlukan dalam rangka untuk melakukan percobaan
komputasi.</span></span></div>
<h2 style="line-height: 2em; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial,Helvetica,sans-serif; font-size: x-small;">Termodinamika</span></span></h2>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Termodinamika
adalah salah satu deskripsi paling baik dikembangkan kimia matematika.
Sangat sering setiap pengobatan termodinamika yang tersisa untuk pena
dan kertas kerja sepele karena banyak aspek kimia begitu akurat
digambarkan dengan ekspresi matematika yang sangat sederhana.</span></span></div>
<h2 style="line-height: 2em; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial,Helvetica,sans-serif; font-size: x-small;">Struktur-Properti Hubungan</span></span></h2>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Struktur-properti
hubungan yang kualitatif atau kuantitatif didefinisikan secara empiris
hubungan antara struktur molekul dan sifat diamati. Dalam beberapa kasus
ini mungkin tampak duplikat hasil mekanik statistik, namun sistem
struktur-properti hubungan tidak perlu didasarkan pada prinsip-prinsip
teoritis ketat.</span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Kasus
yang paling sederhana hubungan struktur-properti aturan jempol
kualitatif. Misalnya, kimia polimer yang berpengalaman mungkin dapat
memprediksi apakah polimer akan halus atau rapuh berdasarkan geometri
dan ikatan monomer.</span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Ketika
struktur-properti hubungan yang disebutkan dalam literatur saat ini,
biasanya menyiratkan hubungan matematis kuantitatif. Hubungan ini paling
sering diperoleh dengan menggunakan software curve fitting untuk
menemukan kombinasi linear dari sifat molekul, yang paling mereproduksi
properti yang diinginkan. Sifat-sifat molekul biasanya diperoleh dari
perhitungan pemodelan molekul. deskriptor molekul lain seperti berat
molekul atau deskripsi topologi juga digunakan.</span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Ketika
properti yang dijelaskan adalah properti fisik, seperti titik didih,
ini disebut sebagai Kuantitatif Struktur-Properti Relationship (QSPR).
Ketika properti yang dijelaskan adalah jenis aktivitas biologis (seperti
aktivitas obat), ini disebut sebagai Kuantitatif Struktur-Aktivitas
Relationship (HKSA).</span></span></div>
<h2 style="line-height: 2em; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial,Helvetica,sans-serif; font-size: x-small;">Perhitungan Simbolik</span></span></h2>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">perhitungan
simbolik dilakukan bila sistem yang terlalu besar untuk sebuah
deskripsi atom-by-atom masih layak pada setiap tingkat pendekatan.
Sebuah contoh mungkin gambaran membran dengan menjelaskan lipid individu
sebagai perwakilan beberapa poligon dengan beberapa ekspresi untuk
energi interaksi. Pengobatan semacam ini digunakan untuk biokimia
komputasi dan bahkan mikrobiologi.</span></span></div>
<h2 style="line-height: 2em; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial,Helvetica,sans-serif; font-size: x-small;">Kecerdasan Buatan</span></span></h2>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Teknik
diciptakan oleh ilmuwan komputer tertarik dalam kecerdasan buatan telah
diterapkan sebagian besar berupa rancangan obat dalam beberapa tahun
terakhir. Metode ini juga pergi dengan nama <strong style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;">De Novo</strong> atau <strong style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;">desain obat rasional.</strong> Skenario
umum adalah bahwa beberapa situs fungsional telah diidentifikasi dan
diinginkan untuk datang dengan struktur molekul yang akan berinteraksi
dengan situs bahwa untuk menghalangi fungsi itu. Daripada memiliki
seorang ahli kimia mencoba ratusan atau ribuan kemungkinan dengan
program mekanika molekul, mekanika molekul dibangun ke dalam program
kecerdasan buatan, yang mencoba jumlah besar “masuk akal” kemungkinan
dalam fasion otomatis. Jumlah teknik untuk menggambarkan “cerdas” bagian
dari operasi ini begitu beragam yang tidak mungkin untuk membuat
generalisasi tentang bagaimana hal ini diimplementasikan dalam program.</span></span></div>
<h2 style="line-height: 2em; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial,Helvetica,sans-serif; font-size: x-small;">Bagaimana melakukan proyek riset komputasi</span></span></h2>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Bila
menggunakan kimia komputasi untuk menjawab pertanyaan kimia, masalah
jelas adalah bahwa Anda perlu tahu bagaimana menggunakan perangkat
lunak. Permasalahan yang terjawab adalah bahwa Anda perlu untuk
mengetahui seberapa baik jawabannya akan menjadi. Berikut adalah daftar
periksa untuk diikuti.</span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><strong style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;">Apa yang Anda ingin tahu?</strong> <strong style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;">Seberapa akurat?</strong> <strong style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;">Mengapa?</strong> Jika Anda tidak dapat menjawab pertanyaan-pertanyaan, maka Anda bahkan tidak memiliki proyek penelitian belum.</span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><strong style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;">Seberapa akurat Anda memprediksi jawabannya akan?</strong> Dalam
kimia analitik, Anda melakukan sejumlah pengukuran identik kemudian
bekerja keluar kesalahan dari deviasi standar. Dengan percobaan
komputasi, melakukan hal yang sama harus selalu memberikan hasil yang
sama persis. Cara yang Anda memperkirakan kesalahan Anda adalah untuk
membandingkan sejumlah perhitungan mirip dengan jawaban eksperimental.
Ada artikel dan kompilasi dari studi ini. Jika tidak ada, Anda akan
perlu menebak metode mana yang harus masuk akal, didasarkan pada asumsi
itu kemudian melakukan penelitian sendiri, sebelum Anda dapat
menerapkannya pada Anda tidak diketahui dan punya ide seberapa bagus
perhitungannya. Ketika seseorang hanya memberitahu Anda dari atas kepala
mereka metode apa yang digunakan, mereka juga memiliki jumlah wajar
dari jenis informasi hafal, atau mereka tidak tahu apa yang mereka
bicarakan. Waspadalah terhadap seseorang yang memberitahu Anda sebuah
program yang diberikan adalah baik hanya karena itu adalah satu-satunya
mereka tahu bagaimana menggunakan, bukan mendasarkan jawaban mereka pada
kualitas hasil.</span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><strong style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;">Berapa lama Anda berharap untuk mengambil?</strong> Jika
dunia yang sempurna, Anda akan memberitahu PC Anda (suara masukan tentu
saja) untuk memberikan solusi yang tepat untuk persamaan Schrödinger
dan melanjutkan hidup Anda. Namun, sering kali perhitungan ab initio
akan memakan sehingga waktu yang dibutuhkan waktu satu dekade untuk
melakukan perhitungan tunggal, jika Anda bahkan memiliki mesin dengan
cukup memori dan ruang disk. Namun, sejumlah metode yang ada karena
setiap yang terbaik untuk situasi tertentu. Caranya adalah dengan
menentukan mana yang terbaik untuk proyek Anda. Sekali lagi, jawabannya
adalah untuk melihat ke dalam literatur dan melihat berapa lama
masing-masing diperlukan. Jika satu-satunya yang Anda tahu adalah
bagaimana skala perhitungan, melakukan perhitungan sederhana yang
mungkin kemudian gunakan persamaan skala untuk memperkirakan berapa lama
waktu yang diperlukan untuk melakukan semacam perhitungan bahwa Anda
telah diprediksi akan memberikan akurasi yang diinginkan.</span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><strong style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;">Apa perkiraan sedang dilakukan?</strong> <strong style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;">Yang signifikan?</strong> Ini
adalah bagaimana Anda menghindari tampak seperti orang bodoh yang
lengkap, ketika anda berhasil melakukan perhitungan yang sampah lengkap.
Sebuah contoh akan mencoba untuk mencari tahu tentang gerak getaran
yang sangat anharmonic, ketika perhitungan menggunakan pendekatan
osilator harmonik.</span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Setelah
Anda akhirnya menjawab semua pertanyaan ini, Anda siap untuk
benar-benar melakukan perhitungan. Sekarang Anda harus menentukan
software apa yang tersedia, berapa biayanya dan bagaimana
menggunakannya. Perhatikan bahwa dua program dari jenis yang sama (ab
initio yaitu) dapat menghitung sifat-sifat yang berbeda, sehingga Anda
harus memastikan program ini tidak persis apa yang Anda inginkan.</span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Ketika
Anda sedang belajar bagaimana menggunakan sebuah program, Anda dapat
mencoba untuk melakukan puluhan perhitungan yang akan gagal karena Anda
dibangun masukan salah. Jangan gunakan molekul proyek Anda untuk
melakukan hal ini. Membuat semua kesalahan Anda dengan sesuatu yang
sangat mudah, seperti molekul air. Dengan begitu Anda tidak membuang
sejumlah besar waktu.</span></span></div>
<h2 style="line-height: 2em; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial,Helvetica,sans-serif; font-size: x-small;">Visualisasi</span></span></h2>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">visualisasi
data adalah proses menampilkan informasi dalam jenis representasi
piktorial atau grafis. Sejumlah program komputer yang sekarang tersedia
untuk menerapkan skema pewarnaan data atau bekerja dengan tiga dimensi
representasi.</span></span></div>
<h2 style="line-height: 2em; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial,Helvetica,sans-serif; font-size: x-small;">Informasi lebih lanjut</span></span></h2>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Untuk gambaran tingkat pengantar kimia komputasi lihat<br style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;" /><cite style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;">GH Grant, WG Richards “Komputasi Kimia” Oxford (1995)</cite></span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Penjelasan lebih rinci tentang teknik kimia komputasi umum yang terkandung dalam<br style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;" /><cite style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;">AR Leach “Prinsip Pemodelan Molekul dan Aplikasi” Addison Wesley Longman (1996)</cite> <em style="font: italic normal normal 1.2em/normal Baskerville, 'Times New Roman', Times, serif; letter-spacing: 0.02em; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;"><br style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;" /><cite style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;">F. Jensen “Pengantar Komputasi Kimia” John Wiley & Sons (1999)</cite></em></span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Ada
banyak buku pada prinsip-prinsip mekanika kuantum dan setiap teks kimia
fisik memiliki pengobatan pengantar. Pekerjaan yang saya listing di
sini adalah volume dua set dengan masing-masing bab dipecah menjadi
bagian dasar dan lanjutan sehingga sangat baik untuk pengguna menengah
dan lanjutan.<br style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;" /><cite style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;">C. Cohen-Tannoudji, B. Diu, F. Laloe “Quantum Mechanics Volume I & II” Wiley-InterScience (1977)</cite></span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Untuk suatu pendahuluan kimia kuantum melihat<br style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;" /><cite style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;">DA McQuarrie “Quantum Kimia” Buku Science University (1983)</cite></span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Sebuah tingkat pascasarjana teks pada kimia kuantum<br style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;" /><cite style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;">DI Levine “Kimia kuantum” Prentice Hall (1991)</cite></span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Seorang sarjana lulusan maju atau teks pada kimia kuantum<br style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;" /><cite style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;">PW Atkins, RS Friedman “Mekanika Quantum Molecular” Oxford (1997)</cite></span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Untuk
metode Monte Carlo kuantum, urutan buku berikut ini dengan menggunakan
ISBN 981-02-0322-5 karena judul terdaftar salah ‘Buku di Print di.<br style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;" /><cite style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;">BL Hammond, WA Lester, Jr, Reynolds PJ “Monte Carlo Metode dalam Ab initio Quantum Chemistry” Dunia Ilmiah (1994)</cite></span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Sebuah artikel review yang baik tentang teori kerapatan fungsional<br style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;" /><cite style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;">T. Ziegler Chem.</cite> <cite style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;">Wahyu 91, 651-667 (1991)</cite></span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Untuk teori kerapatan fungsional lihat<br style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;" /><cite style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;">RG Parr, W. Yang “Fungsi Kepadatan Teori Atom dan Molekul” Oxford (1989)</cite></span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Untuk pemahaman dasar pemodelan solid state lihat<br style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;" /><cite style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;">R. Hoffmann “Solids dan Permukaan: Chemist Lihat A Bonding di Struktur Extended”, VCH (1988)</cite></span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Untuk penjelasan tingkat lulusan mekanika statistik lihat<br style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;" /><cite style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;">DA McQuarrie “Mekanika statistik” Harper Collins (1976)</cite></span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Teks kimia fisik akan mendapatkan sebuah gambaran termodinamika tapi saya akan merekomendasikan<br style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;" /><cite style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;">DI Levine “Kimia Fisik” McGraw Hill (1995)</cite></span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Lain pengenalan bagus untuk kimia komputasi<br style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;" /><cite style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;">S. Profeta, Jr “Kirk-Othmer Ensiklopedia Tambahan Teknologi Kimia”, 315 John Wiley & Sons (1998).</cite></span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Ada
daftar komprehensif dari semua modeling software yang tersedia molekul
