Istilah-istilah pada kimia komputasi
- Molecular modeling merupakan suatu metode untuk merancang dan menganalisis struktur dan sifat-sifat molekul tertentu dengan mengunakan teknik kimia komputasional dan teknik visualisasi grafis yang bertujuan untuk menyediakan struktur geometri tiga dimensi yang sesuai dengan parameter kondisi yang telah ditentukan. (Leach, 2001).
- Molecular docking merupakan suatu teknik yang digunakan untuk mempelajari interaksi yang terjadi dari suatu kompleks molekul. Molecular docking dapat memprediksikan orientasi dari suatu molekul ke molekul yang lain ketika berikatan membentuk kompleks yang stabil. (Funkhouser, 2007).
- Molecular Operating Environment (MOE) dikembangkan Chemical Computing Group (www.chemcomp.com). MOE selain menawarkan fasilitas yang cukup lengkap juga user-friendly sehingga cocok digunakan dalam pembelajaran. Hanya saja aplikasi kimia komputasi yang user-friendly biasanya mahal sehingga alasan efisiensi biaya tidak lagi relevan.
- OV (Orbital Viewer) adalah perangkat lunak gratis untuk menggambarkan orbital atom dan molekul, membuat animasi maupun untuk melihat penampang lintang (struktur dalam) orbital. Dapat pula dibuat gambar 3D (yang dapat dilihat dengan kacamata 3D sperti yang digunakan untuk melihat sinetron 3D). (Modul Struktur dan Kereaktifan Kimia Anorganik, Dr. Ismunandar)
- ab initio berasal dari bahasa latin yang diberikan untuk menandai perhitungan yang diturunkan secara langsung dari prinsip-prinsip teoritis, tanpa memasukkan data eksperimen. Ab initio mengacu pada perhitungan mekanika kuantum melalui beberapa pendekatan matematis, seperti penggunaan persamaan yang disederhanakan (Born Oppenheimer approximation) atau pendekatan untuk penyelesaian persamaan differensial. (PENGANTAR KIMIA KOMPUTASI, Dr. Harno Dwi Pranowo, M.Si)
- Kimia kuantum adalah sebuah aplikasi mekanika kuantum pada kimia. Kimia kuantum memungkinkan kita untuk memahami dan memprediksi struktur, sifat dan mekanisme reaksi dari berbagai bahan.
- BS (Balls & Sticks) adalah perangkat lunak gratis untuk menggambarkan struktur kimia, terutama kristal, dalam 3D dan dapat menghasilkan gambar bitmap yang dapat disalin ke clipboard dan ditempelkan (paste) di dokumen pengolah kata (Word misalnya).
Ab initio
Istilah
“Ab initio” adalah bahasa latin untuk “dari awal”. Nama ini diberikan
kepada perhitungan yang berasal langsung dari prinsip-prinsip teoritis,
tanpa masuknya data eksperimen. Sebagian besar saat ini adalah mengacu
ke perhitungan perkiraan kuantum mekanik. Perkiraan yang dibuat biasanya
perkiraan matematika, seperti menggunakan bentuk fungsional sederhana
untuk fungsi atau mendapatkan solusi perkiraan untuk sebuah persamaan
diferensial.
Jenis
yang paling umum perhitungan ab initio ini disebut perhitungan Hartree
Fock (disingkat HF), di mana pendekatan utama disebut pendekatan
lapangan pusat. Ini berarti bahwa tolakan Coulomb elektron-elektron
tidak secara khusus diperhitungkan. Namun, itu efek bersih adalah
termasuk dalam perhitungan. Ini adalah variasi perhitungan, yang berarti
bahwa energi perkiraan dihitung semua sama atau lebih besar daripada
energi yang tepat. Energi dihitung biasanya dalam satuan yang disebut
Hartrees (1 H = 27,2114 eV). Karena pendekatan lapangan pusat, energi
dari perhitungan HF selalu lebih besar daripada energi yang tepat dan
cenderung ke nilai membatasi disebut batas Hartree Fock.