dan menggunakan data struktural, bebas atau tidak, dalam lampiran 2 dari<br style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;" /><cite style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;">“Tinjauan dalam Volume Kimia Komputasi 6″ Ed.</cite> <cite style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;">KB Lipkowitz dan Boyd DB, VCH (1995)</cite></span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Ada menulis pada desain komputer dibantu obat di<br style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;" /><a href="gopher://www.ccl.net/00/documents/drug.design.guide" style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; outline-color: initial; outline-style: none; outline-width: initial; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;"><cite style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;">gopher: / / www.ccl.net/00/documents/drug.design.guide</cite></a></span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Matematika tantangan dari kimia teori / komputasi<br style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;" /><a href="http://translate.googleusercontent.com/translate_c?hl=id&langpair=en%7Cid&u=http://www.nap.edu/readingroom/books/mctcc/index.html&rurl=translate.google.co.id&twu=1&usg=ALkJrhj00IASpg9pPRHSnr6febbIYNV3Dw" style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; outline-color: initial; outline-style: none; outline-width: initial; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;"><cite style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;">http://www.nap.edu/readingroom/books/mctcc/index.html</cite></a></span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Sebuah teks online di pemodelan molekul menggunakan mekanika molekul<br style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;" /><a href="http://translate.googleusercontent.com/translate_c?hl=id&langpair=en%7Cid&u=http://www.netsci.org/Science/Compchem/feature01.html&rurl=translate.google.co.id&twu=1&usg=ALkJrhijMBgrOFLzCGt0JnoWFcRlEZ2w_w" style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; outline-color: initial; outline-style: none; outline-width: initial; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;"><cite style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;">http://www.netsci.org/Science/Compchem/feature01.html</cite></a></span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Sebuah Primer Komputasi Kimia<br style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;" /><a href="http://translate.googleusercontent.com/translate_c?hl=id&langpair=en%7Cid&u=http://www.sdsc.edu/GatherScatter/GSwinter96/taylor1.html&rurl=translate.google.co.id&twu=1&usg=ALkJrhilZi3ZPDZjJbnoxAHezo3H3QqD7w" style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; outline-color: initial; outline-style: none; outline-width: initial; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;"><cite style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;">http://www.sdsc.edu/GatherScatter/GSwinter96/taylor1.html</cite></a></span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Sebuah teks online pada kimia komputasi<br style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;" /><a href="http://translate.googleusercontent.com/translate_c?hl=id&langpair=en%7Cid&u=http://www.cryst.bbk.ac.uk/%7Eubcg8ab/course/os_molf.html&rurl=translate.google.co.id&twu=1&usg=ALkJrhjMj-wfPpW_8g3hXoQW6_w7c5BERQ" style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; outline-color: initial; outline-style: none; outline-width: initial; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;"><cite style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;">http://www.cryst.bbk.ac.uk/ ~ ubcg8ab/course/os_molf.html</cite></a></span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Lain teks online di kimia kuantum<br style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;" /><a href="http://translate.googleusercontent.com/translate_c?hl=id&langpair=en%7Cid&u=http://zopyros.ccqc.uga.edu/Docs/Knowledge/Fundamental_Theory/quantrev/node1.html&rurl=translate.google.co.id&twu=1&usg=ALkJrhjA3SGOnAH6Joit5BP4DD1NzVBdmQ" style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; outline-color: initial; outline-style: none; outline-width: initial; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;"><cite style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;">http://zopyros.ccqc.uga.edu/Docs/Knowledge/Fundamental_Theory/quantrev/node1.html</cite></a></span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Pengantar online untuk mekanika kuantum di<br style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;" /><a href="http://translate.googleusercontent.com/translate_c?hl=id&langpair=en%7Cid&u=http://cmcind.far.ruu.nl/webcmc/qm/home.html&rurl=translate.google.co.id&twu=1&usg=ALkJrhiG2B_NiD7DEfaStk5zPjAa68K5PQ" style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; outline-color: initial; outline-style: none; outline-width: initial; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;"><cite style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;">http://cmcind.far.ruu.nl/webcmc/qm/home.html</cite></a></span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><strong style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;">Kutipan:</strong> Artikel ini awalnya diumumkan di web. Hal ini sekarang muncul di cetak di <cite style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;">D.</cite> <cite style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;">Young, Chem.</cite> <cite style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;">Aust.</cite> <cite style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;">11, 5 (1998).</cite></span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Versi
yang diperluas dari artikel ini akan diterbitkan di “Komputasi Kimia:
Panduan Praktis untuk Menerapkan Teknik ke Real Masalah Dunia” oleh
David Young, yang akan tersedia dari John Wiley & Sons pada musim
semi 2001.</span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
</div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-decoration: underline;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">ENGLISH VERSION</span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Introduction to Computational Chemistry</span></span></div>
<div style="line-height: 22px; margin-bottom: 1.2em; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify;">
<span style="background-color: white;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">David Young<br style="margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;" />Cytoclonal Pharmaceutics Inc.</span></span></div>
</div>
</div>
</div>akademik_HIMKAhttp://www.blogger.com/profile/00366070787523409197noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-2766916642261181760.post-74035157866770696332011-12-31T19:51:00.001-08:002011-12-31T19:51:45.817-08:00konten nomer 6<span style="background-attachment: initial; background-clip: initial; background-color: white; background-image: initial; background-origin: initial; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial;">Beri sedikit ulasan mengenai manfaat dari beberapa software kimia komputasi
minimal 5 software
?</span><br />
<br />
<ul>
<li><span style="background-color: white;"><a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2011/12/kalzium-1.html" target="_blank">KALZIUM #1</a> </span></li>
<li><span style="background-color: white;"><a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2011/12/kalzium2.html" target="_blank">KALZIUM#2</a></span></li>
<li><span style="background-color: white;"><a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2011/12/kalzium3.html" target="_blank">KALZIUM#3</a></span></li>
<li><span style="background-color: white;"><a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2011/12/hyperchem1.html" target="_blank">Hyperchem#1</a></span></li>
<li><span style="background-color: white;"><a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2011/12/avogadro.html" target="_blank">Avogadro, untuk edit molekul</a></span></li>
<li><span style="background-color: white;"><a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2011/12/chempup-jmol.html" target="_blank">Chempup (Jmol)</a></span></li>
<li><span style="background-color: white;"><a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2011/12/gelement.html" target="_blank">Chempup (GElement)</a></span></li>
</ul>akademik_HIMKAhttp://www.blogger.com/profile/00366070787523409197noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-2766916642261181760.post-30791569752838966712011-12-31T19:51:00.000-08:002011-12-31T19:51:00.471-08:00GElement<h3 class="post-title entry-title">
[Chempup] GElement
</h3>
<div class="post-header">
</div>
<div style="text-align: left;">
<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEhxn7anTLqu02ru-TqyKbY7VYZ3KuS-23q8Hl5SpTHg9jxbUGNVDgDTIGKGRw3J5j_q-7pFMqauBQHcs8xxySUgQ6g41U_jXf_Dk49y856AF6WwwSDL1hGCaFL8JwB-kAn82tjOEJAJ5AY/s1600/5.png" style="margin-left: 1em; margin-right: 1em;"><img border="0" height="240" src="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEhxn7anTLqu02ru-TqyKbY7VYZ3KuS-23q8Hl5SpTHg9jxbUGNVDgDTIGKGRw3J5j_q-7pFMqauBQHcs8xxySUgQ6g41U_jXf_Dk49y856AF6WwwSDL1hGCaFL8JwB-kAn82tjOEJAJ5AY/s320/5.png" width="320" /></a></div>
<br />
GElement merupakan salah satu perangkat lunak yang di "bundle"
bersama chempup. Software ini adalah tabel periodik unsur yang memiliki
informasi dari setiap unsur yang disajikan. Salah satu kelebihan
software ini adalah kita bisa mendapatkan informasi yang sangat banyak
dari masing-masing unsur.</div>
<div class="separator" style="clear: both; text-align: left;">
Kita bisa mendapatkan informasi umum mengenai unsur tersebut
semisal golongan, periode, penemu dan tempat ditemukannya, lalu kita
juga bisa mengetahui sifat fisik dan atomik dari unsur. Satu hal lagi
yang menarik dari software ini kita dapat mengurutkan unsur-unsur yang
ada di tabel periodik sesuai dengan keinginan kita yaitu dengan mengubah
sudut pandangnya menjadi bentuk tabel.</div>
<div class="separator" style="clear: both; text-align: left;">
</div>
<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEi1hZDOS2IBAw9vbNPk-CcFauwzFhtPajW8T7wEongWeTIXrHuyVj3LQLE_jeaNFBxr2bXapeOvTf2dnfUpz2nQXy6Al4UbXEbAbWZnTfLhHUIXJRnp9uXMcsIqOTSANCBBH821511kxrE/s1600/1.png" style="margin-left: 1em; margin-right: 1em;"><img border="0" height="240" src="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEi1hZDOS2IBAw9vbNPk-CcFauwzFhtPajW8T7wEongWeTIXrHuyVj3LQLE_jeaNFBxr2bXapeOvTf2dnfUpz2nQXy6Al4UbXEbAbWZnTfLhHUIXJRnp9uXMcsIqOTSANCBBH821511kxrE/s320/1.png" width="320" /></a></div>
<br />
<br />
<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEgZxiE-M-ZUhBFQISSzEYiiaB3tAhAyNckt_mo2a0uy_b7Y8sdN8jY-fEkGfgJMJFuZ5wK1A7MifsPiuCdfnEsqIOYf3O9t3K2BdcbASTqR2KUDUCs0DgwefQ_H81m8zytYkEuliJ1vMzQ/s1600/2.png" style="margin-left: 1em; margin-right: 1em;"><img border="0" height="300" src="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEgZxiE-M-ZUhBFQISSzEYiiaB3tAhAyNckt_mo2a0uy_b7Y8sdN8jY-fEkGfgJMJFuZ5wK1A7MifsPiuCdfnEsqIOYf3O9t3K2BdcbASTqR2KUDUCs0DgwefQ_H81m8zytYkEuliJ1vMzQ/s400/2.png" width="400" /></a></div>
<br />
<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEjWYuKngKmVM8dO1n5yaFMN9BuhPtLAybwvM9BVSboZ3MB0w6jTQjILh82rOtMJf6A6FwblkGtwiLXThbkqn7jTauKXr3zaC_gu6q78wiJExCVGYLEaMJ4e2I6lq8_iHXgizuSS2-xX0Eo/s1600/3.png" style="margin-left: 1em; margin-right: 1em;"><img border="0" height="300" src="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEjWYuKngKmVM8dO1n5yaFMN9BuhPtLAybwvM9BVSboZ3MB0w6jTQjILh82rOtMJf6A6FwblkGtwiLXThbkqn7jTauKXr3zaC_gu6q78wiJExCVGYLEaMJ4e2I6lq8_iHXgizuSS2-xX0Eo/s400/3.png" width="400" /></a></div>
<br />
<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEhkYDQkxt_QzrA-Mo74tAb3M2FtcllIh9yXZNfDebRexzlIjOLkYUtznjRQIBcL1aK4clq7v1JEgQwpgsc3QXJSnq-_oRT0_aJfEcN84EHVbjbGO8Pz5-0OPbJoFixxUbqT2-4uqKXiga4/s1600/4.png" style="margin-left: 1em; margin-right: 1em;"><img border="0" height="240" src="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEhkYDQkxt_QzrA-Mo74tAb3M2FtcllIh9yXZNfDebRexzlIjOLkYUtznjRQIBcL1aK4clq7v1JEgQwpgsc3QXJSnq-_oRT0_aJfEcN84EHVbjbGO8Pz5-0OPbJoFixxUbqT2-4uqKXiga4/s320/4.png" width="320" /></a></div>
<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
</div>
<div class="separator" style="clear: both; text-align: left;">
Gambar : Pribadi</div>akademik_HIMKAhttp://www.blogger.com/profile/00366070787523409197noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-2766916642261181760.post-54211043550504284772011-12-31T19:48:00.000-08:002011-12-31T19:48:11.594-08:00chempup Jmol<h3 class="post-title entry-title">
[Chempup] JMol
</h3>
<div class="post-header">
</div>
<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="http://2.bp.blogspot.com/-8vMw-0uOawg/Tvb2lM-LotI/AAAAAAAAAzc/4IxEZEaL0AI/s1600/Jmol_icon_128.png" style="margin-left: 1em; margin-right: 1em;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><img border="0" src="http://2.bp.blogspot.com/-8vMw-0uOawg/Tvb2lM-LotI/AAAAAAAAAzc/4IxEZEaL0AI/s1600/Jmol_icon_128.png" /></span></a></div>
<span class="Apple-style-span" style="background-color: white; font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><br /></span><br />
<span class="Apple-style-span" style="background-color: white; font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">
Jmol adalah software visualisasi struktur molekul dalam tiga dimensi
yang ditulis dengan program Java. Fitur yang dimiliki software ini
adalah membaca berbagai jenis file input dan output dari program-program
kimia kuantum seperti VASP, serta animasi file multi-frame dan modus
normal yang dihitung dari program kuantum.</span><br />
<span class="Apple-style-span" style="background-color: white; font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><br /></span><br />
<span class="Apple-style-span" style="background-color: white; color: #333333; font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">
Jmol ini gartis, merupakan penampil strukutur molekul tiga dimensi
(molecule viewer) yang dapat digukan secara bebas oleh siapapun yang
menekuni bidang kimia dan biokimia. Aplikasi ini merupakan
cross-platform, berjalan di sistem operasi Windows, Mac OS X, dan Linux /
Unix. Fitur yang dimilikinya di antaranya membaca berbagai jenis file
dan output dari program kimia kuantum, dan animasi file multi-frame.
JmolApplet adalah applet web browser yang dapat diintegrasikan ke dalam
halaman situs. Aplikasi Jmol adalah aplikasi Java standalone yang
berjalan di desktop. JmolViewer merupakan seperangkat alat yang dapat
diintegrasikan ke dalam aplikasi Java lainnya.</span><br />
<span class="Apple-style-span" style="background-color: white; color: #333333; font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Untuk
menggunakannya silahkan download dan ekstrak file downlad-annya. Klik
file Jmol.jar (di PC mestinya tersedia Javaruntime terlebih dahulu).
Buka file yang support untuk dibuka dengan Jmol.</span><br />
<span class="Apple-style-span" style="background-color: white; color: #333333; font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">tkp <a href="http://sourceforge.net/projects/jmol/files/Jmol/Version%2012.0/Version%2012.0.46/Jmol-12.0.46-binary.zip/download">http://sourceforge.net/projects/jmol/files/Jmol/Version%2012.0/Version%2012.0.46/Jmol-12.0.46-binary.zip/download</a></span><br />
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><br /></span><br />
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Sumber : <a href="http://indosharing.net/showthread.php?t=4416&page=1">http://indosharing.net/showthread.php?t=4416&page=1</a></span><br />
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"> <a href="http://pustakaku.net/edu-software/jmol/">http://pustakaku.net/edu-software/jmol/</a></span><br />
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><br /></span><br />
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Gambar : Pribadi</span>akademik_HIMKAhttp://www.blogger.com/profile/00366070787523409197noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-2766916642261181760.post-46636865579185603572011-12-31T19:44:00.001-08:002011-12-31T19:44:45.333-08:00avogadro<h3 class="post-title entry-title">
Avogadro, Software Kimia Gratis untuk Edit Molekul
</h3>
<div class="post-header">
</div>
<br />
<div class="entry-content" style="background-attachment: initial; background-clip: initial; background-color: white; background-image: initial; background-origin: initial; border-bottom-width: 0px; border-color: initial; border-left-width: 0px; border-right-width: 0px; border-style: initial; border-top-width: 0px; clear: both; color: #333333; font-family: Georgia, 'Bitstream Charter', serif; font-size: 16px; line-height: 24px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 12px; vertical-align: baseline;">
<div style="background-attachment: initial; background-clip: initial; background-color: transparent; background-image: initial; background-origin: initial; border-bottom-width: 0px; border-color: initial; border-left-width: 0px; border-right-width: 0px; border-style: initial; border-top-width: 0px; margin-bottom: 24px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: right; vertical-align: baseline;">
</div>
<div style="background-attachment: initial; background-clip: initial; background-color: transparent; background-image: initial; background-origin: initial; border-bottom-width: 0px; border-color: initial; border-left-width: 0px; border-right-width: 0px; border-style: initial; border-top-width: 0px; margin-bottom: 24px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify; vertical-align: baseline;">
<a href="http://urip.files.wordpress.com/2011/06/avogadro.jpg" style="background-attachment: initial; background-clip: initial; background-color: transparent; background-image: initial; background-origin: initial; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial; border-bottom-width: 0px; border-color: initial; border-left-width: 0px; border-right-width: 0px; border-style: initial; border-top-width: 0px; color: #0066cc; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; vertical-align: baseline;"><img alt="" class="alignleft size-full wp-image-5162" src="http://urip.files.wordpress.com/2011/06/avogadro.jpg?w=640" style="background-attachment: initial; background-clip: initial; background-color: transparent; background-image: initial; background-origin: initial; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial; border-bottom-style: none; border-bottom-width: 0px; border-color: initial; border-color: initial; border-left-style: none; border-left-width: 0px; border-right-style: none; border-right-width: 0px; border-style: initial; border-top-style: none; border-top-width: 0px; border-width: initial; display: inline; float: left; height: auto; margin-bottom: 12px; margin-left: 0px; margin-right: 24px; margin-top: 4px; max-width: 100%; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; vertical-align: baseline; width: auto;" title="avogadro" /></a>Avogadro
adalah software kimia gratis, open source, tersedia dalam berbagai
paltform sistem operasi merupakan editor molekul yang dirancang untuk
digunakan secara fleksibel dalam kimia komputasi, pemodelan molekul,
bioinformatika, ilmu material, dan bidang terkait lainnya. Avogadro yang
tersedia dapat dijalankan pada sistem Windows, Linux, dan Mac OS X.
Kode sumber sumber tersedia di bawah GPL GNU. Menurut saya aplikasi ini
sangat bagus dengan kelebihan ukuran filenya sangat kecil (tidak lebih
dari 10 MB). Tampilan yang bagus dan sudah bisa dihandle oleh perangkat
keras kebanyakan sekarang.</div>
<div style="background-attachment: initial; background-clip: initial; background-color: transparent; background-image: initial; background-origin: initial; border-bottom-width: 0px; border-color: initial; border-left-width: 0px; border-right-width: 0px; border-style: initial; border-top-width: 0px; margin-bottom: 24px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; vertical-align: baseline;">
Apa yang dapat dilakukan Avogadro?<br /><span id="more-5160" style="background-attachment: initial; background-clip: initial; background-color: transparent; background-image: initial; background-origin: initial; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial; border-bottom-width: 0px; border-color: initial; border-left-width: 0px; border-right-width: 0px; border-style: initial; border-top-width: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; vertical-align: baseline;"></span></div>
<ul style="background-attachment: initial; background-clip: initial; background-color: transparent; background-image: initial; background-origin: initial; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial; border-bottom-width: 0px; border-color: initial; border-left-width: 0px; border-right-width: 0px; border-style: initial; border-top-width: 0px; list-style-image: initial; list-style-position: initial; list-style-type: square; margin-bottom: 24px; margin-left: 1.5em; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; vertical-align: baseline;">
<li style="background-attachment: initial; background-clip: initial; background-color: transparent; background-image: initial; background-origin: initial; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial; border-bottom-width: 0px; border-color: initial; border-left-width: 0px; border-right-width: 0px; border-style: initial; border-top-width: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify; vertical-align: baseline;">Dapat melakukan pengunduhan secara langsung dari <a href="http://en.wikipedia.org/wiki/Protein_Data_Bank" style="background-attachment: initial; background-clip: initial; background-color: transparent; background-image: initial; background-origin: initial; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial; border-bottom-width: 0px; border-color: initial; border-left-width: 0px; border-right-width: 0px; border-style: initial; border-top-width: 0px; color: #0066cc; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; vertical-align: baseline;" target="_blank">PDB (protein data bank) </a>atau PubChem (database dari molekul kimia dan aktivitasnya terhadap uji biologis)</li>
<li style="background-attachment: initial; background-clip: initial; background-color: transparent; background-image: initial; background-origin: initial; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial; border-bottom-width: 0px; border-color: initial; border-left-width: 0px; border-right-width: 0px; border-style: initial; border-top-width: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify; vertical-align: baseline;">Inovatif
“auto-optimation”, alat yang memungkinkan Anda untuk terus membangun
dan memodifikasi, selama optimasi mekanika molekular.</li>
<li style="background-attachment: initial; background-clip: initial; background-color: transparent; background-image: initial; background-origin: initial; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial; border-bottom-width: 0px; border-color: initial; border-left-width: 0px; border-right-width: 0px; border-style: initial; border-top-width: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify; vertical-align: baseline;">Antarmuka untuk banyak paket komputasi umum.</li>
<li style="background-attachment: initial; background-clip: initial; background-color: transparent; background-image: initial; background-origin: initial; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial; border-bottom-width: 0px; border-color: initial; border-left-width: 0px; border-right-width: 0px; border-style: initial; border-top-width: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify; vertical-align: baseline;">Plugin yang memungkinkan Avogadro untuk diperpanjang dan disesuaikan.</li>
<li style="background-attachment: initial; background-clip: initial; background-color: transparent; background-image: initial; background-origin: initial; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial; border-bottom-width: 0px; border-color: initial; border-left-width: 0px; border-right-width: 0px; border-style: initial; border-top-width: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify; vertical-align: baseline;">Embedded interpreter Python.</li>
<li style="background-attachment: initial; background-clip: initial; background-color: transparent; background-image: initial; background-origin: initial; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial; border-bottom-width: 0px; border-color: initial; border-left-width: 0px; border-right-width: 0px; border-style: initial; border-top-width: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify; vertical-align: baseline;">Terjemahan
tersedia dalam 19 bahasa lebih, termasuk antar muka juga sudah bisa
berbahasa Indonesia, tersisa hanya beberapa bagian saja yang belum
dialihbahasakan.</li>
<li style="background-attachment: initial; background-clip: initial; background-color: transparent; background-image: initial; background-origin: initial; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial; border-bottom-width: 0px; border-color: initial; border-left-width: 0px; border-right-width: 0px; border-style: initial; border-top-width: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify; vertical-align: baseline;">Cross-Platform: Molekul pembangun / editor untuk Windows, Linux, dan Mac OS X.</li>
<li style="background-attachment: initial; background-clip: initial; background-color: transparent; background-image: initial; background-origin: initial; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial; border-bottom-width: 0px; border-color: initial; border-left-width: 0px; border-right-width: 0px; border-style: initial; border-top-width: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify; vertical-align: baseline;">Intuitif: Dibangun untuk dapat digunakan dengan mudah bagi mahasiswa dan peneliti lebioh lanjut.</li>
<li style="background-attachment: initial; background-clip: initial; background-color: transparent; background-image: initial; background-origin: initial; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial; border-bottom-width: 0px; border-color: initial; border-left-width: 0px; border-right-width: 0px; border-style: initial; border-top-width: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify; vertical-align: baseline;">Cepat: Mendukung multi-threaded rendering dan komputasi.</li>
<li style="background-attachment: initial; background-clip: initial; background-color: transparent; background-image: initial; background-origin: initial; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial; border-bottom-width: 0px; border-color: initial; border-left-width: 0px; border-right-width: 0px; border-style: initial; border-top-width: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify; vertical-align: baseline;">Extensible: Plugin arsitektur bagi pengembang, termasuk rendering, tool interaktif, perintah, dan skrip Python.</li>
<li style="background-attachment: initial; background-clip: initial; background-color: transparent; background-image: initial; background-origin: initial; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial; border-bottom-width: 0px; border-color: initial; border-left-width: 0px; border-right-width: 0px; border-style: initial; border-top-width: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify; vertical-align: baseline;">Fleksibel:
Fitur OpenBable yang dapat digunakan untuk impor file-file kimia lain,
input untuk beberapa paket kimia komputasi, kristalografi, dan
biomolekul.</li>
</ul>
<div style="background-attachment: initial; background-clip: initial; background-color: transparent; background-image: initial; background-origin: initial; border-bottom-width: 0px; border-color: initial; border-left-width: 0px; border-right-width: 0px; border-style: initial; border-top-width: 0px; margin-bottom: 24px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; vertical-align: baseline;">
Sumber untuk men-download silahkan <a href="http://sourceforge.net/projects/avogadro/files/avogadro/1.0.3/" style="background-attachment: initial; background-clip: initial; background-color: transparent; background-image: initial; background-origin: initial; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial; border-bottom-width: 0px; border-color: initial; border-left-width: 0px; border-right-width: 0px; border-style: initial; border-top-width: 0px; color: #0066cc; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; vertical-align: baseline;" target="_blank">klik di sini</a>.<br />Tutorialnya dapat dilihat atau diunduh dari sini. Ada juga tutorial dalam bentuk videonya, silahkan kunjungi <a href="http://avogadro.openmolecules.net/wiki/Tutorials" style="background-attachment: initial; background-clip: initial; background-color: transparent; background-image: initial; background-origin: initial; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial; border-bottom-width: 0px; border-color: initial; border-left-width: 0px; border-right-width: 0px; border-style: initial; border-top-width: 0px; color: #0066cc; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; vertical-align: baseline;" target="_blank">http://avogadro.openmolecules.net/wiki/Tutorials</a></div>
<div style="background-attachment: initial; background-clip: initial; background-color: transparent; background-image: initial; background-origin: initial; border-bottom-width: 0px; border-color: initial; border-left-width: 0px; border-right-width: 0px; border-style: initial; border-top-width: 0px; margin-bottom: 24px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; vertical-align: baseline;">
<a href="http://avogadro.openmolecules.net/wiki/Tutorials" style="background-attachment: initial; background-clip: initial; background-color: transparent; background-image: initial; background-origin: initial; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial; border-bottom-width: 0px; border-color: initial; border-left-width: 0px; border-right-width: 0px; border-style: initial; border-top-width: 0px; color: #0066cc; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; vertical-align: baseline;" target="_blank"><img alt="" class="aligncenter size-full wp-image-5164" height="463" src="http://urip.files.wordpress.com/2011/06/tutorial-avogadro.jpg?w=640&h=463" style="background-attachment: initial; background-clip: initial; background-color: transparent; background-image: initial; background-origin: initial; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial; border-bottom-style: none; border-bottom-width: 0px; border-color: initial; border-color: initial; border-left-style: none; border-left-width: 0px; border-right-style: none; border-right-width: 0px; border-style: initial; border-top-style: none; border-top-width: 0px; border-width: initial; clear: both; display: block; height: auto; margin-bottom: 12px; margin-left: auto; margin-right: auto; margin-top: 0px; max-width: 100%; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; vertical-align: baseline; width: auto;" title="tutorial avogadro" width="640" /></a></div>
<div style="background-attachment: initial; background-clip: initial; background-color: transparent; background-image: initial; background-origin: initial; border-bottom-width: 0px; border-color: initial; border-left-width: 0px; border-right-width: 0px; border-style: initial; border-top-width: 0px; margin-bottom: 24px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify; vertical-align: baseline;">
Contoh salah satu tutorial yang tersedia di Youtube adalah seperti di bawah ini. Silahkan mencari tutorial lainnya di sana.</div>
<div style="background-attachment: initial; background-clip: initial; background-color: transparent; background-image: initial; background-origin: initial; border-bottom-width: 0px; border-color: initial; border-left-width: 0px; border-right-width: 0px; border-style: initial; border-top-width: 0px; margin-bottom: 24px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify; vertical-align: baseline;">
<span class="embed-youtube" style="background-attachment: initial; background-clip: initial; background-color: transparent; background-image: initial; background-origin: initial; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial; border-bottom-width: 0px; border-color: initial; border-left-width: 0px; border-right-width: 0px; border-style: initial; border-top-width: 0px; display: block; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; margin-top: 0px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: center; vertical-align: baseline;"></span></div>
<div style="background-attachment: initial; background-clip: initial; background-color: transparent; background-image: initial; background-origin: initial; border-bottom-width: 0px; border-color: initial; border-left-width: 0px; border-right-width: 0px; border-style: initial; border-top-width: 0px; margin-bottom: 24px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify; vertical-align: baseline;">
Software ini adalah hasil proyek komunitas dengan banyak kontributor,
makanya disebut open source, siapapun boleh memberikan umpan balik,
melaporkan bug dan kode agar menjadi lebih baik.</div>
<div style="background-attachment: initial; background-clip: initial; background-color: transparent; background-image: initial; background-origin: initial; border-bottom-width: 0px; border-color: initial; border-left-width: 0px; border-right-width: 0px; border-style: initial; border-top-width: 0px; margin-bottom: 24px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify; vertical-align: baseline;">
Karena ukurannya yang sangat kecil dan tidak terlalu memerlukan hardware
dengan spek yang tinggi dan mahal maka sangat cocok digunakan saat
pelajaran kimia pada materi-materi tertentu, dapat digunakan secara
langsung di kelas. Tentu kita harus memahami berbagai seluk-beluknya.