Pendekatan
kedua dalam perhitungan HF adalah bahwa fungsi gelombang harus
dijelaskan oleh beberapa bentuk fungsional, yang hanya diketahui secara
tepat untuk satu beberapa sistem elektron. Fungsi yang paling sering
digunakan adalah kombinasi linier dari orbital tipe Slater exp (-ax)
atau jenis orbital Gaussian exp (-ax ^ 2), disingkat STO dan GTO. Fungsi
gelombang terbentuk dari kombinasi linier dari orbital atom atau lebih
sering dari kombinasi linear dari fungsi dasar. Karena pendekatan ini,
perhitungan HF paling memberikan energi dihitung lebih besar dari batas
Fock Hartree. Himpunan tepat fungsi dasar yang digunakan sering
ditentukan oleh singkatan, seperti STO-3G atau 6-311 g + + **.
Sejumlah
jenis perhitungan dimulai dengan perhitungan HF kemudian benar untuk
tolakan elektron-elektron eksplisit, disebut sebagai korelasi. Beberapa
metode ini Mohlar-Plesset teori perturbasi (MPN, dimana n adalah urutan
koreksi), yang Generalized Valence Bond (GVB) metode, Multi-Konfigurasi
Self Konsisten Lapangan (MCSCF), Interaksi konfigurasi (CI) dan teori
Cluster Ditambah (CC). Sebagai kelompok, metode ini disebut sebagai
perhitungan berkorelasi.
Sebuah
metode, yang menghindari membuat kesalahan HF di tempat pertama disebut
Quantum Monte Carlo (QMC). Ada beberapa rasa QMC .. variasional, difusi
dan fungsi Green. Metode-metode ini bekerja dengan fungsi gelombang dan
mengevaluasi secara eksplisit berkorelasi integral numerik menggunakan
integrasi Monte Carlo. Perhitungan ini bisa sangat memakan waktu, tetapi
mereka mungkin metode yang paling akurat dikenal saat ini.
Metode
ab initio adalah alternatif teori kerapatan fungsional (DFT), di mana
total energi dinyatakan dalam total kepadatan elektron, bukan fungsi
gelombang. Dalam jenis ini perhitungan, ada Hamilton dan perkiraan
ekspresi perkiraan untuk kepadatan total elektron.
Sisi baik metode ab initio adalah bahwa mereka akhirnya bertemu
dengan solusi yang tepat, setelah semua perkiraan yang dibuat cukup
kecil di besarnya. Namun, konvergensi ini tidak montonic. Kadang-kadang,
perhitungan terkecil memberikan hasil yang terbaik untuk properti
tertentu.
Sisi
buruk dari metode ab initio adalah bahwa mereka mahal. Metode ini
sering mengambil sejumlah besar waktu komputer cpu, memori dan ruang
disk. Metode skala HF sebagai N 4, dimana
N merupakan jumlah fungsi dasar, sehingga perhitungan dua kali lebih
besar membutuhkan 16 kali lebih lama untuk menyelesaikan. perhitungan
Korelasi sering skala jauh lebih buruk dari ini. Dalam prakteknya,
solusi sangat akurat hanya dapat diperoleh ketika molekul berisi
setengah lusin elektron atau kurang.
Secara
umum, perhitungan ab initio kualitatif memberikan hasil yang sangat
baik dan dapat memberikan hasil kuantitatif semakin akurat sebagai
molekul yang dimaksud menjadi lebih kecil.
Semiempirical
Semiempirical
perhitungan ditetapkan dengan struktur umum yang sama sebagai
perhitungan HF. Dalam kerangka ini, potongan informasi tertentu, seperti
dua integral elektron, yang didekati atau sama sekali dihilangkan.
Dalam rangka untuk mengoreksi kesalahan diperkenalkan dengan
menghilangkan bagian dari perhitungan, metode ini parameter, dengan
melakukan suaian kurva dalam beberapa parameter atau nomor, untuk
memberikan kesepakatan yang terbaik dengan data eksperimen.
Sisi baik dari perhitungan semiempirical adalah bahwa mereka jauh lebih cepat daripada perhitungan ab initio.