Ini adalah alternatif pembelajaran yang mengajak siswa mengamati secara
langsung proses dan sifat kimia suatu zat.</div>
<div style="background-attachment: initial; background-clip: initial; background-color: transparent; background-image: initial; background-origin: initial; border-bottom-width: 0px; border-color: initial; border-left-width: 0px; border-right-width: 0px; border-style: initial; border-top-width: 0px; margin-bottom: 24px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: justify; vertical-align: baseline;">
sumber : <a href="http://urip.wordpress.com/2011/06/11/avogadro-software-kimia-gratis-untuk-edit-molekul/" style="text-align: -webkit-auto;">http://urip.wordpress.com/2011/06/11/avogadro-software-kimia-gratis-untuk-edit-molekul/</a></div>
</div>akademik_HIMKAhttp://www.blogger.com/profile/00366070787523409197noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-2766916642261181760.post-63303736187182838692011-12-31T19:42:00.001-08:002011-12-31T19:42:19.370-08:00Hyperchem#1<h3 class="post-title entry-title">
Hyperchem #1
</h3>
<div class="post-header">
</div>
<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEjn_u-KavJEcMkztTgnco5vs0mhz79-pgr1eruCLV2WRjKGgjVUcsY5hs7p6kCRL8PysBpwFsErqaGtg2LyU6JWCwb7TbT_3dUk1W-AcmfjxPPizRYzq4W-BwUBkNLnA-BmZ6WT0dQf8co/s1600/200653038418473.jpg" style="margin-left: 1em; margin-right: 1em;"><img border="0" height="300" src="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEjn_u-KavJEcMkztTgnco5vs0mhz79-pgr1eruCLV2WRjKGgjVUcsY5hs7p6kCRL8PysBpwFsErqaGtg2LyU6JWCwb7TbT_3dUk1W-AcmfjxPPizRYzq4W-BwUBkNLnA-BmZ6WT0dQf8co/s400/200653038418473.jpg" width="400" /></a></div>
<span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><span style="background-color: white; line-height: 19px; text-align: justify;"><br /></span></span><br />
<span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><span style="background-color: white; line-height: 19px; text-align: justify;">Program </span><span style="background-color: white; color: #3366ff; font-style: italic; line-height: 19px; text-align: justify;">Hyperchem</span><span style="background-color: white; line-height: 19px; text-align: justify;">, merupakan program kimia aplikasi 32 bit, yang dikembangkan oleh </span><span style="background-color: white; color: #3366ff; font-style: italic; line-height: 19px; text-align: justify;">HyperCube Inc</span><span style="background-color: white; line-height: 19px; text-align: justify;">,
untuk sistem operasi Windows 95/98, Windows NT, Windows XP, Windows
Vista, Windows 7 dan Linux. HyperChem merupakan program handal dari
pemodelan molekul yang telah diakui mudah digunakan, fleksibel dan
berkualitas, dengan menggunakan visualisasi dan animasi tiga dimensi
hasil perhitungan kimia kuantum, mekanika dan dinamika molekuler,
menjadikan HyperChem terasa sangat mudah digunakan dibandingkan dengan
program kimia kuantum yang lain.<br />program kimia menyediakan fasilitas pembuatan model tiga dimensi (3D), perhitungan mekanika molekuler dan mekanika kuantum (</span><span style="background-color: white; font-style: italic; line-height: 19px; text-align: justify;">semiempiris dan ab initio</span><span style="background-color: white; line-height: 19px; text-align: justify;">), disamping itu tersedia pula database dan program simulate Monte Carlo dan molecular dynamic (MD)<br />Fasilitas yang disediakan oleh program standar ini adalah:</span></span><br />
<ul style="background-color: white; line-height: 19px; text-align: justify;">
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Input Struktur dan Manipulasi (Structure Input and Manipulation)</span></li>
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Display Molekul (Molecular Display)</span></li>
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Kimia Komputasi (Computational Chemistry)</span></li>
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Metode Komputasi (Computational Methods)</span></li>
</ul>
<span style="background-color: white; line-height: 19px; text-align: justify;"><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><span style="color: #3333ff; font-weight: bold;">Input Struktur dan Manipulasi</span></span></span><ol style="background-color: white; line-height: 19px; text-align: justify;">
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Mengambar
molekul dengan program ini relatif sederhana. Pilih unsur dari tabel
periodik, kemudian di click dan ditarik dengan mouse, dengan mouse kita
dapat mengontrol rotasi di sekitar ikatan, mengatur stereokimia molekul
dan mengubah struktur.</span></li>
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Dengan
mouse-controlled tools kita dapat melakukan seleksi, rotasi dan
translasi serta mengubah ukuran struktur. Setting pada menu harus
dimodifikasi terlebih dahulu untuk mengontrol operasi dari tools.</span></li>
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Untuk mengkonversi struktur 2D menjadi struktur 3D dapat dikerjakan dengan <span style="font-style: italic;">Hyperchem's model builder</span>.</span></li>
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Penggunaan
constraint terhadap struktur relatif mudah, kita dapat melakukan
constraint terhadap panjang ikatan, sudut ikatan, sudut torsi dan juga
terhadap atom yang diinginkan.</span></li>
</ol>
<span style="background-color: white; line-height: 19px; text-align: justify;"><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><span style="color: #3333ff; font-weight: bold;"><br />Display Molekuler (</span><span style="color: #3333ff; font-style: italic; font-weight: bold;">Molecular Display</span><span style="color: #3333ff; font-weight: bold;">)</span></span></span><ol style="background-color: white; line-height: 19px; text-align: justify;">
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Pilihan rendering: <span style="font-style: italic;">ball and stick</span>, <span style="font-style: italic;">fused CPK spheres</span> dengan pilihan<span style="font-style: italic;">shading and highighting</span>, juga <span style="font-style: italic;">vdw dots</span>, <span style="font-style: italic;">cylinders</span> dan <span style="font-style: italic;">overlapping spheres</span>.</span></li>
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Ribbon rendering untuk protein <span style="font-style: italic;">backbones</span>, dengan pilihan <span style="font-style: italic;">sidechain display</span>.</span></li>
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">3D
isosurfaces atau 2D contour plots untuk: muatan total, kerapatan
muatan, orbital molekul, kerapatan spin, potensial elektrostatik (ESP),
ESP dipetakan pada 3D charge density surface.</span></li>
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Pilihan isosurface rendering: wire mesh. Jorgensen-Salem, transparent dan solid surfaces, gouraud shaded surface.</span></li>
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Selama
simulasi dapat ditampilkan rerata energi kinetik, energi potensial,
energi total dan parameter molekul seperti panjang ikatan, sudut ikatan,
dan sudut torsi.</span></li>
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Animasi mode vibrasi dari spektra IR</span></li>
</ol>
<span style="background-color: white; line-height: 19px; text-align: justify;"><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><span style="font-weight: bold;"><br /><span style="color: #3333ff;">Kimia Komputasi</span></span><br />Dengan
HyperChem kita dapat mengeksplorasi model energi permukaan potensial
secara klasik atau kuantum dengan single point, optimasi geometri atau
perhitungan dalam mencari keadaan transisi, selain itu kita dapat juga
mempelajari pengaruh gerakan termal dengan molecular dynamics, Langevin
dynamic atau simulasi Metropolis Monte Carlo.<br /><br /><span style="color: #3333ff; font-weight: bold;">Jenis Perhitungan</span><br />Terdapat
beberapa tipe perhitungan, antara lain kalkulasi single point, optimasi
geometri, frekuensi vibrasi, pencarian keadaan transisi, simulasi
dinamika molekuler, simulasi dinamika Langevin dan simulasi Monte Carlo.</span></span><ol style="background-color: white; line-height: 19px; text-align: justify;">
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Perhitungan single point dapat digunakan untuk menentukan energi molekul dari struktur yang ditentukan (tanpa proses optimasi)</span></li>
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Perhitungan
optimasi geometri menggunakan algoritma minimasi energi untuk
mendapatkan struktur paling stabil. tersedia 5 algoritma minimasi.</span></li>
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Perhitungan
frekuensi vibrational dimaksudkan untuk mencari mode vibrasi normal
dari suatu struktur teroptimisasi. Spektrum teroptimasi dapat
ditampilkan dan gerakan vibrasi yang berkaitan dengan transisi spesifik
dapat dianimasikan.</span></li>
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Pencarian
keadaan transisi dilakukan dengan menentukan struktur metastabil yang
bersesuaian dengan keadaan transition menggunakan metode Eigenvector
Following atau Synchronous Transit. Sifat-sifat molekulernya kemudian
dapat dihitung, dua metode untuk melokasikan keadaan transisi
diimplementasikan di dalam HyperChem 5.</span></li>
</ol>
<ul style="background-color: white; line-height: 19px; text-align: justify;">
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Metode
Eigenvector Following sangat cocok digunakan untuk prosses unimolekular
atau setiap sistem molekular yang mode vibrasi naturalnya cengerung
menuju ke suatu keadaan transition.</span></li>
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Metode
synchronous transit khususnya berguna jika reaktan dan produk sangat
berbeda, terdapat dua metodologi Synchronous transit yang
diimplementasikan di dalam HyperChem yaitu <span style="font-style: italic;">Linear Synchronous Transit</span> (LST) dan <span style="font-style: italic;">Quadratic Synchronous Transit </span>(QST).</span></li>
</ul>
<ol style="background-color: white; line-height: 19px; text-align: justify;">
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Simulasi
Molecular dynamics menghitung trajektori klasik untuk sistem molekular.
Waktu pemanasan, keseimbangan dan pendinginan dapat diterapkan dalam
simulasi ini juga dapat digunakan untuk proses-proses yang bergantung
pada perubahan waktu. Simulasi dapat dilakukan pada energi konstan atau
temperatur konstan.</span></li>
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Langevin dynamic simulations untuk memodelkan secara implisit molekul-molekul pelarut.</span></li>
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Simulasi
Monte Carlo Metropolis berguna untuk mengeksplarasi konfigurasi yang
mungkin dari suatu sistem dalam keadaan keseimbangan dan menentukan
sifat sistem yang dinyatakan sebagai harga rata-rata untuk seluruh
sistem yang sudah berada dalam keadaan keseimbangan.</span></li>
</ol>
<span style="background-color: white; line-height: 19px; text-align: justify;"><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><br /><span style="color: #3333ff; font-weight: bold;">Hasil Perhitungan dengan HyperChem</span><br />Prediksi:<br />HyperChem dapat digunakan untuk menentukan berapa sifat struktur antara lain:</span></span><ol style="background-color: white; line-height: 19px; text-align: justify;">
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Stabilitas relatif dari beberapa isomer</span></li>
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Panas pembentukan</span></li>
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Energi aktivasi</span></li>
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Muatan atom</span></li>
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Beda energi HOMO-LUMO</span></li>
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Potensial ionisasi</span></li>
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Afinitas elektron</span></li>
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Momen dipol</span></li>
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Tingkat energi elektronik</span></li>
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Energi korelasi elektron MP2</span></li>
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Energi keadaan tereksitasi CI</span></li>
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Sifat dan struktur keadaan transisi</span></li>
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Energi interaksi non-bonded</span></li>
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Spektra serapan UV-VIS</span></li>
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Spektra absorpsi IR</span></li>
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Pengaruh isotop pada vibrasi</span></li>
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Spektra serapan IR</span></li>
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Efek collision pada sifat struktur</span></li>
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Stabilitas dari kluster</span></li>
</ol>
<span style="background-color: white; line-height: 19px; text-align: justify;"><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><span style="font-weight: bold;"><br /><span style="color: #3333ff;">Simulasi</span></span></span></span><ol style="background-color: white; line-height: 19px; text-align: justify;">
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Interaksi docking</span></li>
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Pengaruh temperatur pada gerakan molekul</span></li>
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Pengaruh pelarut pada struktur dan dinamika</span></li>
<li><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Interaksi intermolekuar pada kluster</span></li>
</ol>
<span style="background-color: white; line-height: 19px; text-align: justify;"><span style="color: #3333ff; font-style: italic;"><span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Refrensi: Harno D Pranowo, Kimia Komputasi, Jurusan Kimia FMIPA UGM, Yogyakarta.</span></span></span>akademik_HIMKAhttp://www.blogger.com/profile/00366070787523409197noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-2766916642261181760.post-40774690563344657172011-12-31T19:40:00.001-08:002011-12-31T19:40:03.742-08:00KALZIUM#3<h3 class="post-title entry-title">
Kalzium #3
</h3>
<div class="post-header">
</div>
<br />
<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="http://urip.files.wordpress.com/2010/09/intro-calculat1.png" style="color: #78a515; font-weight: bold; margin-left: 1em; margin-right: 1em; text-decoration: none;"><img alt="" class="aligncenter size-full wp-image-2464" height="475" src="http://urip.files.wordpress.com/2010/09/intro-calculat1.png" style="border-bottom-width: 0px; border-color: initial; border-color: initial; border-left-width: 0px; border-right-width: 0px; border-style: initial; border-top-width: 0px; display: block; max-width: 100%; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;" width="640" /></a></div>
<div style="background-color: white; font-family: 'Lucida Grande', 'Trebuchet MS', Verdana, Helvetica, Arial, sans-serif; font-size: 13px; line-height: 1.4; text-align: justify;">
Kalkulator molekuler Kalzium merupakan salah satu fitur alat (<em>tool</em>) yang ada pada <a href="http://edu.kde.org/kalzium/" style="color: #78a515; font-weight: bold; text-decoration: none;" target="_blank">Kazium</a>.
Sangat sesuai digunakan untuk teman belajar bagi siswa untuk mengecek
ulang hasil kerjanya sehingga diperoleh jawaban yang tepat selama
berlatih mengerjakan soal.</div>
<div style="background-color: white; font-family: 'Lucida Grande', 'Trebuchet MS', Verdana, Helvetica, Arial, sans-serif; font-size: 13px; line-height: 1.4; text-align: justify;">
Kalkulator ini memiliki fungsi untuk melakukan perhitungan dengan berbagai tugas, di antaranya penghitung massa molekuler (<em>Molecular </em><em>Mass </em><em>Calculator</em>), penghitung konsentrasi (<em>Concentrasions Calculator</em>), penghitung yang ada kaitannya dengan inti atom (<em>Nuclear Calculator</em>), <em>penghitung gas (Gas Calculator).</em> Sementara ini penyeimbang perasamaan reaksi (<em>Equation Balancer</em>) diletakkan pada tool yang berbeda.</div>
<div style="background-color: white; font-family: 'Lucida Grande', 'Trebuchet MS', Verdana, Helvetica, Arial, sans-serif; font-size: 13px; line-height: 1.4; text-align: left;">
<span id="more-2458"></span></div>
<div style="background-color: white; font-family: 'Lucida Grande', 'Trebuchet MS', Verdana, Helvetica, Arial, sans-serif; font-size: 13px; line-height: 1.4; text-align: justify;">
<strong>Penghitung massa molekuler</strong><br />Penghitung ini membantu
kita untuk melakukan perhitungan massa molekul dari molekul yang
berbeda-beda, tinggal memasukkan rumus molekulnya maka kita akan
mendapatkan detail dari masing-masing unsur jumlah atomnya, massa atom
total, prosentasenya dalam molekul tersebut. Untuk memudahkan
perhitungan ada menu alias yang digunakan untuk penyandian molekul
senyawa tertentu. Hal ini nantinya akan mempercepat proses
perhitungan,namun jika kita tidak hafal pengkodeannya maka jumstru
menjadi lama.</div>
<div style="background-color: white; font-family: 'Lucida Grande', 'Trebuchet MS', Verdana, Helvetica, Arial, sans-serif; font-size: 13px; line-height: 1.4; text-align: center;">
</div>
<div style="background-color: white; font-family: 'Lucida Grande', 'Trebuchet MS', Verdana, Helvetica, Arial, sans-serif; font-size: 13px; line-height: 1.4; text-align: justify;">
<strong>Penghitung konsentrasi</strong><br />Kita dapat mengimput
kuantitas zat terlarut dan zat pelarut dengan berbagai satuan, massa
ekuivalen, massa molar zat terlarut, massa molar zat pelarut.
Konsentrasi larutan dapat ditentukan dengan berbagai satuan konsentrasi
yang ada di antaranya molar, molal, normal, % volume, % massa, % mol).
Jika diperlukan juga disediakan satuan kerapatan, baik kerapatan zat
pelarut maupun zat terlarut dengan berbagai satuan kerapatan.<br />Dengan memanfaatkan basis data pada tabel periodik semua bisa dimanfaatkan dalam proses kalkulasi ini.</div>
<div style="background-color: white; font-family: 'Lucida Grande', 'Trebuchet MS', Verdana, Helvetica, Arial, sans-serif; font-size: 13px; line-height: 1.4; text-align: justify;">
<a href="http://urip.files.wordpress.com/2010/09/intro-calculat5.png" style="color: #78a515; font-weight: bold; text-decoration: none;"><img alt="" class="aligncenter size-full wp-image-2463" height="305" src="http://urip.files.wordpress.com/2010/09/intro-calculat5.png" style="border-bottom-style: none; border-bottom-width: 0px; border-color: initial; border-color: initial; border-left-style: none; border-left-width: 0px; border-right-style: none; border-right-width: 0px; border-style: initial; border-top-style: none; border-top-width: 0px; display: block; max-width: 100%; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;" width="615" /></a></div>
<div style="background-color: white; font-family: 'Lucida Grande', 'Trebuchet MS', Verdana, Helvetica, Arial, sans-serif; font-size: 13px; line-height: 1.4; text-align: justify;">
<strong>Penghitung Nuklir (Inti)</strong><br />Kalkulator ini dibuat
dengan menggunakan data inti yang tersedia dalam Kalzium untuk
memprediksi massa perkiraan dari suatu material setelah sekian waktu.
Input data nama unsur, massa isotop, serta waktu paronya. Waktu paruh
adalah waktu yang diperlukan oleh unsur radioaktif untuk mengalami
peluruhan sampai menjadi setengah kali massa atau aktivitas semula.
Dengan penghitung ini kita dapat memainkan rumus Nt = No(0,5) pangkat
(waktu peluruhan (T)/waktu paro (t<sub>1/2</sub>)). Jadi jika beberapa data diketahui maka dengan mudah kita mengetahui data yang ditanyakan.</div>
<div style="background-color: white; font-family: 'Lucida Grande', 'Trebuchet MS', Verdana, Helvetica, Arial, sans-serif; font-size: 13px; line-height: 1.4; text-align: justify;">
<a href="http://urip.files.wordpress.com/2010/09/intro-calculat6.png" style="color: #78a515; font-weight: bold; text-decoration: none;"><img alt="" class="aligncenter size-full wp-image-2462" height="310" src="http://urip.files.wordpress.com/2010/09/intro-calculat6.png" style="border-bottom-style: none; border-bottom-width: 0px; border-color: initial; border-color: initial; border-left-style: none; border-left-width: 0px; border-right-style: none; border-right-width: 0px; border-style: initial; border-top-style: none; border-top-width: 0px; display: block; max-width: 100%; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;" width="421" /></a></div>
<div style="background-color: white; font-family: 'Lucida Grande', 'Trebuchet MS', Verdana, Helvetica, Arial, sans-serif; font-size: 13px; line-height: 1.4; text-align: justify;">
<strong>Penghitung Gas</strong><br />Alat hitung ini dapat menghitung
nilai temperatur, tekanan, volum, jumlah gas dan sebagainya seperti
layaknya gas ideal. Seperti pada alat hitung kalkulator di atas di sini
juga disediakan berbagai satuan yang biasa digunakan dalam perhitungan
gas.</div>
<div style="background-color: white; font-family: 'Lucida Grande', 'Trebuchet MS', Verdana, Helvetica, Arial, sans-serif; font-size: 13px; line-height: 1.4; text-align: justify;">
<a href="http://urip.files.wordpress.com/2010/09/intro-calculat7.png" style="background-attachment: initial; background-clip: initial; background-color: initial; background-image: none; background-origin: initial; background-position: initial initial; background-repeat: initial initial; color: #679000; font-weight: bold; text-decoration: none;"><img alt="" class="aligncenter size-full wp-image-2460" height="242" src="http://urip.files.wordpress.com/2010/09/intro-calculat7.png" style="border-bottom-style: none; border-bottom-width: 0px; border-color: initial; border-color: initial; border-left-style: none; border-left-width: 0px; border-right-style: none; border-right-width: 0px; border-style: initial; border-top-style: none; border-top-width: 0px; display: block; max-width: 100%; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;" width="518" /></a></div>
<div style="background-color: white; font-family: 'Lucida Grande', 'Trebuchet MS', Verdana, Helvetica, Arial, sans-serif; font-size: 13px; line-height: 1.4; text-align: justify;">
</div>
<div style="background-color: white; font-family: 'Lucida Grande', 'Trebuchet MS', Verdana, Helvetica, Arial, sans-serif; font-size: 13px; line-height: 1.4; text-align: justify;">
Pokok bahasan yang bisa memanfaatkan kalkulator molekuler dari Kalzium ini antara lain:</div>
<ul style="background-color: white; font-family: 'Lucida Grande', 'Trebuchet MS', Verdana, Helvetica, Arial, sans-serif; font-size: 13px; text-align: left;">
<li>Hukum-hukum dasar kimia</li>
<li><a href="http://urip.wordpress.com/2010/09/04/12-4-unsur-radioaktif/" style="color: #78a515; font-weight: bold; text-decoration: none;" target="_blank">Unsur radioaktif</a></li>
<li>Larutan</li>
<li>Kinetika reaksi</li>
<li><a href="http://urip.wordpress.com/2010/07/31/berbagai-tautan-sifat-koligatif-larutan-kimia-12/" style="color: #78a515; font-weight: bold; text-decoration: none;" target="_blank">Sifat koligatif larutan</a></li>
</ul>
<div style="background-color: white; font-family: 'Lucida Grande', 'Trebuchet MS', Verdana, Helvetica, Arial, sans-serif; font-size: 13px; line-height: 1.4; text-align: justify;">
</div>
<div style="background-color: white; font-family: 'Lucida Grande', 'Trebuchet MS', Verdana, Helvetica, Arial, sans-serif; font-size: 13px; line-height: 1.4; text-align: justify;">
Sumber : <a href="http://urip.edublogs.org/2010/09/23/optimalisasi-penggunaan-kalzium-dalam-pembelajaran-kimia-3/" style="font-family: 'Times New Roman'; font-size: medium; line-height: normal; text-align: -webkit-auto;">http://urip.edublogs.org/2010/09/23/optimalisasi-penggunaan-kalzium-dalam-pembelajaran-kimia-3/</a></div>akademik_HIMKAhttp://www.blogger.com/profile/00366070787523409197noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-2766916642261181760.post-16453496578739862022011-12-31T19:35:00.001-08:002011-12-31T19:35:51.710-08:00kalzium#2<h3 class="post-title entry-title">
Kalzium #2
</h3>
<div class="post-header">
</div>
<br />
<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="http://urip.files.wordpress.com/2010/09/plotdata1.png" style="color: #78a515; font-weight: bold; margin-left: 1em; margin-right: 1em; text-decoration: none;"><img alt="" class="aligncenter size-full wp-image-2332" height="272" src="http://urip.files.wordpress.com/2010/09/plotdata1.png" style="border-bottom-width: 0px; border-color: initial; border-color: initial; border-left-width: 0px; border-right-width: 0px; border-style: initial; border-top-width: 0px; display: block; max-width: 100%; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px;" width="400" /></a></div>
<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
</div>
<div style="background-color: white; font-family: 'Lucida Grande', 'Trebuchet MS', Verdana, Helvetica, Arial, sans-serif; font-size: 13px; line-height: 1.4; text-align: justify;">
Saya telah mencari terjemahan kata<em> plot </em>tapi tidak ada yang sesuai dengan konteks bahasan kali ini. Jadi tetap saya gunakan saja kata <em>plot</em>.</div>
<div style="background-color: white; font-family: 'Lucida Grande', 'Trebuchet MS', Verdana, Helvetica, Arial, sans-serif; font-size: 13px; line-height: 1.4; text-align: justify;">
Untuk menuju<em> tool Plot Data</em>, silahkan buka aplikasi Kalzium, klik menu <em>Tool</em> dan pilih <em>Plot Data</em>. Pada <em>tool</em> ini dapat dilakukan pem-<em>plot</em>-an antara sumbu X dan Y (dalam sebuah grafik) beberapa sifat periodik unsur untuk melihat kecenderungan suatu unsur.<span id="more-2362"></span></div>
<div style="background-color: white; font-family: 'Lucida Grande', 'Trebuchet MS', Verdana, Helvetica, Arial, sans-serif; font-size: 13px; line-height: 1.4; text-align: justify;">
</div>
<div style="background-color: white; font-family: 'Lucida Grande', 'Trebuchet MS', Verdana, Helvetica, Arial, sans-serif; font-size: 13px; line-height: 1.4; text-align: justify;">
Bagian sumbu X dan Y terdapat nomor atom (<em>Atomic Number</em>), massa atom (<em>Mass</em>), elektronegatifitas (<em>Electronegativity</em>), titik lebur (<em>Melting Point</em>), titik didih (<em>Boiling Point</em>), jari-jari atom (<em>Atomic Radius</em>), dan jari-jari kovalen (<em>Covalent Radius</em>).</div>
<div style="background-color: white; font-family: 'Lucida Grande', 'Trebuchet MS', Verdana, Helvetica, Arial, sans-serif; font-size: 13px; line-height: 1.4; text-align: justify;">
Misalnya kita akan mem-<em>plot</em> nomor atom pada sumbu X terhadap
kelektronegatifan pada sumbu Y, kita bisa melihat kecenderungan
keelektronegatifan berdasarkan kenaikan nomor atom untuk rentang nomor
atom tertentu. Dicontohkan kita ingin melihat kecenderungan unsur pada
periode 2 (nomor atomnya 3-10), maka pada sumbu X kita pilih nomor atom
dan pada sumbu Y kita pilih keelektronegatifan.</div>
<div style="background-color: white; font-family: 'Lucida Grande', 'Trebuchet MS', Verdana, Helvetica, Arial, sans-serif; font-size: 13px; line-height: 1.4; text-align: justify;">
Sebelum melakukan pem-<em>plot</em>-an tentukan terlebih dahulu <em>First element </em>dan <em>Last element</em> dengan mengetikan angka atau menekan tanda panah atas-bawah. Atur juga bagian <em>Display</em> (Tampilan), apakah kita ingin menampilkan label (nama unsur atau simbol unsur) pada titik-titik<em>plot</em> atau dibiarkan kosong tanpa label.</div>
<div style="background-color: white; font-family: 'Lucida Grande', 'Trebuchet MS', Verdana, Helvetica, Arial, sans-serif; font-size: 13px; line-height: 1.4; text-align: justify;">
Selain itu kita juga masih diberikan pilihan untuk menampilkan <em>Element Type</em> (jenis
unsur): logam (Metal), non logam/metaloid, unsur blok s, unsur blok p,
unsur blok d, unsur blok f, gas mulia, logam alkali, logam alkali tanah,
lantanida, aktanida, serta unsur-unsur radioaktif.<br />Warna latar untuk <em>Plot Data</em> secara default adalah hitam, sampai saat ini saya belum bisa mengubahnya.</div>
<div style="background-color: white; font-family: 'Lucida Grande', 'Trebuchet MS', Verdana, Helvetica, Arial, sans-serif; font-size: 13px; line-height: 1.4; text-align: justify;">
Pokok bahasan yang bisa memanfaatkan <em>Plot Data</em> ini antara lain:</div>
<ul style="background-color: white; font-family: 'Lucida Grande', 'Trebuchet MS', Verdana, Helvetica, Arial, sans-serif; font-size: 13px; text-align: justify;">
<li><strong>Sistem periodik unsur (sifat periodik unsur)</strong>. Di
sini kita bisa mempelajari tentang berbagai kecenderungan unsur dengan
naiknya nomor atom, atau dalam jenis unsur tertentu (logam-non logam,
masing-masing blok, golongan)</li>
<li><strong>Ikatan kimia (ikatan ion, ikatan kovalen, ikatan logam)</strong>.