Sisi
buruk dari perhitungan semiempirical adalah bahwa hasilnya bisa tidak
menentu. Jika molekul yang sedang dihitung mirip dengan molekul dalam
basis data yang digunakan untuk parameterisasi metode, maka hasilnya
mungkin akan sangat baik. Jika molekul yang dihitung secara signifikan
berbeda dari apa pun di set parameterisasi, jawaban mungkin sangat
miskin.
perhitungan
Semiempirical telah sangat sukses dalam deskripsi kimia organik, di
mana hanya ada beberapa elemen digunakan secara luas dan molekul yang
ukuran sedang. Namun, metode semiempirical telah dirancang khusus untuk
deskripsi kimia anorganik juga.
Pemodelan solid state
Struktur
elektronik dari kristal tak terbatas didefinisikan oleh struktur plot
band, yang memberikan energi orbital elektron untuk setiap titik di
k-ruang, yang disebut zona Brillouin. Sejak ab initio dan perhitungan
semiempirical hasil energi orbital, mereka dapat diterapkan untuk band
perhitungan struktur. Namun, jika memakan waktu untuk menghitung energi
untuk molekul, itu bahkan lebih memakan waktu untuk menghitung energi
untuk daftar poin di zona Brillouin.
perhitungan
struktur Band telah dilakukan untuk sistem yang sangat rumit, namun
perangkat lunak belum cukup otomatis atau cukup cepat sehingga siapa pun
tidak struktur band santai. Jika Anda ingin melakukan perhitungan
struktur band, Anda sebaiknya berharap untuk menempatkan banyak waktu
dalam usaha Anda.
Mekanika molekul
Jika
molekul terlalu besar untuk secara efektif menggunakan pengobatan
semiempirical, masih mungkin untuk model perilaku itu dengan menghindari
mekanika kuantum benar-benar. Metode disebut sebagai mekanika molekul
membentuk ekspresi aljabar sederhana untuk energi total senyawa, tanpa
keharusan untuk menghitung fungsi gelombang atau kepadatan total
elektron. Ekspresi energi terdiri dari persamaan klasik sederhana,
seperti persamaan osilator harmonik dalam rangka untuk menggambarkan
energi yang berkaitan dengan ikatan peregangan, membungkuk, rotasi dan
gaya antarmolekul, seperti interaksi van der Waals dan ikatan hidrogen.
Semua konstanta dalam persamaan ini harus diperoleh dari data percobaan
atau perhitungan ab initio.
Dalam
metode mekanika molekul, basis data senyawa yang digunakan untuk
parameterisasi metode (satu set parameter dan fungsi yang disebut medan
gaya) sangat penting untuk keberhasilan itu. Dimana sebagai metode
semiempirical mungkin parameter terhadap satu set molekul organik,
sebuah metode mekanika molekul mungkin parameter terhadap kelas khusus
molekul, seperti protein. Medan gaya seperti ini hanya akan diharapkan
memiliki relevansi untuk menjelaskan protein lain.
Sisi
baik dari mekanika molekuler adalah bahwa hal itu memungkinkan
pemodelan molekul besar, seperti protein dan segmen dari DNA, sehingga
alat utama ahli biokimia komputasi.
Sisi
buruk dari mekanika molekul adalah bahwa ada banyak sifat-sifat kimia
yang bahkan tidak didefinisikan dalam metode ini, seperti keadaan
tereksitasi elektronik. Dalam rangka untuk bekerja dengan sistem yang
sangat besar dan rumit, sering molekul mekanik paket perangkat lunak
yang paling kuat dan paling mudah untuk menggunakan antarmuka grafis.
Karena itu, mekanik kadang-kadang digunakan karena mudah, tetapi belum
tentu cara yang baik untuk menjelaskan sistem.
Dinamika molekul
dinamika
molekul terdiri dari memeriksa perilaku tergantung waktu dari molekul,
seperti gerak getaran atau gerak Brown. Hal ini paling sering dilakukan
dalam sebuah tulisan mekanik klasik mirip dengan perhitungan mekanika
molekul.