Bahasan ikatan kimia bisa memanfaatkan data elektronegativitas untuk
menentukan kemungkinan suatu unsur membentuk ikatan dengan unsur
lainnya. Apakah mereka akan membentuk ikatan ion, ikatan kovalen, atau
ikatan logam.</li>
<li><strong>Kimia unsur (kelimpahan unsur)</strong>. Beberapa karakteristik unsur juga bisa dipelajari dengan menggunakan <em>plot data</em> Kalzium ini.</li>
<li><strong>Pokok bahasan lain </strong>yang memerlukan <em>plot data</em> unsur-unsur.</li>
</ul>
<div style="background-color: white; font-family: 'Lucida Grande', 'Trebuchet MS', Verdana, Helvetica, Arial, sans-serif; font-size: 13px; line-height: 1.4; text-align: justify;">
Disarankan juga untuk menggunakan fitur lain pada Kalzium untuk mendapatkan kemanfaatan lebih.</div>
<div style="background-color: white; font-family: 'Lucida Grande', 'Trebuchet MS', Verdana, Helvetica, Arial, sans-serif; font-size: 13px; line-height: 1.4; text-align: justify;">
</div>
<div style="background-color: white; font-family: 'Lucida Grande', 'Trebuchet MS', Verdana, Helvetica, Arial, sans-serif; font-size: 13px; line-height: 1.4; text-align: justify;">
Sumber : <a href="http://urip.edublogs.org/2010/09/18/optimalisasi-penggunaan-kalzium-dalam-pembelajaran-kimia-2/" style="font-family: 'Times New Roman'; font-size: medium; line-height: normal; text-align: -webkit-auto;">http://urip.edublogs.org/2010/09/18/optimalisasi-penggunaan-kalzium-dalam-pembelajaran-kimia-2/</a></div>akademik_HIMKAhttp://www.blogger.com/profile/00366070787523409197noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-2766916642261181760.post-61179862257170454092011-12-31T19:32:00.000-08:002011-12-31T19:32:50.843-08:00kalzium 1<h3 class="post-title entry-title">
Kalzium #1
</h3>
<div class="post-header">
</div>
<div style="background-color: white; line-height: 1.4; text-align: justify;">
<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEhnTDibruDBTRzBkOPN6J0yqtY2X7TEDbFqXNbRzz0lxhHzUTOpdNUDCfzwjeH5cuz3VVC7uhrnvlFdive5R1kRyjD6-TokO2IfTDUG-1ANzX_diNunyqJw9TK6D6P4YBvwPOmmG5k9IG0/s1600/Gambar-Layar-1.png" style="line-height: normal; margin-left: 1em; margin-right: 1em; text-align: center;"><img border="0" height="223" src="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEhnTDibruDBTRzBkOPN6J0yqtY2X7TEDbFqXNbRzz0lxhHzUTOpdNUDCfzwjeH5cuz3VVC7uhrnvlFdive5R1kRyjD6-TokO2IfTDUG-1ANzX_diNunyqJw9TK6D6P4YBvwPOmmG5k9IG0/s400/Gambar-Layar-1.png" width="400" /></a></div>
</div>
<div style="background-color: white; line-height: 1.4; text-align: justify;">
<span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><br /></span></div>
<div style="background-color: white; line-height: 1.4; text-align: justify;">
<span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"> Apa itu Kalzium? Apakah tulisan itu tidak salah, bukannya kalsium tulisan yang benar?<br />Kalau yang dimaksud adalah unsur kalsium yah memang salah, tapi Kalzium adalah nama sebuah software (<em>open source software</em> –
OSS) yang memanfaatkan tabel periodik untuk mengeksplorasi setiap
unsur. Tapi ternyata tidak sekedar tabel periodik biasa, lebih dari
sekedar tabel periodik. Kalzium berasal dari bahasa Jerman dari kata
kalsium. Saat ini Kalzium sampai di versi Hidrogen. Untuk diketahui
semenjak Kalzium menjadi aplikasi <em>standalone</em> ia versinya akan dinamai dengan urutan nama unsur dalam tabel periodik.</span></div>
<div style="background-color: white; line-height: 1.4; text-align: justify;">
<span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"> </span></div>
<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEgNlmksA3hnRTakXGWYqqGsLKPMfu4h4SJCkCfvyoTvFIFsuRU_NtFYymjW9crhkyeme5Hj3Mg1sIK4vQBOPrFCYFpzOVkv5FL1GT31SspbjiNFWVYS7v6sq77LspQb9ZB8UBNIurkCFVw/s1600/Gambar-Layar.png" style="margin-left: 1em; margin-right: 1em;"><img border="0" height="222" src="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEgNlmksA3hnRTakXGWYqqGsLKPMfu4h4SJCkCfvyoTvFIFsuRU_NtFYymjW9crhkyeme5Hj3Mg1sIK4vQBOPrFCYFpzOVkv5FL1GT31SspbjiNFWVYS7v6sq77LspQb9ZB8UBNIurkCFVw/s400/Gambar-Layar.png" width="400" /></a></div>
<div style="background-color: white; line-height: 1.4; text-align: justify;">
<span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"> </span></div>
<div style="background-color: white; line-height: 1.4; text-align: justify;">
<span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">
Apa sajakah yang bisa digunakan dari kalzium dalam pemebelajaran
kimia sma? Materi-materi pelajaran kimia, baik di kelas 10, kelas 11
IPA, maupun kelas 12 IPA bab-bab tertentu sangatlah tepat memanfaatkan
kehebatan Kalzium. Tentu ini hanya merupakan alternatif dalam penggunaan
media pembelajaran. Sampai saat ini Kalzium belum mendukung untuk sitem
operasi Windows. Hanya bisa berjalan untuk sistem operasi Linux. Oleh
karena itu di sarankan pengguna yang ingin mencobanya sebaiknya
meningstall sistem operasi Linux di komputernya. Toh ini barang gratis
dan halal. Masih enggan menggunakan linux alasan tidak bisa?! Bukan
jamannya lagi, Linux semakin mudah digunakan dan <em>user friendly</em> <em>atuh</em>. Tetap ngeyel?! Yah sudah gunakan <a href="http://www.speedytown.com/kimyong/index.php/2008/11/24/andlinux-menjalankan-linux-os-di-windows/" style="color: #78a515; font-weight: bold; text-decoration: none;" target="_blank">alat seperti ini </a>(atau semacam virtual mesin) agar kalzium bisa jalan di Windows kesayangan anda.</span></div>
<div style="background-color: white; line-height: 1.4; text-align: justify;">
<span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><br /></span></div>
<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEiNFD7jdv79FJeNEY9VWfcjJAs9v9qtXy9q0DlustVtrxPXvAvUteUU8pYqEvD9SZTRhbN1pGW7QMCh1owneN7KH7lB9L9ky3CoVE-EKnEINC5_nUBxzotv3HqKW2h9D14wwL83H-OmIHU/s1600/Gambar-Layar-2.png" style="margin-left: 1em; margin-right: 1em;"><img border="0" height="223" src="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEiNFD7jdv79FJeNEY9VWfcjJAs9v9qtXy9q0DlustVtrxPXvAvUteUU8pYqEvD9SZTRhbN1pGW7QMCh1owneN7KH7lB9L9ky3CoVE-EKnEINC5_nUBxzotv3HqKW2h9D14wwL83H-OmIHU/s400/Gambar-Layar-2.png" width="400" /></a></div>
<div style="background-color: white; line-height: 1.4; text-align: justify;">
<span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><br /></span></div>
<div style="background-color: white; line-height: 1.4; text-align: justify;">
<span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><span id="more-2323"></span> Bagi yang ingin menginstall Kalzium ada <a href="http://cakanas.wordpress.com/2009/07/01/kalzium-menunjang-kurikulum-matapelajaran-kimia/" style="color: #78a515; font-weight: bold; text-decoration: none;" target="_blank">sedikit tutorial yang telah dibuat rekan lain sebelumnya</a>.