Penerapan
dinamika molekuler untuk pelarut / sistem terlarut memungkinkan
perhitungan properti seperti koefisien difusi atau fungsi distribusi
radial untuk digunakan dalam perawatan mekanik statistik. Biasanya skema
perhitungan pelarut / zat terlarut adalah bahwa jumlah molekul (mungkin
1000) diberikan beberapa posisi awal dan kecepatan. posisi baru
menghitung waktu kecil kemudian berdasarkan gerakan ini dan proses ini
itterated untuk ribuan langkah untuk membawa sistem untuk keseimbangan
dan memberikan gambaran statistik yang baik dari fungsi distribusi
radial.
Dalam
rangka untuk menganalisa getaran molekul tunggal, banyak dinamika
langkah-langkah yang dilakukan, maka data tersebut Fourier berubah
menjadi domain frekuensi. Sebuah puncak yang diberikan dapat dipilih dan
diubah kembali ke domain waktu, untuk melihat apa gerakan pada
frekuensi yang terlihat seperti.
Statistik Mekanika
Mekanika
statistika adalah matematika berarti mengekstrapolasi sifat
termodinamika bahan curah dari deskripsi molekul material. Banyak
mekanika statistik masih pada tahap kertas dan pensil teori, karena
mekanika kuantum tidak dapat menyelesaikan persamaan Schrödinger tepat
lagi, mekanika statistik tidak benar-benar memiliki bahkan titik awal
yang baik untuk perlakuan yang benar-benar ketat. Mekanika statistika
perhitungan sering ditempelkan ke akhir perhitungan inito ab untuk
properti fasa gas. Untuk properti fasa terkondensasi, sering molekul
dinamika perhitungan diperlukan dalam rangka untuk melakukan percobaan
komputasi.
Termodinamika
Termodinamika
adalah salah satu deskripsi paling baik dikembangkan kimia matematika.
Sangat sering setiap pengobatan termodinamika yang tersisa untuk pena
dan kertas kerja sepele karena banyak aspek kimia begitu akurat
digambarkan dengan ekspresi matematika yang sangat sederhana.
Struktur-Properti Hubungan
Struktur-properti
hubungan yang kualitatif atau kuantitatif didefinisikan secara empiris
hubungan antara struktur molekul dan sifat diamati. Dalam beberapa kasus
ini mungkin tampak duplikat hasil mekanik statistik, namun sistem
struktur-properti hubungan tidak perlu didasarkan pada prinsip-prinsip
teoritis ketat.
Kasus
yang paling sederhana hubungan struktur-properti aturan jempol
kualitatif. Misalnya, kimia polimer yang berpengalaman mungkin dapat
memprediksi apakah polimer akan halus atau rapuh berdasarkan geometri
dan ikatan monomer.
Ketika
struktur-properti hubungan yang disebutkan dalam literatur saat ini,
biasanya menyiratkan hubungan matematis kuantitatif. Hubungan ini paling
sering diperoleh dengan menggunakan software curve fitting untuk
menemukan kombinasi linear dari sifat molekul, yang paling mereproduksi
properti yang diinginkan. Sifat-sifat molekul biasanya diperoleh dari
perhitungan pemodelan molekul. deskriptor molekul lain seperti berat
molekul atau deskripsi topologi juga digunakan.
Ketika
properti yang dijelaskan adalah properti fisik, seperti titik didih,
ini disebut sebagai Kuantitatif Struktur-Properti Relationship (QSPR).
Ketika properti yang dijelaskan adalah jenis aktivitas biologis (seperti
aktivitas obat), ini disebut sebagai Kuantitatif Struktur-Aktivitas
Relationship (HKSA).
Perhitungan Simbolik
perhitungan
simbolik dilakukan bila sistem yang terlalu besar untuk sebuah
deskripsi atom-by-atom masih layak pada setiap tingkat pendekatan.
Sebuah contoh mungkin gambaran membran dengan menjelaskan lipid individu
sebagai perwakilan beberapa poligon dengan beberapa ekspresi untuk
energi interaksi. Pengobatan semacam ini digunakan untuk biokimia
komputasi dan bahkan mikrobiologi.
Kecerdasan Buatan
Teknik
diciptakan oleh ilmuwan komputer tertarik dalam kecerdasan buatan telah
diterapkan sebagian besar berupa rancangan obat dalam beberapa tahun
terakhir. Metode ini juga pergi dengan nama De Novo atau desain obat rasional. Skenario
umum adalah bahwa beberapa situs fungsional telah diidentifikasi dan
diinginkan untuk datang dengan struktur molekul yang akan berinteraksi
dengan situs bahwa untuk menghalangi fungsi itu. Daripada memiliki
seorang ahli kimia mencoba ratusan atau ribuan kemungkinan dengan
program mekanika molekul, mekanika molekul dibangun ke dalam program
kecerdasan buatan, yang mencoba jumlah besar “masuk akal” kemungkinan
dalam fasion otomatis. Jumlah teknik untuk menggambarkan “cerdas” bagian
dari operasi ini begitu beragam yang tidak mungkin untuk membuat
generalisasi tentang bagaimana hal ini diimplementasikan dalam program.
Bagaimana melakukan proyek riset komputasi
Bila
menggunakan kimia komputasi untuk menjawab pertanyaan kimia, masalah
jelas adalah bahwa Anda perlu tahu bagaimana menggunakan perangkat
lunak. Permasalahan yang terjawab adalah bahwa Anda perlu untuk
mengetahui seberapa baik jawabannya akan menjadi. Berikut adalah daftar
periksa untuk diikuti.
Apa yang Anda ingin tahu? Seberapa akurat? Mengapa? Jika Anda tidak dapat menjawab pertanyaan-pertanyaan, maka Anda bahkan tidak memiliki proyek penelitian belum.
Seberapa akurat Anda memprediksi jawabannya akan? Dalam
kimia analitik, Anda melakukan sejumlah pengukuran identik kemudian
bekerja keluar kesalahan dari deviasi standar. Dengan percobaan
komputasi, melakukan hal yang sama harus selalu memberikan hasil yang
sama persis. Cara yang Anda memperkirakan kesalahan Anda adalah untuk
membandingkan sejumlah perhitungan mirip dengan jawaban eksperimental.
Ada artikel dan kompilasi dari studi ini. Jika tidak ada, Anda akan
perlu menebak metode mana yang harus masuk akal, didasarkan pada asumsi
itu kemudian melakukan penelitian sendiri, sebelum Anda dapat
menerapkannya pada Anda tidak diketahui dan punya ide seberapa bagus
perhitungannya. Ketika seseorang hanya memberitahu Anda dari atas kepala
mereka metode apa yang digunakan, mereka juga memiliki jumlah wajar
dari jenis informasi hafal, atau mereka tidak tahu apa yang mereka
bicarakan. Waspadalah terhadap seseorang yang memberitahu Anda sebuah
program yang diberikan adalah baik hanya karena itu adalah satu-satunya
mereka tahu bagaimana menggunakan, bukan mendasarkan jawaban mereka pada
kualitas hasil.
Berapa lama Anda berharap untuk mengambil? Jika
dunia yang sempurna, Anda akan memberitahu PC Anda (suara masukan tentu
saja) untuk memberikan solusi yang tepat untuk persamaan Schrödinger
dan melanjutkan hidup Anda. Namun, sering kali perhitungan ab initio
akan memakan sehingga waktu yang dibutuhkan waktu satu dekade untuk
melakukan perhitungan tunggal, jika Anda bahkan memiliki mesin dengan
cukup memori dan ruang disk. Namun, sejumlah metode yang ada karena
setiap yang terbaik untuk situasi tertentu. Caranya adalah dengan
menentukan mana yang terbaik untuk proyek Anda. Sekali lagi, jawabannya
adalah untuk melihat ke dalam literatur dan melihat berapa lama
masing-masing diperlukan. Jika satu-satunya yang Anda tahu adalah
bagaimana skala perhitungan, melakukan perhitungan sederhana yang
mungkin kemudian gunakan persamaan skala untuk memperkirakan berapa lama
waktu yang diperlukan untuk melakukan semacam perhitungan bahwa Anda
telah diprediksi akan memberikan akurasi yang diinginkan.
Apa perkiraan sedang dilakukan? Yang signifikan? Ini
adalah bagaimana Anda menghindari tampak seperti orang bodoh yang
lengkap, ketika anda berhasil melakukan perhitungan yang sampah lengkap.