Saya saat ini menggunakan Sabily Manarat 10.04 salah satu sistem
operasi turunan Linux Ubuntu 10.04. Pada saat menginstall Sabili Manarat
10.04 itu ternyata Kalzium sudah dalam satu paket penginstallan. Jika
belum yah silahkan di install sebagaimana tutorial yang diberikan rekan
saya tadi. Untuk sedikit review tentang aplikasi ini sebaiknya
mengunjungi blognya r<a href="http://radithtux.blogspot.com/2009/09/kalzium-tabel-pereodik-ala-ubuntu.html" style="color: #78a515; font-weight: bold; text-decoration: none;">ekan radithtux ini</a>.</span></div>
<div style="background-color: white; line-height: 1.4; text-align: justify;">
<span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><br /></span></div>
<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEgawatmkVHzibPrl1Md6FGbXxyWlvrZ816YjunR-LP-D5imkXjHE5B_4AfzPfMfkqJFWMJ4uEebyYJirDq2_b4mciCmqdS-zidBU8toldsrtxyzmvWZsUNxm9Wnm4DNGOvifeGROt_ejcw/s1600/Gambar-Layar-3.png" style="margin-left: 1em; margin-right: 1em;"><img border="0" height="223" src="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEgawatmkVHzibPrl1Md6FGbXxyWlvrZ816YjunR-LP-D5imkXjHE5B_4AfzPfMfkqJFWMJ4uEebyYJirDq2_b4mciCmqdS-zidBU8toldsrtxyzmvWZsUNxm9Wnm4DNGOvifeGROt_ejcw/s400/Gambar-Layar-3.png" width="400" /></a></div>
<div style="background-color: white; line-height: 1.4; text-align: justify;">
<span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"> </span></div>
<div style="background-color: white; line-height: 1.4; text-align: justify;">
<span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"> Bagaimana cara menggunakan Kalzium? Silahkan kunjungi <strong><em><a href="http://docs.kde.org/stable/en/kdeedu/kalzium/index.html" style="color: #78a515; text-decoration: none;" target="_blank">The Kalzium Handbook</a></em></strong> Ok? Atau kalau mau dan berminat versi <em>offline</em>-nya saya telah menyiapkannya <a href="http://ifile.it/2jqe3uh/kalzium.rar" style="color: #78a515; font-weight: bold; text-decoration: none;" target="_blank">di pranala ini (1,4 MB format rar)</a>. Silahkan unduh dan ekstrak <em>file</em> rar tersebut, buka <em>folder</em> hasil ekstrakan itu, klik <em>file</em> index.html
maka akan terbuka dalam mesin peramban yang anda punyai. Silahkan
jelajah lebih lanjut secara offline. Kalau kesulitan mengunduh file
tersebut silahkan tinggalkan pesan, insya Allah akan saya kirim via
surel (<em>email)</em>.</span></div>
<div style="background-color: white; line-height: 1.4; text-align: justify;">
<span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><br /></span></div>
<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEiIdgA5B0LSJ01VdR8PyDOPdjY_TpDz3SCU_1RX-sLQ2_5kN5hEHgpWQK3lw-huoNnci5w1DTdB7cSVhnrbpRxmNyOSGKZ3gcCJ2i0RUvnfF3tROYMRM-6neyKo4elbK1p1WFEw-PHtFSo/s1600/Gambar-Layar-4.png" style="margin-left: 1em; margin-right: 1em;"><img border="0" height="223" src="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEiIdgA5B0LSJ01VdR8PyDOPdjY_TpDz3SCU_1RX-sLQ2_5kN5hEHgpWQK3lw-huoNnci5w1DTdB7cSVhnrbpRxmNyOSGKZ3gcCJ2i0RUvnfF3tROYMRM-6neyKo4elbK1p1WFEw-PHtFSo/s400/Gambar-Layar-4.png" width="400" /></a></div>
<div style="background-color: white; line-height: 1.4; text-align: justify;">
<span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><br /></span></div>
<div style="background-color: white; line-height: 1.4; text-align: justify;">
<span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"> Sebaiknya kita mengenali lebih dahulu semua <em>menu</em> dan<em> tool</em> yang
tersedia pada bagian utama Kalzium, dengan demikian kita bisa melakukan
eksplorasi kehebatan Kalzium dan menerapkan pada pokok bahasan yang
sesuai. Dengan Kalzium secara <em>live</em> (membukanya saat proses
pembelajaran di kelas) kita bisa menjelaskan pokok bahasan struktur atom
dan sitem periodik. Dapat juga meng-<em>capture</em> (menangkap gambar
dilayar monitor kemudian mengambil bagian yang penting) untuk disisipkan
saat membuat modul pembalajaran. Boleh juga kita buatkan tutorial agar
siswa menggunakan Kalzium untuk mempraktekannya sendiri dengan penugasan
tertentu.</span></div>
<div style="background-color: white; line-height: 1.4; text-align: justify;">
<span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><br /></span></div>
<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEgZsVWIbtTb0chQaezzgp9aS1bv5uqzsUNCdke2I99Q_Oogg-agJKak6oLAfnby108Cxp1UNcX2sbLsnpvl5UF2N9R1VPEKReNuH_gePN0d3Vi9kZtpoGpOJRb2V-vSVvJ-N4jvIMUa0fU/s1600/Gambar-Layar-5.png" style="margin-left: 1em; margin-right: 1em;"><img border="0" height="224" src="https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEgZsVWIbtTb0chQaezzgp9aS1bv5uqzsUNCdke2I99Q_Oogg-agJKak6oLAfnby108Cxp1UNcX2sbLsnpvl5UF2N9R1VPEKReNuH_gePN0d3Vi9kZtpoGpOJRb2V-vSVvJ-N4jvIMUa0fU/s400/Gambar-Layar-5.png" width="400" /></a></div>
<div style="background-color: white; line-height: 1.4; text-align: justify;">
<span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"> </span></div>
<div style="background-color: white; line-height: 1.4; text-align: justify;">
<span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Ok, selanjutnya kita eksplorasi lebih jauh penggunaan Kalzium terutama alat (<em>tool)</em> yang bisa dimanfaatkan dalam pembelajaran.</span></div>
<div style="background-color: white; line-height: 1.4; text-align: justify;">
<span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><br /></span></div>
<div style="background-color: white; line-height: 1.4; text-align: justify;">
<span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Sumber : </span><a href="http://urip.edublogs.org/2010/09/17/optimalisasi-penggunaan-kalzium-dalam-pembelajaran-kimia-1-2/" style="line-height: normal; text-align: -webkit-auto;">http://urip.edublogs.org/2010/09/17/optimalisasi-penggunaan-kalzium-dalam-pembelajaran-kimia-1-2/</a></div>
<div style="background-color: white; line-height: 1.4; text-align: justify;">
</div>
<div style="background-color: white; line-height: 1.4; text-align: justify;">
Gambar : Pribadi</div>akademik_HIMKAhttp://www.blogger.com/profile/00366070787523409197noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-2766916642261181760.post-87504581563699834922011-12-31T17:14:00.000-08:002011-12-31T17:15:15.223-08:00konten nomor 3<span style="background: none repeat scroll 0% 0% white;">Beri contoh analisa apa
saja yang dapat dilakukan oleh software Hyperchem ? </span>
<br />
<div style="color: black; margin: 0in 0in 0.0001pt; text-indent: 0.5in;">
<a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2011/12/analisa-dengan-hyperchem-analisis.html" target="_blank"><b><span style="background: none repeat scroll 0% 0% white;">Analisa dengan Hyperchem (Analisis Konformasi Menthol)</span></b></a></div>
<div style="background: none repeat scroll 0% 0% white; color: black; margin: 0in; text-indent: 0.5in;">
<a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2011/12/analisa-dengan-hyperchem-interaksi-eter.html" target="_blank"><b><span style="background: none repeat scroll 0% 0% white;">Analisa Dengan Hyperchem (Interaksi Eter Mahkota dengan Suatu Ion)</span></b></a></div>
<div style="background: none repeat scroll 0% 0% white; color: black; margin: 0in; text-indent: 0.5in;">
<a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2011/12/analisa-dengan-hyperchem-gaya-antar.html" target="_blank"><b><span style="background: none repeat scroll 0% 0% white;">Analisa dengan Hyperchem (Gaya Antar Molekul pada Asam Karboksilat)</span></b></a></div>
<div style="background: none repeat scroll 0% 0% white; color: black; margin: 0in; text-indent: 0.5in;">
<a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2011/12/analisa-dengan-hyperchem-mengukur-sifat.html" target="_blank"><b><span style="background: none repeat scroll 0% 0% white;">Analisa dengan Hyperchem (Mengukur Sifat-sifat Struktural)</span></b></a></div>
<div style="background: none repeat scroll 0% 0% white; color: black; margin: 0in; text-indent: 0.5in;">
<a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2011/12/analisa-dengan-hyperchem-pemodelan.html" target="_blank"><b><span style="background: none repeat scroll 0% 0% white;">Analisa dengan Hyperchem (Pemodelan Molekul Organik)</span></b></a></div>
<div style="background: none repeat scroll 0% 0% white; color: black; margin: 0in; text-indent: 0.5in;">
<a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2011/12/hyperchem-permodelan-uv.html" target="_blank"><b><span style="background: none repeat scroll 0% 0% white;">Analisa dengan Hyperchem (Pemodelan Spektroskopi UV)</span></b></a></div>
<div style="background: none repeat scroll 0% 0% white; color: black; margin: 0in; text-indent: 0.5in;">
<a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2011/12/hyperchem-ab-intio.html" target="_blank"><b><span style="background: none repeat scroll 0% 0% white;">Analisa dengan Hyperchem (AB Initio)</span></b></a></div>
<div style="background: none repeat scroll 0% 0% white; color: black; margin: 0in; text-indent: 0.5in;">
<a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2011/12/hyperchem-praktek-semi-empiris.html" target="_blank"><b><span style="background: none repeat scroll 0% 0% white;">Analisa dengan Hyperchem (Praktek Semi Empiris)</span></b></a></div>
<div style="background: none repeat scroll 0% 0% white; color: black; margin: 0in; text-indent: 0.5in;">
<a href="http://muhammadisakimiauin.blogspot.com/2011/12/stabilitas-karbokation-benzil.html" target="_blank"><b><span style="background: none repeat scroll 0% 0% white;">Analisa dengan Hyperchem (Stabilitas dan Struktur Karbokation Benzil dan Alil)</span></b></a></div>akademik_HIMKAhttp://www.blogger.com/profile/00366070787523409197noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-2766916642261181760.post-31684863585945232092011-12-31T17:13:00.001-08:002011-12-31T17:13:56.212-08:00stabilitas karbokation benzil<h3 class="post-title entry-title">
Analisa dengan Hyperchem (Stabilitas dan Struktur Karbokation Benzil dan Alil)
</h3>
<div class="post-header">
</div>
<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
<a href="http://1.bp.blogspot.com/-EScZ9pOcahw/TvbpXjqMAqI/AAAAAAAAAyg/FzUusWdLagU/s1600/HyperChem.JPG" style="margin-left: 1em; margin-right: 1em;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><img border="0" src="http://1.bp.blogspot.com/-EScZ9pOcahw/TvbpXjqMAqI/AAAAAAAAAyg/FzUusWdLagU/s1600/HyperChem.JPG" /></span></a></div>
<div class="separator" style="clear: both; text-align: center;">
</div>
<div align="center" class="MsoNormal" style="line-height: 150%;">
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><b><br /></b></span></div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; text-align: justify; text-justify: inter-ideograph;">
<b><span style="line-height: 150%;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Tujuan</span></span></b></div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; margin-left: 28.3pt; text-align: justify; text-justify: inter-ideograph;">
<span style="line-height: 150%;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Menyelidiki stabilitas karbokation
benzil dan alil menggunakan perhitungan semi empiris AM1.</span></span></div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; text-align: justify; text-justify: inter-ideograph;">
<b><span style="line-height: 150%;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Latar
belakang</span></span></b></div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; text-align: justify; text-indent: .5in; text-justify: inter-ideograph;">
<span style="line-height: 150%;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Karbokation alil dan benzil
merupakan zat antara yang khusus karena mempunyai kestabilan yang sangat
tinggi. Mereka sering kali dilihat sebagai <i>thermodynamic
sinks </i>dalam kenampakan frakmentasi spectra massa. Karbokation ini dan
turunan mereka telah dikarakterisasi secara luas dengan spektroskopi NMR dalam
kondisi superasam. Stabilitas yang tinggi dari karbokation ini dicirikan pada
pemberian elektron ke dalam orbital p kosong pada pusat karbokation yaitu
melalui stabilitas resonansi. Hal ini memberikan akibat bahwa semua elektron
(juga muatan positif) dari kation alil dan benzil terdelokal secara signifikan.
Dalam rangka mendapatkan kondisi tersebut, kation harus berada pada geometri
planar untuk dapat memungkinkan tumpang tindih orbital p kosong dengan sistem
elektron terkonjugasi.</span></span></div>
<div align="center" class="MsoNormal" style="line-height: 150%;">
</div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; text-align: justify; text-indent: .5in; text-justify: inter-ideograph;">
</div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; text-align: justify; text-indent: .5in; text-justify: inter-ideograph;">
<span style="line-height: 150%;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Dalam percobaan ini, perhitungan
semi empiris AM1 digunakan untuk menguji geometri dan distribusi muatan dari
karbokation. Setelah perhitungan panas pembentukan (ΔH<sub>f</sub>) untuk
setiap kation, perbedaan bentuk planar dan bentuk saling tegak lurus akan
ditentukan. Perbedaan pada harga ΔH<sub>f</sub> dapat digunakan untuk mengukur
tambahan stabiltas yang disebabkan oleh delokalisasi electron.</span></span></div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; text-align: justify; text-justify: inter-ideograph;">
<b><span style="line-height: 150%;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Prosedur</span></span></b></div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; text-align: justify; text-justify: inter-ideograph;">
<span style="line-height: 150%;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"> Langkah
pertama adalah menggambarkan kation dalam bentuk planar dan saling tegak lurus
dan menghitung panas pembentukannya. Setelah dilakukan minimisasi energy, akan
sangat berguna untuk mengkaji muatan atom yang terdapat pada setiap atom C
untuk menentukan ke mana muatan positif didistribusikan.</span></span></div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; text-align: justify; text-justify: inter-ideograph;">
<span style="line-height: 150%;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"> Catatan:
<i>Anda memerlukan file Start dan Stop Log
dan selanjutnya membuka file log dari percobaan ini. Jika Anda tidak yakin
bagaimana melakukan hal ini, lihat pada pendahuluan.</i></span></span></div>
<div class="MsoListParagraph" style="line-height: 150%; mso-list: l0 level1 lfo1; text-align: justify; text-indent: -.25in; text-justify: inter-ideograph;">
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><i><span style="line-height: 150%;">1.<span style="font: 7.0pt "Times New Roman";">
</span></span></i><span style="line-height: 150%;">Klik pada <i>Build</i> dan yakinkan bahwa <i>Explicit
Hydrogen </i>sedang aktif.</span></span></div>
<div class="MsoListParagraph" style="line-height: 150%; mso-list: l0 level1 lfo1; text-align: justify; text-indent: -.25in; text-justify: inter-ideograph;">
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><span style="line-height: 150%;">2.<span style="font: 7.0pt "Times New Roman";"> </span></span><span style="line-height: 150%;">Gunakan
menu <i>Draw</i> dan gambarkan kation alil.