Sebuah contoh akan mencoba untuk mencari tahu tentang gerak getaran
yang sangat anharmonic, ketika perhitungan menggunakan pendekatan
osilator harmonik.
Setelah
Anda akhirnya menjawab semua pertanyaan ini, Anda siap untuk
benar-benar melakukan perhitungan. Sekarang Anda harus menentukan
software apa yang tersedia, berapa biayanya dan bagaimana
menggunakannya. Perhatikan bahwa dua program dari jenis yang sama (ab
initio yaitu) dapat menghitung sifat-sifat yang berbeda, sehingga Anda
harus memastikan program ini tidak persis apa yang Anda inginkan.
Ketika
Anda sedang belajar bagaimana menggunakan sebuah program, Anda dapat
mencoba untuk melakukan puluhan perhitungan yang akan gagal karena Anda
dibangun masukan salah. Jangan gunakan molekul proyek Anda untuk
melakukan hal ini. Membuat semua kesalahan Anda dengan sesuatu yang
sangat mudah, seperti molekul air. Dengan begitu Anda tidak membuang
sejumlah besar waktu.
Visualisasi
visualisasi
data adalah proses menampilkan informasi dalam jenis representasi
piktorial atau grafis. Sejumlah program komputer yang sekarang tersedia
untuk menerapkan skema pewarnaan data atau bekerja dengan tiga dimensi
representasi.
Informasi lebih lanjut
Untuk gambaran tingkat pengantar kimia komputasi lihat
GH Grant, WG Richards “Komputasi Kimia” Oxford (1995)
GH Grant, WG Richards “Komputasi Kimia” Oxford (1995)
Penjelasan lebih rinci tentang teknik kimia komputasi umum yang terkandung dalam
AR Leach “Prinsip Pemodelan Molekul dan Aplikasi” Addison Wesley Longman (1996)
F. Jensen “Pengantar Komputasi Kimia” John Wiley & Sons (1999)
AR Leach “Prinsip Pemodelan Molekul dan Aplikasi” Addison Wesley Longman (1996)
F. Jensen “Pengantar Komputasi Kimia” John Wiley & Sons (1999)
Ada
banyak buku pada prinsip-prinsip mekanika kuantum dan setiap teks kimia
fisik memiliki pengobatan pengantar. Pekerjaan yang saya listing di
sini adalah volume dua set dengan masing-masing bab dipecah menjadi
bagian dasar dan lanjutan sehingga sangat baik untuk pengguna menengah
dan lanjutan.
C. Cohen-Tannoudji, B. Diu, F. Laloe “Quantum Mechanics Volume I & II” Wiley-InterScience (1977)
C. Cohen-Tannoudji, B. Diu, F. Laloe “Quantum Mechanics Volume I & II” Wiley-InterScience (1977)
Untuk suatu pendahuluan kimia kuantum melihat
DA McQuarrie “Quantum Kimia” Buku Science University (1983)
DA McQuarrie “Quantum Kimia” Buku Science University (1983)
Sebuah tingkat pascasarjana teks pada kimia kuantum
DI Levine “Kimia kuantum” Prentice Hall (1991)
DI Levine “Kimia kuantum” Prentice Hall (1991)
Seorang sarjana lulusan maju atau teks pada kimia kuantum
PW Atkins, RS Friedman “Mekanika Quantum Molecular” Oxford (1997)
PW Atkins, RS Friedman “Mekanika Quantum Molecular” Oxford (1997)
Untuk
metode Monte Carlo kuantum, urutan buku berikut ini dengan menggunakan
ISBN 981-02-0322-5 karena judul terdaftar salah ‘Buku di Print di.