Jangan mengaktifkan <i>Add H & Model
Build.</i></span></span></div>
<div class="MsoListParagraph" style="line-height: 150%; mso-list: l0 level1 lfo1; text-align: justify; text-indent: -.25in; text-justify: inter-ideograph;">
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><i><span style="line-height: 150%;">3.<span style="font: 7.0pt "Times New Roman";">
</span></span></i><span style="line-height: 150%;">Gunakan menu <i>Draw</i> untuk menambah atom hidrogen pada stuktur yang dibuat.</span></span></div>
<div class="MsoListParagraph" style="line-height: 150%; mso-list: l0 level1 lfo1; text-align: justify; text-indent: -.25in; text-justify: inter-ideograph;">
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><span style="line-height: 150%;">4.<span style="font: 7.0pt "Times New Roman";"> </span></span><span style="line-height: 150%;">Klik
ganda pada kedua ikatan C-C sehingga akan muncul garis putus-putus yang
menunjukan bahwa ikatan terkonjugasi.</span></span></div>
<div class="MsoListParagraph" style="line-height: 150%; mso-list: l0 level1 lfo1; text-align: justify; text-indent: -.25in; text-justify: inter-ideograph;">
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><span style="line-height: 150%;">5.<span style="font: 7.0pt "Times New Roman";"> </span></span><span style="line-height: 150%;">Klik
pada <i>Build</i> dan selanjutnya <i>Model Build</i>. Anda harus mendapatkan
struktur planar sempurna (Ingat, tidak ada hidrogen yang ditambahkan).</span></span></div>
<div class="MsoListParagraph" style="line-height: 150%; mso-list: l0 level1 lfo1; text-align: justify; text-indent: -.25in; text-justify: inter-ideograph;">
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><span style="line-height: 150%;">6.<span style="font: 7.0pt "Times New Roman";"> </span></span><span style="line-height: 150%;">Gunakan
menu <i>Select </i>dan klik dan geser dari
C1 ke satu atom H pada C3. Anda harus mempunyai 4 atom terpilih (warna hijau). </span></span></div>
<div class="MsoListParagraph" style="line-height: 150%; mso-list: l0 level1 lfo1; text-align: justify; text-indent: -.25in; text-justify: inter-ideograph;">
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><span style="line-height: 150%;">7.<span style="font: 7.0pt "Times New Roman";"> </span></span><span style="line-height: 150%;">Klik
pada <i>Build </i>dan selanjutnya <i>Constrain Bond Torsion. </i>Pilih <i>Other </i>dan atur sudut pada 90<sup>o</sup>
dan selanjutnya OK.</span></span></div>
<div class="MsoListParagraph" style="line-height: 150%; mso-list: l0 level1 lfo1; text-align: justify; text-indent: -.25in; text-justify: inter-ideograph;">
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><span style="line-height: 150%;">8.<span style="font: 7.0pt "Times New Roman";"> </span></span><span style="line-height: 150%;">Matikan
fungsi pilihan untuk 4 atom dan klik pada <i>Build</i>
dan selanjutnya <i>Model Build</i>. Struktur
yang Anda peroleh adalah kation alil yang tegak lurus, yaitu CH<sub>2</sub> terminal
terpilin tegak lurus pada ikatan rangkap dua.</span></span></div>
<div class="MsoListParagraph" style="line-height: 150%; mso-list: l0 level1 lfo1; text-align: justify; text-indent: -.25in; text-justify: inter-ideograph;">
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><span style="line-height: 150%;">9.<span style="font: 7.0pt "Times New Roman";"> </span></span><span style="line-height: 150%;">Pilih
<i>Setup</i>, <i>AM1</i> dan selanjutnya <i>Options.</i></span></span></div>
<div class="MsoListParagraph" style="line-height: 150%; mso-list: l0 level1 lfo1; text-align: justify; text-indent: -.25in; text-justify: inter-ideograph;">
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><i><span style="line-height: 150%;">10.<span style="font: 7.0pt "Times New Roman";"> </span></span></i><span style="line-height: 150%;">Pilih
<i>Total Charge </i>dan<i> Spin Multiplicity</i> keduanya dengan angka 1. Pilih OK dan
selanjutnya OK.</span></span></div>
<div class="MsoListParagraph" style="line-height: 150%; mso-list: l0 level1 lfo1; text-align: justify; text-indent: -.25in; text-justify: inter-ideograph;">
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><span style="line-height: 150%;">11.<span style="font: 7.0pt "Times New Roman";"> </span></span><span style="line-height: 150%;">Pilih
<i>Compute </i>dan selanjutnya <i>Geometry Optimization.</i></span></span></div>
<div class="MsoListParagraph" style="line-height: 150%; mso-list: l0 level1 lfo1; text-align: justify; text-indent: -.25in; text-justify: inter-ideograph;">
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><i><span style="line-height: 150%;">12.<span style="font: 7.0pt "Times New Roman";"> </span></span></i><span style="line-height: 150%;">Jika
perhitungan telah selesai, catat panas pembentukan dan panjang ikatan dan
muatan atom pada lembar laporan. Untuk muatan atom, aktifkan menu <i>Display, Labels </i>dan selanjutnya <i>Charge</i>. Cetak struktur dengan muatan dan
lampirkan pada lembar laporan.</span></span></div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; text-align: justify; text-indent: .5in; text-justify: inter-ideograph;">
<span style="line-height: 150%;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Prosedur umum di atas dapat
digunakan untuk memodelkan karbokation benzil tegak lurus. Lakukan klik ganda
pada cincin aromatis sehingga garis putus-putus akan muncul dalam cincin,
menunjukan ikatan konjugasi dalam cincin. Untuk menggambarkan karbokatian alil
dan benzil planar, Anda harus meniadakan langkah 6-8. Cetak setiap struktur
dengan muatan dan lampirkan pada laporan.</span></span></div>
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">
v�
� n t � ]
P[
'width:120.45pt;border-top:none;border-left:
none;border-bottom:solid windowtext 1.0pt;border-right:solid windowtext 1.0pt;
mso-border-top-alt:solid windowtext .5pt;mso-border-left-alt:solid windowtext .5pt;
mso-border-alt:solid windowtext .5pt;padding:0in 5.4pt 0in 5.4pt'>
</span><div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; margin-bottom: 3.0pt; margin-left: 0in; margin-right: 0in; margin-top: 3.0pt;">
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">1,85
D</span></div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; margin-bottom: 3.0pt; margin-left: 0in; margin-right: 0in; margin-top: 3.0pt;">
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Jarak
ikat O - H</span></div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; margin-bottom: 3.0pt; margin-left: 0in; margin-right: 0in; margin-top: 3.0pt;">
</div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; margin-bottom: 3.0pt; margin-left: 0in; margin-right: 0in; margin-top: 3.0pt;">
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">0.958
Å</span></div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; margin-bottom: 3.0pt; margin-left: 0in; margin-right: 0in; margin-top: 3.0pt;">
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Jarak
ikat N - H</span></div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; margin-bottom: 3.0pt; margin-left: 0in; margin-right: 0in; margin-top: 3.0pt;">
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">1.0124
Å</span></div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; margin-bottom: 3.0pt; margin-left: 0in; margin-right: 0in; margin-top: 3.0pt;">
</div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; margin-bottom: 3.0pt; margin-left: 0in; margin-right: 0in; margin-top: 3.0pt;">
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Sudut
ikat H-N-H</span></div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; margin-bottom: 3.0pt; margin-left: 0in; margin-right: 0in; margin-top: 3.0pt;">
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">106.67<sup>o</sup></span></div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; margin-bottom: 3.0pt; margin-left: 0in; margin-right: 0in; margin-top: 3.0pt;">
</div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; margin-bottom: 3.0pt; margin-left: 0in; margin-right: 0in; margin-top: 3.0pt;">
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Sudut
ikat H-O-H</span></div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; margin-bottom: 3.0pt; margin-left: 0in; margin-right: 0in; margin-top: 3.0pt;">
</div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; margin-bottom: 3.0pt; margin-left: 0in; margin-right: 0in; margin-top: 3.0pt;">
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">104.45<sup>o</sup></span></div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; margin-bottom: 3.0pt; margin-left: 0in; margin-right: 0in; margin-top: 3.0pt;">
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Energi
molekul</span></div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; margin-bottom: 3.0pt; margin-left: 0in; margin-right: 0in; margin-top: 3.0pt;">
</div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; margin-bottom: 3.0pt; margin-left: 0in; margin-right: 0in; margin-top: 3.0pt;">
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">47992 kal/mol</span></div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; text-align: justify;">
</div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; text-align: justify;">
<b><span style="line-height: 150%;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">III. Cara kerja </span></span></b></div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; text-align: justify;">
</div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; margin-left: 42.55pt; mso-list: l1 level1 lfo5; tab-stops: list 42.55pt; text-align: justify; text-indent: 0in;">
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><b>A.<span style="font: 7.0pt "Times New Roman";">
</span></b><b>Menghitung parameter molekul H<sub>2</sub>O</b></span></div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; margin-left: 42.55pt; tab-stops: list 42.55pt; text-align: justify;">
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Untuk
memperoleh parameter molekul air ikuti langkah-langkah berikut :</span></div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; margin-left: 63.8pt; mso-list: l0 level1 lfo4; tab-stops: list -106.35pt 63.8pt; text-align: justify; text-indent: -21.25pt;">
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">1.<span style="font: 7.0pt "Times New Roman";"> </span>Klik <i>Build</i> , Klik <i>Default Elements</i>,
pilih atom O dan klik.</span></div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; margin-left: 63.8pt; mso-list: l0 level1 lfo4; tab-stops: list -106.35pt 63.8pt; text-align: justify; text-indent: -21.25pt;">
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">2.<span style="font: 7.0pt "Times New Roman";"> </span>Klik <i>Build</i>, Klik <i>Add Hydrogen</i>,
Klik <i>Model Build</i>.</span></div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; margin-left: 63.8pt; mso-list: l0 level1 lfo4; tab-stops: list -106.35pt 63.8pt; text-align: justify; text-indent: -21.25pt;">
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><i>3.<span style="font: 7.0pt "Times New Roman";">
</span></i>Klik
Setup, klik Semiempiris, Klik <i>Metode :
Extended Hückel</i>, Klik <i>Options</i>,
set Multiplicity = 1, Total Charge = 0.</span></div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; margin-left: 63.8pt; mso-list: l0 level1 lfo4; tab-stops: list -106.35pt 63.8pt; text-align: justify; text-indent: -21.25pt;">
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><i>4.<span style="font: 7.0pt "Times New Roman";">
</span></i>Klik
<i>File</i>, Klik <i>Start log</i>, tulis nama file = air.log (masukkan ke direktori kerja
anda).</span></div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; margin-left: 63.8pt; mso-list: l0 level1 lfo4; tab-stops: list -106.35pt 63.8pt; text-align: justify; text-indent: -21.25pt;">
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">5.<span style="font: 7.0pt "Times New Roman";"> </span>Klik <i>Compute</i>, Klik <i>Geometry Optimization</i>,
set RMS : 0.0001 kcal/mol dan 5000 cycles. Klik <i>Ok</i>.</span></div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; margin-left: 63.8pt; mso-list: l0 level1 lfo4; tab-stops: list -106.35pt 63.8pt; text-align: justify; text-indent: -21.25pt;">
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">6.<span style="font: 7.0pt "Times New Roman";"> </span>Klik <i>File</i>, Klik <i>Stop log</i>.</span></div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; margin-left: 63.8pt; mso-list: l0 level1 lfo4; tab-stops: list -106.35pt 63.8pt; text-align: justify; text-indent: -21.25pt;">
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">7.<span style="font: 7.0pt "Times New Roman";"> </span>Buka Notepad dan Klik <i>File</i>, Klik <i>Open</i> dan buka file air.log.</span></div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; margin-left: 63.8pt; mso-list: l0 level1 lfo4; tab-stops: list -106.35pt 63.8pt; text-align: justify; text-indent: -21.25pt;">
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">8.<span style="font: 7.0pt "Times New Roman";"> </span></span><span style="height: 21px; left: 0px; margin-left: 513px; margin-top: 21px; mso-ignore: vglayout; position: absolute; width: 21px; z-index: 251656704;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><img height="21" src="file:///C:/DOCUME%7E1/TUNASA%7E1/LOCALS%7E1/Temp/msohtmlclip1/01/clip_image001.gif" width="21" /></span></span><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Catatlah energi molekul dan momen
dipolnya.</span></div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; margin-left: 63.8pt; mso-list: l0 level1 lfo4; tab-stops: list -106.35pt 63.8pt; text-align: justify; text-indent: -21.25pt;">
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">9.<span style="font: 7.0pt "Times New Roman";"> </span>Kembali ke windows Hyperchem. Klik
Select, Klik Atom. Klik . Klik atom H kemudian O dan dicatat jarak
ikatnya. Berikutnya Klik atom hidrogen satunya dan catat sudutnya. </span></div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; margin-left: 63.8pt; mso-list: l0 level1 lfo4; tab-stops: list -106.35pt 63.8pt; text-align: justify; text-indent: -21.25pt;">
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">10.<span style="font: 7.0pt "Times New Roman";"> </span>Langkah 3 - 9 diulangi untuk metode
semiempiris yang lain.</span></div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; margin-left: 42.55pt; tab-stops: list 42.55pt; text-align: justify;">
</div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; margin-left: 42.55pt; tab-stops: list 42.55pt; text-align: justify;">
</div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; margin-left: 42.55pt; tab-stops: list 42.55pt; text-align: justify;">
</div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; tab-stops: list 42.55pt; text-align: justify;">
</div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; margin-left: 42.55pt; mso-list: l1 level1 lfo5; tab-stops: list 42.55pt; text-align: justify; text-indent: 0in;">
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><b>B.<span style="font: 7.0pt "Times New Roman";">
</span></b><b>Menghitung parameter NH<sub>3</sub></b></span></div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; margin-left: 42.55pt; tab-stops: list 42.55pt; text-align: justify;">
<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Langkah-langkah
yang dilakukan sama dengan A, tetapi elemen dipilih untuk molekul NH<sub>3</sub>.</span></div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; margin-left: 42.55pt; tab-stops: list 42.55pt; text-align: justify;">
</div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; margin-left: 42.55pt; tab-stops: list 42.55pt; text-align: justify;">
<b><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">C. Menghitung jarak ikatan hidrogen
antara NH<sub>3</sub> dan H<sub>2</sub>O</span></b></div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; margin-left: 42.55pt; tab-stops: list 42.55pt; text-align: justify;">
<span style="height: 22px; left: 0px; margin-left: 378px; margin-top: 117px; mso-ignore: vglayout; position: absolute; width: 21px; z-index: 251657728;"><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;"><img height="22" src="file:///C:/DOCUME%7E1/TUNASA%7E1/LOCALS%7E1/Temp/msohtmlclip1/01/clip_image002.gif" width="21" /></span></span><span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">Dari parameter yang diperoleh,
dipilih metode yang menghasilkan jarak ikatan yang mendekati eksperimen.
Kemudian anda mengulangi langkah A dan B dengan menggunakan metode semiempiris
yang telah terpilih. Simpanlah masing-masing file dengan air1.hin dan amo1.hin.
Kemudian anda sedang dalam keadaan membuka file amo1.hin. Klik <i>Open</i>, Klik <i>Merge</i>, Klik air1.hin. Klik <i>Select</i>,
Klik <i>Molecules</i>, Klik , Klik molekul air, jalan prosedur A(5).
Klik kanan mouse pada molekul air. Jalankan prosedur A(5). Klik <i>Display</i>, Klik <i>Recompute H bond</i>. Seleksilah atom yang berikatan hidrogen. Catat
jarak ikatannya.</span></div>
<div class="MsoNormal" style="line-height: 150%; margin-left: 42.55pt; tab-stops: list 42.55pt; text-align: justify;">
</div>
<br />akademik_HIMKAhttp://www.blogger.com/profile/00366070787523409197noreply@blogger.com0