BL Hammond, WA Lester, Jr, Reynolds PJ “Monte Carlo Metode dalam Ab initio Quantum Chemistry” Dunia Ilmiah (1994)
BL Hammond, WA Lester, Jr, Reynolds PJ “Monte Carlo Metode dalam Ab initio Quantum Chemistry” Dunia Ilmiah (1994)
Sebuah artikel review yang baik tentang teori kerapatan fungsional
T. Ziegler Chem. Wahyu 91, 651-667 (1991)
T. Ziegler Chem. Wahyu 91, 651-667 (1991)
Untuk teori kerapatan fungsional lihat
RG Parr, W. Yang “Fungsi Kepadatan Teori Atom dan Molekul” Oxford (1989)
RG Parr, W. Yang “Fungsi Kepadatan Teori Atom dan Molekul” Oxford (1989)
Untuk pemahaman dasar pemodelan solid state lihat
R. Hoffmann “Solids dan Permukaan: Chemist Lihat A Bonding di Struktur Extended”, VCH (1988)
R. Hoffmann “Solids dan Permukaan: Chemist Lihat A Bonding di Struktur Extended”, VCH (1988)
Untuk penjelasan tingkat lulusan mekanika statistik lihat
DA McQuarrie “Mekanika statistik” Harper Collins (1976)
DA McQuarrie “Mekanika statistik” Harper Collins (1976)
Teks kimia fisik akan mendapatkan sebuah gambaran termodinamika tapi saya akan merekomendasikan
DI Levine “Kimia Fisik” McGraw Hill (1995)
DI Levine “Kimia Fisik” McGraw Hill (1995)
Lain pengenalan bagus untuk kimia komputasi
S. Profeta, Jr “Kirk-Othmer Ensiklopedia Tambahan Teknologi Kimia”, 315 John Wiley & Sons (1998).
S. Profeta, Jr “Kirk-Othmer Ensiklopedia Tambahan Teknologi Kimia”, 315 John Wiley & Sons (1998).
Ada
daftar komprehensif dari semua modeling software yang tersedia molekul
dan menggunakan data struktural, bebas atau tidak, dalam lampiran 2 dari
“Tinjauan dalam Volume Kimia Komputasi 6″ Ed. KB Lipkowitz dan Boyd DB, VCH (1995)
“Tinjauan dalam Volume Kimia Komputasi 6″ Ed. KB Lipkowitz dan Boyd DB, VCH (1995)
Ada menulis pada desain komputer dibantu obat di
gopher: / / www.ccl.net/00/documents/drug.design.guide
gopher: / / www.ccl.net/00/documents/drug.design.guide
Matematika tantangan dari kimia teori / komputasi
http://www.nap.edu/readingroom/books/mctcc/index.html
http://www.nap.edu/readingroom/books/mctcc/index.html
Sebuah teks online di pemodelan molekul menggunakan mekanika molekul
http://www.netsci.org/Science/Compchem/feature01.html
http://www.netsci.org/Science/Compchem/feature01.html
Sebuah Primer Komputasi Kimia
http://www.sdsc.edu/GatherScatter/GSwinter96/taylor1.html
http://www.sdsc.edu/GatherScatter/GSwinter96/taylor1.html
Sebuah teks online pada kimia komputasi
http://www.cryst.bbk.ac.uk/ ~ ubcg8ab/course/os_molf.html
http://www.cryst.bbk.ac.uk/ ~ ubcg8ab/course/os_molf.html
Lain teks online di kimia kuantum
http://zopyros.ccqc.uga.edu/Docs/Knowledge/Fundamental_Theory/quantrev/node1.html
http://zopyros.ccqc.uga.edu/Docs/Knowledge/Fundamental_Theory/quantrev/node1.html
Pengantar online untuk mekanika kuantum di
http://cmcind.far.ruu.nl/webcmc/qm/home.html
http://cmcind.far.ruu.nl/webcmc/qm/home.html
Kutipan: Artikel ini awalnya diumumkan di web. Hal ini sekarang muncul di cetak di D. Young, Chem. Aust. 11, 5 (1998).
Versi
yang diperluas dari artikel ini akan diterbitkan di “Komputasi Kimia:
Panduan Praktis untuk Menerapkan Teknik ke Real Masalah Dunia” oleh
David Young, yang akan tersedia dari John Wiley & Sons pada musim
semi 2001.
ENGLISH VERSION
Introduction to Computational Chemistry
David Young
Cytoclonal Pharmaceutics Inc.
Cytoclonal Pharmaceutics Inc.
Tidak ada komentar:
Posting Komentar